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Carlos Linneo​ ​ fue un científico, naturalista, botánico y zoólogo sueco. Considerado el creador de la clasificación de los seres vivos o taxonomía, Linneo desarrolló un sistema de nomenclatura binomial (1731) que se convertiría en clásico, basado en la utilización de un primer término

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Haeckel creo el tercer reino llamado Protista, donde ubicó a todos los organismos unicelulares.
Instrumentos a utilizar: Microscopio, hace lo invisible visible al ojo humano. Fue diseñado y utilizado por Galileo en el siglo XVII y popularizado por Robert Hooke (1635-1701).

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Observo 520 especies de animales y las organizó en dos categorías basadas en las semejanzas en estructura y apariencia.

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Durante las siguientes décadas los científicos descubrieron que existen diferencias entre las células de los organismos: unos poseen núcleos y organelos (células eucariotas), mientras que otros carecen de ellos (células procariontes). Así Copeland propuso un nuevo reino, el Monera, donde agrupo a las bacterias.

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Whittaker propuso un esquema de clasificación con cinco reinos al considerar los siguientes criterios: el tipo celular (eucariontes y procariontes), el nivel de organización (unicelular o pluricelular), el tipo de nutrición (autótrofa y heterótrofa), y el tipo de reproducción (sexual o asexual).
Propone el reino Fungi como el quinto. En la década de 1980 las biólogas estadounidenses Lynn Margulis y Karlene V. Schwartz sugieren una modificación a la propuesta de Whittaker, modificando el nombre de reino Protista por Protoctista.

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A Lynn Margulis se la considera una de las principales figuras dentro del campo de la evolución biológica. En 1985, en colaboración con Karlene V. Schwartz mantuvieron el sistema de cinco reinos de Whittaker con algunas modificaciones, nombrándolos de la siguiente manera: Monera, Protoctistas, Hongos, Plantas y Animales. El nuevo reino protoctista incluía a los organismos protistas ( unicelulares eucariotas) como a los pluricelulares de organización simple, como las algas.

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Woese es el creador de la nueva taxonomía molecular basada en la comparación entre especies de la llamada secuencia del ARN mitocondrial 16, que comparten todos los seres vivos del planeta y que apenas ha sufrido cambios desde la aparición en la tierra de las primeras formas de vida microbiológicas. Sus análisis filogenéticos en 1977 le llevaron al descubrimiento de un nuevo dominio, el Archaea.