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As clorófitas compartilham características importantes com as plantas terrestres (embriófitas), como a presença de clorofilas a e b erva de carboidratos em forma de amido, parede celular constituída por celulose e o padrão de organização dos microtúbulos associados aos corpos basais(centríolos) na base dos flagelos. Tais semelhanças, associadas a dados moleculares, fazem das algas verdes e das plantas terrestres um grupo monofilético, conhecido como viridófitas.

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O grupo dos Heterokonta ou sub-reino Stramenopiles é monofilético e abrange os grupos dos oomicetos  e das algas crisofíceas, diatomáceas e pardas, além de outros grupos menores não abordados aqui. Os heterocontas possuem a característica comum de apresentarem em alguma parte do seu ciclo de vida um par de flagelos, sendo um flagelo longo com mastigonemas, tipo pinado, e outro menor sem mastigonemas, tipo chicote.

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As Rhodophyta são preferencialmente bentônicas e têm estrutura bastante complexa, visto que, apenas poucas rodófitas são unicelulares e microscópicas. As algas vermelhas são quase sempre filamentosas, mas os filamentos podem se agregar, formando uma estrutura pseudoparenquimatosa ou até mesmo laminar. Poucos gêneros, como Porphyra, são laminares, cujas lâminas são formadas por células justapostas interligadas por ligações celulares primárias ou secundárias.

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O grupo dos Heterokonta ou sub-reino Stramenopiles é monofilético e abrange os grupos dos oomicetos e das algas crisofíceas, diatomáceas e pardas, além de outros grupos menores não abordados aqui. Os heterocontas possuem a característica comum de apresentarem em alguma parte do seu ciclo de vida um par de flagelos, sendo um flagelo longo com mastigonemas, tipo pinado, e outro menor sem mastigonemas, tipo chicote.

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O grupo dos Heterokonta ou sub-reino Stramenopiles é monofilético e abrange os grupos dos oomicetos e das algas crisofíceas, diatomáceas e pardas, além de outros grupos menores não abordados aqui. Os heterocontas possuem a característica comum de apresentarem em alguma parte do seu ciclo de vida um par de flagelos, sendo um flagelo longo com mastigonemas, tipo pinado, e outro menor sem mastigonemas, tipo chicote.

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As euglenophytas, pertencentes ao gênero Euglena, são algas formadas por uma única célula (organismos unicelulares), existindo espécies clorofiladas (autotróficas / fotossintetizantes) e aclorofiladas (heterotróficas).
Em geral, esses organismos habitam macro e microecossistemas dulcícolas (de água doce), que possibilitam locomoção e absorção de nutrientes dissolvidos no meio, tendo como principal substância de reserva o paramilo (carboidrato)

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Juntamente com os protozoários ciliados e com os Apicomplexa, os dinoflagelados constituem o grupo dos Alveolata, que são caracterizados pela presença de vesículas sob a membrana plasmática.  Os Dinophyta (dinoflagelados) são em sua maioria seres unicelulares e biflagelados, sendo que a disposição de seus dois flagelos é característica do grupo. Um dos flagelos encontra-se orientado transversalmente, inserido em um sulco equatorial que circunda toda a célula partindo sempre em direção ao lado esquerdo

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Charophyta é um agrupamento parafilético de organismos eucariotas foto-autotróficos de água doce, do grupo das algas verdes, que inclui os taxa filogeneticamente mais próximos das plantas terrestres (as Embryophyta). O agrupamento inclui uma grande diversidade de organismos, entre as quais as algas ramosas (Charophyceae), as algas conjugadas (Zygnematophyceae) e alguns géneros muito isolados. A circunscrição taxonómica do grupo é ocasionalmente restringida às Charales, que são monofiléticas.

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-Filo chlorophyta: Uso na área alimentícia
-Filo phaeophyta: Uso na área alimentícia
-Filo Rhodophyta: Uso na área alimentícia (sushi), Agar(cultivo de bactérias)
-Filo Bacillariophyta: Usado para formação de  polidores, confecção de filtros e isolantes
- ficocolóides são polissacarídeos coloidais extraídos de algas
- Os alginatos são utilizados como emulsificantes, estabilizantes e gelificante. São utilizados em tintas para tecidos e produção de espuma de cerveja.
- Os carragenanos são substâncias encontradas na parede celular de algumas algas vermelhas. São utilizados na indústria farmacêutica, alimentícia e cosmética.