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El uso de secuencias de ADN permite cuantificar las diferencias entre especies y determinar la cercanía de una especie con otra y así mismo la distancia entre ellas. Por ejemplo una de las pruebas reproductivas y genéticas mejor conocidas es el entrecruzamiento

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Las pruebas bioquímicas y moleculares permiten saber que tan cercana es la relación
Por ejemplo el citocromo c, enzima para la respiración en animales que a pesar de sus variaciones en los aminoácidos no cambio a través del tiempo

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La anatomía comparada es un área de la biología que estudia las semejanzas y diferencias de las estructuras morfológicas entre los organismos. Esta disciplina permitió inferir el parentesco entre especies y también la relación entre el ambiente y las adaptaciones de los organismos.

Los órganos o estructuras morfológicas de origen evolutivo común, se les denomina órganos homólogos.

Los órganos análogos
Son estructuras funcionalmente similares, pero que difieren en su origen embrionario y en sus características estructurales.

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Los fósiles dan registro de especies que desaparecieron con los cambios terrestres y dan sentido a las diversas investigaciones sobre el avance de la vida y los seres que habitan o habitaron el planeta. Ya que podemos encontrar en el registro fósil, evidencias de las modificaciones corporales que han sufrido los ejemplares de un grupo a lo largo de millones de años.
Los restos más antiguos de vida en nuestro planeta tienen alrededor de 3.200 millones de años.

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La evolución  se relaciona con el clima y las fuerzas geológicas especialmente la tectónica de placas, ya que ayudan a explicar muchas de las relaciones de ancestros y la distribución  geográfica que se observa hoy en día  en los fósiles y en los sistemas vivos como resultado  de la derivada continental.

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En este modelo de árbol, los grupos de especies comparten  características que estaban presentes en su ultimo ancestro común. Se puede utilizar esta idea para rastrear y reconstruir  las relaciones de parentesco entre los organismos con base en sus características compartidas

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Éstos, a diferencia de los órganos análogos, son aquellos con una estructura igual o similar, que realiza una función diferente.
Un ejemplo serían el ala de los murciélagos y las aletas de los delfínes, con estructuras similares pero con una función totalmente diferente

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Los órganos análogos son aquellos que cumplen la misma función sin importar que tengan la misma estructura.
Un ejemplo de ésto son las garras de los topos, usadas para cavar, mientas que el grillo topo hace lo mismo pero de estructuras diferentes

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Son grupos de especies parecidas que llegaron a habitar en lugares relacionados por su proximidad pasada o actual

Ejemplo: los Pinzones de las islas Galápagos

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La embriología comparada es la encargada de estudiar a diferentes embriones a través de las distintas fases que experimentan en su embriogénesis

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Son aquellos órganos que no tienen ninguna función significativa debido a la evolución de las especies.

Ejemplo: Las Muelas del juicio ya que son dientes que no cumplen ninguna función y solo perjudican