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El ARNt es una clase de ARN que participa en la síntesis de proteínas. Cada molécula de ARNt tiene dos áreas importantes: una región de trinucleótidos denominada anticodón y una región donde se une un aminoácido específico. el ARNt tiene como función encargarse de llevar los aminoácidos a la máquina de la traducción y se une de manera complementaria con el ARNm de forma que los aminoácidos son unidos para formar una proteína.

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La apoenzima es la parte proteica de una enzima, desprovista de los cofactores o coenzima que puedan ser necesarios para que la enzima sea funcione activamente, también catalíticamente inactiva; cuando se le une la coenzima o cofactor adecuados, constituye la holoenzima y la holoenzima se forma cuando la apoenzima se une al cofactor y se vuelve catalíticamente activa y busca el promotor examinando 2000 pares de bases por cada tres segundos.

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Alfa (α): es la subunidad encargada de ser un tipo de andamio para armar o formar las demás subunidades, también es la que logra interactuar con muchas de las proteínas que regulan la transcripción.

Beta’ (β’) : esta subunidad se encara de ayudar a que se de la unión con el ADN

Beta (β): esta es la subunidad que contiene una parte del sitio activo de la enzima

Omega (ω): la función de esta subunidad no se ha caracterizado bien.

Sigma (σ): existen varias que sirve para da inicio de la transcripción, se disocia una vez iniciada la transcripción. También sirve para el reconocimiento del promotor y formación del ensamblaje del complejo.

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1-Para iniciar las transcripción se necesita relajar el nucleosoma, esto se hace acetilando el extremo amino terminal de la lisina con una acetiltransferasa y así iniciar la transcripción.

2-Primero se forma el complejo iniciador que se da por la unión de la ARN polimerasa II con varios factores de transcripción generales.

3-El promotor es la secuencia de ADN en donde se inicia la transcripción, también se conoce como caja TATA, el cual se caracteriza por tener grandes cantidades de adenina y timina.

4-El factor de transcripción 2D se une a la caja TATA por el TBP y al complejo formado se le une la ARN polimerasa II, también se une el factor de transcripción H que separa las hebras de ADN.

5-Luego con un ATP se fosforila el complejo formado, después la ARN polimerasa II sintetiza una pequeña cadena de ARN y así se inicia la transición de la iniciación a la elongación.

6-La elongación comienza cuando se separan las hebras de ADN y se forma la burbuja de transcripción.

7-La ARN polimerasa II se separa de los factores de transcripción y comienza a desplazarse en sentido 5´ a 3´ realizando las transcripción de los nucleótidos.

8- En la última fase se alcanza la terminación la cual es una secuencia que se encuentra en el ADN, el ARN polimerasa interrumpe la síntesis de ARN y se separa del ADN, posteriormente el ADN recupera la doble hélice.

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Es el hecho de que un solo aminoácido puede ser codificado por uno o más codones diferentes, los codones que codifican un mismo aminoácido en muchos casos comparten los dos primeros nucleótidos con lo que se minimiza el efecto de las mutaciones. En estos casos una mutación en la tercera posición del codón no cambia el aminoácido codificado denominándose mutación silenciosa.

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Tiene una estructura en forma de trébol que contienes varios brazos formados por una vuelta o una vuelta con tallo unido con puentes de hidrógeno. La región de las dos hebras en cada brazo forma una hélice corta, apilada y derecha, parecida a la del ADN de doble hebra.
El extremo 5´y la región cercana al extremo 3´ de la molécula de ARNt tienen bases apareadas y forman el tallo aceptor o tallo de aminoácidos. El aminoácido se une de forma covalente al ARNt en el extremo 3´d este tallo.

