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Integrantes:
Garcia GaytanJahily Monserrat
Gomez Romero Carmen Alondra
Lazaro Palacios Yezmin Helen
Romero De la Cruz Oscar Omar
Peña Chavez Manuel Alejandro
Edy Manuel Salvador Martinez

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Bioinformatica: una ciencia de naturaleza interdisciplinaria, cuya historia se partió en dos después que por vez primera se secuenció en forma completa una proteína, la insulina, por parte de Frederick Sanger y sus colegas en la Universidad de Cambridge, durante la década comprendida entre 1945 y 1955.

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Watson y Crick proponen la estructura de doble hélice del ADN.

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La mayoría de las publicaciones científicas empiezan a escribir la historia de la Bioinformática con este hallazgo. Fue fruto de un biólogo y un físico, Watson y Crick, en 1953, y de las investigaciones previas realizadas por Rosalind Franklin en la Unidad de Biofísica del Consejo de Investigación Médica del King’s College.

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El bioquímico británico Frederick Sanger llevó a cabo un descubrimiento que llevaría a la comunidad científica a discernir todo lo que el ADN y ARN tenían que contarnos. Fue la secuenciación de la insulina, que llevó a otros profesionales a desarrollar sus propios métodos para secuenciar moléculas.

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Relacion entre la Biologia y Ciencias de la informacion. Debido al constante impulso del hombre por saber de qué estamos hechos, y fue con la secuenciación de la primera proteína por Margaret Oakley Dayhoff.
Se creó la necesidad de recopilar y organizar toda la información generada a partir de dichos proyectos de secuenciación, surgiendo así, la primera base de datos con información biológica llamada Protein Data Bank (PDB).

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Sanger, obtiene el premio nobel de química debido al descubrimiento de la existencia de la estructura primaria de cada proteína, con el cual define el rumbo de la bioinformática, pues se hizo evidente la necesidad de interpretar la información contenida en las secuencias de ADN, ARN y proteínas.

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Jack Kilby construye el primer circuito integrado en los laboratorios de la empresa Texas Instruments.

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The MagLab has seven user facilities located across our three campuses. Every year more than 1,800 researchers use our facilities - most at no cost to them - and publish more than 400 peer-reviewed publications.

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Los científicos se encontraron con una disyuntiva. Tenían ante sí una ingente cantidad de datos sobre química de proteínas, pero para encontrar las respuestas que buscaban debían ir más allá de su propia área de trabajo. La necesidad les llevó a emplear la Informática y las Ciencias Matemáticas para buscar patrones en la información de corte biológico.

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Pehr Edman consiguió automatizar el proceso de reacción de degradación de Edman con su "sequenator", lo cual hizo que muchos grupos de biología molecular hicieran crecer la cada vez mayor biblioteca de secuencias de proteínas.

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Margaret Oakley Dayhoff. Esta doctora daría vida en 1965 al Atlas of Protein Sequencias, un catálogo con las secuencias de proteínas que se habían descubierto y que se revisaba periódicamente para mantenerlo actualizado.

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Origen del termino.
Se relacionaba con las aplicaciones computacionales diseñadas para manejar y analizar secuencias de origen biológico, principalmente secuencias de proteínas o del ADN proveniente de diversos organismos.

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Invención de la computadora inventadas en el marco de programas de investigación para diseñar armamento bélico durante la segunda guerra mundial, los computadores sólo estaban al alcance de los investigadores a principios de la década de 1970, aunque con una disponibilidad muy limitada, 15% del total de centros de investigación y universidades de los Estados Unidos de América.

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Needleman y Wunsch, desarrollaron los modelos de alineamiento global para pares de cadenas.

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Se crea la primera molécula de ADN recombinante (Paul Berg, 1972), E. M. Southern desarrolla la técnica Southern blot de localización de secuencias específicas de ADN

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Protein Data Bank (PDB), uno de los primeros
sistemas de almacenamiento electrónico, y el desarrollo del SWISSPROT que es una de las bases de datos con
información estructural sobre proteínas mas completa y una de las más consultadas a través de Internet.

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Comienza la secuenciación de ADN y el desarrollo de software para analizarlo (F. Sanger, software de R. Staden.)

