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La integración del sistema digestivo se da cuando todas sus partes se van uniendo y coordinando desde la formación del tubo digestivo primitivo hasta que los órganos alcanzan su posición y función correcta. Durante este proceso intervienen movimientos de rotación del intestino, la conexión con el hígado, el páncreas y la vesícula biliar, además de la vascularización que asegura el aporte de nutrientes y oxígeno.

Las anomalías congénitas aparecen cuando algo de este desarrollo se interrumpe o no ocurre como debería. Por ejemplo, puede haber atresias donde un segmento del intestino queda cerrado, estenosis que lo estrechan, malrotaciones que alteran la posición del intestino o incluso hernias diafragmáticas que hacen que parte del aparato digestivo termine en el tórax. Estas alteraciones pueden tener repercusiones importantes en la alimentación y en la vida del recién nacido, y por eso es clave entenderlas desde su origen embrionario.

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Tiene su origen en el endodermo del intestino primitivo que se forma durante la 4° semana de la gestación. El tubo endodérmico se divide en tres regiones, el intestino posterior el epitelio y sus glándulas provienen de el endodermo.

Todos los derivados del intestino posterior están vascularizados por la arteria mesentérica inferior.

Los derivados del Intestino posterior son:

El epitelio de la vejiga y la mayor parte de la uretra

Parte superior del conducto anal, colon descendente, colon transverso, el recto.

Cloaca: cavidad revestida por endodermo que esta en contacto ectodermo de la superficie a través de la membrana cloacal.

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El intestino medio aparece entre la cuarta y sexta semana de desarrollo, formando un asa intestinal que sale temporalmente al cordón umbilical porque la cavidad abdominal aún es pequeña, a esto se le llama hernia fisiológica.

El asa se divide en:

Porción caudal: Corresponde a la porción inferior del intestino medio, que dará lugar a parte del intestino grueso.

De la parte inferior de está asa se origina el íleon terminal, el ciego con el apéndice, el colon ascendente y los dos tercios iniciales del colon transverso.

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El intestino primitivo aparece tras el plegamiento cefálica y lateral del embrión, se encuentra cerrado en su extremo craneal por la membrana orofaringea y las señales moleculares (como Sonic Hedgehod, BMP, etc) regulan su diferenciación y delimitación con respecto al intestino medio y posterior.

Da origen a estructuras clave del aparato digestivo y respiratorio como la faringe, laringe, vías respiratorias inferiores, esófago, estomago, duodeno, hígado, vías biliares y páncreas.

Estos órganos, excepto la faringe, las vías respiratorias inferiores y parte del esófago, están irrigados por el tronco celiaco, que es la arteria característica del intestino anterior.

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El intestino medio aparece entre la 4.ª y 6.ª semana de desarrollo embrionario. Se origina del asa intestinal que temporalmente se hernia hacia el cordón umbilical, ya que la cavidad abdominal es aún muy pequeña para contenerlo.

La porción superior del intestino medio corresponde a la parte craneal del asa intestinal. Esta porción dará origen a:

La mayor parte del duodeno (excepto su porción inicial).

El yeyuno.

Parte del íleon.

Todos estos segmentos se irrigan principalmente por la arteria mesentérica superior, característica de los derivados del intestino medio.