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El brazo de una hebra opuesto al tallo aceptor se llama bucle anticodón, este contiene el anticodón que es la secuencia de tres bases que se une a un codón complementario en el ARNm. El brazo de la molecula de ARNt que contienen al anticodón se llama brazo de anticodón. Los nombres  de dos de los brazos de la molecula de ARNt se deben a los nucleótidos modificados que estan en ellos. Uno de los brazos se llama brazo TψC y contiene ribotimidilato (T)  y seudouridilato (ψ) seguidos de citidilato (C). Los residuos de dihidrouridilato (D)  dan su nombre al brazo D. Las moléculas de ARNt tienen tambien un brazo variable entre el brazo de anticodón  y el brazo TψC.
La función de los brazos del anticodón es que el ARNt se logre unir a un aminoácido específico, según la secuencia de cada codón del ARNm.

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Un anticodón es un grupo de tres nucleótidos que se empareja con otros tres nucleótidos del codón del ARN mensajero (ARNm) correspondiente. El anticodón está ubicado en el extremo del “bucle” de una molécula de ARN de transferencia (ARNt).

Durante el proceso de traducción  los anticodones son los encargados de aparearse con su codón correspondiente, con el fin de que el ARNt pueda incorporar un aminoácido a la cadena polipeptídica creciente.

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AUG es la secuencia que codifica la metionina, aminoácido inicial

Las secuencias terminales son UAA, UAG y UGA.

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Los aminoácidos se unen mediante enlaces peptídicos los cuales se forman cuando el aminoácido que se encuentra en el  sitio P y se une con el aminoácido que se encuentra en el sitio A del complejo ribosómico formado por las subunidades ribosómicas mayor y menor.

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Iniciación.

1-El ARNm se une a la subunidad menor de los ribosomas. Luego, se une el aminoacil-ARNt iniciador y la subunidad mayor ribosomal para formar el complejo de iniciación.

2-El aminoacil-ARNt iniciador se aparea con el primer codón del mRNA para iniciar la síntesis de proteínas (AUG).

Elongación.

3-Unión del segundo aminoacil-ARNt en el sitio A.

4-Se desacopla el ARNt del AA en el sitio P para la formación del enlace peptídico entre grupo COOH de la metionina y el grupo amino del siguiente aminoácido.

5-El ARNm o el ribosoma se traslada una posición (un codón) liberándose el ARNt de la metionina.

6-El complejo ARNt con ambos aa se traslada al sitio P dejando libre al sitio A para la siguiente unión de un aminoacil-ARNt.

Finalización.

7-Cuando el sitio A llega a un codón de finalización (UAA, UAG, UGA), se libera el péptido y se disocia el ribosoma del ARNm.

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ARN polimerasa I: Transcribe genes que codifican  moléculas grandes del ARN ribosómico (genes de clase I).

ARN polimerasa II: Transcribe los genes que codifican proteínas, y algunos algunos que codifican moléculas pequeñas de ARN ( genes de clase II).

ARN polimerasa III: Transcribe los genes que codifican varias moléculas pequeñas de ARN, incluyendo ARNt y 5S ARNr (genes de clase III).

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El aminoácido se une con el ARNt y realiza un tipo de búsqueda o rastreo en la cadena de ADN para encontrar el codón inicial (AUG-metionina), así se logra la unión con el anticodón del ARNt, de esta forma se dará inicio a la traducción; este proceso se da con ayuda de enzimas aminoacil-ARNt sintetasas.

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Ocurre mediante la reacción del grupo carboxilo de un aminoácido con uno de los hidrógenos del grupo amino del otro aminoácido

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Sitio A: Sitio de entrada aminoacil-ARNt, en este se da la elongación.

Sitio P: Sitio donde se aloja el peptidil-ARNt, en este se uno el ARNt iniciador, se da la formación de enlaces peptídicos.

Sitio E: Sitio de salida del ARNt una vez descargado el aminoácido, antes de que se de la traduccion del siguiente codon debe separarse el ARNt desaminoacilado y el peptidil ARNt debe transferirse totalmente del Sitio A al sitio P.

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Transcripción de ADN; traducción de ARN o síntesis de proteínas; explicado