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Se publica la primera secuencia de genes completa de un organismo, el fago Φ-X174 (5.386 pares de bases que codifican 9 proteínas).

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La Dra. Margaret Oakley Dayhoff, creó la primera base de datos computadorizada de la que se tiene noticia, con secuencias de ácidos nucleicos y de proteínas, en un computador casero al que los usuarios externos podían conectarse por vía telefónica.

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Protein Sequence Database (PSD) era la base de datos más
grande del mundo, con más de 2’000,000 de nucleótidos
secuenciados, con sus respectivas referencias y anota-
ciones19

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El crecimiento exponencial de los datos, que han pasado de 606 secuencias de ADN almacenadas en 1982 a unos 17.5 millones hoy en día, fue impulsado por el desarrollo de la técnica "Reacción en Cadena de la Polimerasa" (PCR) y por el mejoramiento instrumental de equipos como los secuenciadores automáticos de alto rendimiento, los cuales a su vez contribuyeron al desarrollo de proyectos de secuenciación como el del genoma humano.

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Se crea el Human Genome Project (Proyecto Genoma Humano).

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Se desarrolla el BLAST, que es la más conocida herramienta de biología computacional para determinar la similitud de secuencias arbitrarias con otras secuencias de proteínas o de ADN.

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El trabajo de Margaret Oakley Dayhoff impulsó la generación de bases de datos primarias como GenBank, FASTA y BLAST (Basic Local Alignment Tool). Mientras GenBank almacenaba y catalogaba las secuencias de ADN y de proteínas, BLAST permitía comparar con mayor rapidez que su predecesor FASTA las secuencias de interés contra cada una de las secuencias contenidas dentro de la enorme base de datos.

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Con la creación del consorcio para la ejecución del proyecto de secuenciación del genoma humano (Human Genome, HUGO), se inició la era genómica. Siendo la decodificación del genoma humano un proyecto tan ambicioso, que otros consorcios se crearon con el fin de secuenciar los primeros genomas no virales.

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Brown en el año 2000, definió la bioinformática como «el uso de computadores para la adquisición, manejo y análisis de la información biológica», de modo que la contextualiza «en la intersección de la biología molecular, la biología computacional, la medicina clínica, las bases de datos informáticas, el Internet y el análisis de secuencia»

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Se creo el DDBJ

El banco de datos de Japón da inicio a la constricción de redes de comunidades de la bioinformática que permitirán canalizar y difundir los desarrollados en el campo para permitir una comunicación a nivel mundial entre los investigadores como BIONET

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PIR-PSD se asoció con EBI (European Bioinformatics Institute) y SIB (Swiss Institute of Bioinformatics), para dar origen a una única base de datos de secuencia y función de proteínas, conocida en la actualidad como UniProt

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Se han desarrollado múltiples proyectos de secuenciación de genomas de diferentes organismos, completándose en el año 2003 el Human Genome Project.

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Se completa el proyecto HapMap (catalogación de variaciones genéticas en el ser humano).

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Se logra la secuencia completa del genoma humano y se da inicio al mapeo del proteoma.

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La aplicación de la Bioinformática en la Genómica funcional: una nueva arma en la lucha contra la resistencia a antibióticos.

Las nuevas herramientas en software permiten ahora ver un aspecto más dinámico de dichos genomas y las secuencias de sus genes, su transcripción, su traducción e incluso las interacciones entre ellos, esto último se conoce como genómica funcional.

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Barreto Hernández, E. (2002). 8101Nf70RMÁTICA: HISTORIA Y PERSRECTIVAS FUTURAS. http://repositorio.colciencias.gov.co. Recuperado 2022, de http://repositorio.colciencias.gov.co/bitstream/handle/11146/2233/2002-V20-N3-Articulos-Art%203.6.pdf;jsessionid=E024705518CCA8C106FA5029C579ED83?sequence=1

Delfino Garcia-Alonso. (2018). La Bioinformática, una disciplina en auge en el mundo. 2022, Enero 26, Conogasi.org Sitio web: https://conogasi.org/articulos/la-bioinformatica-una-disciplina-en-auge-en-el-mundo/

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Autor: Dr. Edgar Rubén Mendieta Condado. Laboratorio de Biotecnología y Biocomputación.