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O pão foi "descoberto" no Egito poe folta de 6000 A.C. sem querer, quando em um dia quente e umido a massa foi esquecida ao ar livre por tempo de mais, isso fez com que as leveduras selvagens e as bacterias começarem a devorar os açucares presentes na massa e liberando CO2 fazendo a massa crescer.

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Na Idade Média, a fermentação passou a ser um processo essencial para a produção de pão, vinho e cerveja, alimentos básicos da dieta europeia. Mesmo que eles não entendessem a ação dos microrganismos, os medievais dominavam técnicas transmitidas de geração em geração. Mosteiros tiveram papel central nesse desenvolvimento, padronizando receitas e melhorando a qualidade das bebidas fermentadas.

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Anton van Leeuwenhoek, utilizando microscópios que ele mesmo desenvolveu, foi o primeiro a observar e descrever microrganismos. Em 1674, registrou a presença de “animálculos” na água e em outros materiais, marcando o início da microbiologia. Essa descoberta revelou a existência de um mundo invisível, fundamental para a compreensão posterior da fermentação e das doenças.

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No século XIX, o cientista francês Louis Pasteur revolucionou a compreensão da fermentação. Ele provou que este não era apenas um processo químico, mas sim um fenômeno biológico causado pela ação de microrganismos vivos, como as leveduras, que transformam açúcares em álcool. Sua pesquisa não só resolveu problemas na produção de vinho e cerveja, levando à invenção da pasteurização, como também foi fundamental para estabelecer a Teoria Microbiana e a ciência da Microbiologia.

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No século XX, a fermentação passou de uma arte para uma ciência de engenharia, com o desenvolvimento de biorreatores e o isolamento de cepas de microrganismos mais eficientes. Isso permitiu a produção industrial em massa de antibióticos (como a penicilina), vitaminas e aminoácidos. Já no século XXI, a fermentação biotecnológica (ou fermentação de precisão) utiliza engenharia genética para programar leveduras e bactérias a produzirem ingredientes complexos, como proteínas de leite e carne, combustíveis e novos materiais, revolucionando a indústria alimentar e farmacêutica.