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Los hongos son organismos eucariotas heterótrofos que dependen de compuestos orgánicos para obtener energía, ya que carecen de clorofila y no realizan fotosíntesis. Su metabolismo se distingue por la digestión extracelular, proceso en el que secretan enzimas capaces de degradar macromoléculas en nutrientes simples que luego son absorbidos por sus hifas. Según las condiciones del entorno, pueden generar energía a través de la respiración aeróbica, altamente eficiente en la producción de ATP, o recurrir a la fermentación en ausencia de oxígeno, como ocurre en las levaduras. Esta versatilidad metabólica les permite adaptarse a distintos ambientes y sustenta su importancia ecológica e industrial.

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Es fundamental para hongos saprótrofos, que se alimentan de materia muerta u orgánica compleja. Sin esta capacidad no podrían acceder a nutrientes.

Permite colonizar una gran variedad de sustratos (madera, hojas, suelo, residuos agrícolas, etc.).

También importante en contextos de biorremediación, compostaje, tratamiento de residuos, etc.

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Los hongos secretan enzimas al ambiente externo (exoenzimas) para degradar materiales orgánicos grandes (celulosa, hemicelulosa, lignina, proteínas, polisacáridos, lípidos) en moléculas más pequeñas.

Luego absorben estas moléculas pequeñas a través de su pared celular/hifas. (Kumar,2022)

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Cuando no hay oxígeno, algunos hongos (o situaciones con baja oxigenación) pueden metabolizar azúcares para obtener energía mediante fermentación. Producen productos como etanol, ácidos orgánicos, CO₂, etc.

No es tan eficiente en ATP como la respiración aeróbica, pero permite sobrevivir y crecer en ambientes donde el oxígeno es escaso o en competencia.

Permite supervivencia en ambientes anaeróbicos (o microaerófilos). Puede ayudar en la degradación de sustratos complejos cuando la respiración aeróbica está limitada.

Fermentaciones también pueden generar metabolitos secundarios útiles (por ejemplo, etanol, ácidos orgánicos) que pueden tener funciones ecológicas, competencia, defensa, etc. (Zhong,2016)

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La fermentación: el lado bueno de hongos y bacterias

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Respiración aeróbica: uso de oxígeno como aceptor final de electrones en la cadena de transporte de electrones (mitocondrial), produciendo ATP.

Respiración alternativa: cuando algunas partes del sistema respiratorio cambian (por ejemplo, usando oxidasa alternativa, o diferentes formas de deshidrogenasas NADH) para adaptarse al estrés, inhibiciones, presencia de toxinas, poca disponibilidad de oxígeno, etc. Algunos hongos tienen vías mezcladas, o pueden cambiar entre respiración aeróbica, alternativa, e incluso fermentación si es necesario.

Permite adaptación a cambios ambientales: si el oxígeno baja, los hongos pueden usar rutas alternativas para continuar respirando. También es importante para la eliminación de productos tóxicos internos, generar calor, mantener metabolismo basal. (Joseph-Horne,2001)