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Andrés Niño diviso por primera vez tierras cuzcatlecas en el

Golfo de Fonseca.

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Pedro de Alvarado y sus hermanos Gonzalo. Jorge, Diego y Gómez Invaden Cuscatlán atravesando el río Paz y la Hachadura.

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Alvarado partió para Cuscatlán con un ejército compuesto de 250 españoles y de casi 6,000 "indios amigos o aliados", a quienes se habían sumado varios cientos de

guerreros Tlaxcaltecas y cakchiqueles.

Bajaron hacia la costa del océano Pacífico, destruyendo a su paso el pueblo de Izcuintepec (Escuintla), que era un centro menor pipil.

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De acuerdo con la cronología del historiador Jorge Lardé y Larín, Alvarado entró al actual territorio salvadoreño el 6 de junio de 1524, cruzando el río Paz en la costa del departamento de Ahuachapán.

Pasó por dos pueblos pipiles, Mopicalco y Acatepeque, cuyos habitantes huyeron ante el avance de tan numeroso ejército

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El 8 de junio Alvarado llegó a Acajutla, la que llamó "Acaxual" en su informe a Cortés.

El ichcahuipilli brindaba buena protección contra las flechas, pero el que utilizaron los guerreros pipiles aquel día en Acajutla impedía sus movimientos a tal grado que los que se caían ni se podían levantar, presa fácil de la infantería española.

Pedro de Alvarado fue alcanzado por una flecha que le fracturó el fémur y le dejó una herida que se mantuvo infectada durante ocho meses, sin duda a causa de las pequeñas astillas de obsidiana de la punta de flecha cuando estalló contra el hueso.

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Las fuerzas españolas avanzaron hacia Tacuzcalco, donde los pipiles* presentaron un poderoso ejército de aproximadamente 5000 guerreros. Estos guerreros esperaban a los invasores en formación y estaban armados en su mayoría con largas *lanzas de 30 palmos, todas enarboladas, bajo el mando del príncipe **Atonal*.

Aunque Pedro de Alvarado pudo desplazarse penosamente a caballo para dar órdenes en la batalla, finalmente confió la dirección del combate a Gonzalo. Las tropas españolas se organizaron de la siguiente manera:

- Gómez de Alvarado lideraba el flanco izquierdo con 30 caballos.

- Gonzalo de Alvarado estaba al mando del flanco derecho con 20 hombres a caballo.

- Jorge de Alvarado lideraba el grueso de la tropa en el centro.

Una vez más, los españoles barrieron del campo de batalla a los guerreros nahuas. Según el relato del conquistador, "aquí se hizo una matanza y castigo muy grande". Tras la batalla, Gonzalo de Alvarado persiguió y mató al rebelde Atonal con dos disparos cuando intentaba huir del lugar.

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Dos días después, las fuerzas españolas se dirigieron a Mihuatlán y luego a Atehuan o Ateos (actualmente un cantón del municipio Sacacoyo). Allí, recibieron mensajeros de los señores del Señorío de Cuzcatlán. Finalmente, el 17 de junio de 1524, entraron en la ciudad de Cuzcatlán.

A pesar de que los conquistadores fueron recibidos pacíficamente por el rey Atágat, conocido como Atlácatl “El Viejo”, los actos de pillaje no se evitaron. Esto provocó que casi todos los habitantes huyeran hacia las montañas cercanas. Según las palabras de Pedro de Alvarado, “hallaron todo el pueblo alzado, y mientras nos aposentábamos, no quedó hombre de ellos en el pueblo, que todos se fueron a las sierras”. Los españoles interpretaron esto como un acto de rebeldía y esa misma noche, Pedro de Alvarado emitió la orden de matar a la nobleza de Cuzcatlán, lo que resultó en la ejecución del rey y su corte

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Pedro de Alvarado, con la firme intención de atravesar la estación de lluvias en Cuzcatlán, se encontró en una situación precaria debido a la falta de provisiones. Por lo tanto, el 4 de julio de 1524, decidió abandonar las inmediaciones de la ciudad fortaleza de los nahuas para regresar a la ciudad de Santiago de los Caballeros, ubicada en el territorio de sus aliados cakchiqueles.

En sus propias palabras, Alvarado expresó su deseo de volver a Guatemala y pacificar la tierra que había dejado atrás (los pipiles de Cuzcatlán). Sin embargo, a pesar de sus esfuerzos, no logró atraer a los pipiles al servicio de su majestad. La costa sur por la que viajó estaba llena de montañas y sierras, donde los habitantes encontraban refugio. Su hermano Gonzalo lo acompañó en todo momento

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En la segunda semana de febrero de 1525 ocurrieron dos sucesos importantes: Pedro de Alvarado sanó de la herida que lo tenía postrado y recibió un refuerzo de 200 soldados españoles procedentes de México. El adelantado preparó una expedición fundadora hacia Cuzcatlán y puso al frente de ella a su hermano el capitán Gonzalo de Alvarado. En esta campaña figuraban también: Diego de Holguín, Francisco Díaz, Alonso de Oliveiros y muchos colonizadores españoles.

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La empresa fue coronada con éxito hacia el 11 de abril de 1525 y en las inmendaciones del fuerte indiano de Cuzcatlin (actual municipio de Antiguo Cuzcatlán), Gonzalo de Alvarado fundó una colonia, con el título de villa y el nombre de San Salvador, bajo deseos de su hermano Pedro por haber salvado su vida en las batallas del año precedente.

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Conforme a la usanza de la época, en nombre y representación de su hermano el capitán Pedro de Alvarado, Gonzalo eligió como alcalde de esta nueva villa a Diego Holguín. Esta primera villa fue destruida por los Cuzcatlecos un año después, obligando a sus pobladores a salir del lugar.

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No fue hasta el año 1528, que definitivamente se fundó la nueva Villa de San Salvador en el lugar conocido como La Bermuda en las cercanías de Suchitoto, esta vez por Diego de Alvarado, primo de Pedro de Alvarado, bajo la advocación de la Santísima Trinidad.

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El territorio actual de El Salvador es pacificado. Por orden del rey de España Carlos V, el territorio actual del país quedó dividido en: la Alcaldía mayor de Sonsonate (formada por los actuales departamentos de Ahuachapán y Sonsonate), la Alcaldía Mayor de San Salvador (formada por toda la zona central y el departamento de Santa Ana) y la Alcaldía Mayor de San Miguel (formada por toda la zona oriental).