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El cuarto periodo (2005-2012) marca el reacomodo del conflicto armado. Se distingue por una ofensiva militar del Estado que alcanzó su máximo grado de eficiencia en la acción contrainsurgente, debilitando pero no doblegando la guerrilla, que incluso se reacomodó militarmente. Paralelamente se produce el fracaso de la negociación política con los grupos paramilitares, lo cual deriva en un rearme que viene acompañado de un violento reacomodo interno entre estructuras altamente fragmentadas, volátiles y cambiantes, fuertemente permeadas por el narcotráfico, más pragmáticas en su accionar criminal y más desafiantes frente al Estado. Fue un periodo determinante en el conflicto armado ya que a raiz de dichos enfrentamientos entre el estado y las FARC se ahondo mucho mas en la problemática social del pais, y se presentaron muchas trabas para el negociamiento entre el estado y dichos grupos al margen de la ley. El periodo del 2010 será también muy recordado para la diplomacia nacional. Y, paradójicamente, tanto por los momentos de tensión que hubo con Venezuela como por la posterior normalización de las relaciones con Rafael Correa, presidente de Ecuador, y con Hugo Chávez. Los acercamientos de los últimos meses fueron tan intensos como las tensiones que llegaron a alcanzar las denuncias del saliente gobierno de Álvaro Uribe sobre la presencia de miembros de las Farc en territorio de ese país. La economía creció casi un 5 por ciento y superó las proyecciones que se habían hecho.

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El tercer periodo (1996-2005) marca el umbral de recrudecimiento del conflicto armado. Se distingue por las expansiones simultáneas de las guerrillas y de los grupos paramilitares, la crisis y la recomposición del Estado en medio del conflicto armado y la radicalización política de la opinión pública hacia una solución militar del conflicto armado. La lucha contra el narcotráfico y su imbricación con la lucha contra el terrorismo renuevan las presiones internacionales que alimentan el conflicto armado, aunado a la expansión del narcotráfico y los cambios en su organización. Las FARC en su estrategia de guerra incluyeron en el 2006 un ataque sistemático contra la erradicación manual de cultivos ilícitos que en ese momento empezaba a probarse en Vista Hermosa (Meta). En la medición del 2011 del Sistema Integrado de Monitoreo de Cultivos Ilícitos (Simci), las Farc mantenían el monopolio del narcotráfico en 108 municipios de 17 departamentos, a través de 78 estructuras de su organización. Pero, mientras esto ocurría en la selva, otro grupo se había engendrado en Medellín. Las Autodefensas Unidas de Colombia (Auc) surgieron, según su justificación, como un grupo que frenaría los desmanes de las guerrillas. Los hermanos Castaño Gil las concentraron, pero además reclutaron para sus ejércitos ilegales a los peores asesinos, así como exintegrantes de la Fuerza Pública.
Entre el 2003 y el 2006, con el gobierno de Álvaro Uribe se da el desarme de las autodefensas. Sin embargo, a finales del 2007, varias investigaciones dejaron al descubierto que los jefes paramilitares seguían traficando y delinquiendo desde la cárcel. Así, el 13 de mayo del 2008, 14 de ellos fueron extraditados a Estados Unidos, donde continúan pagando condenas de hasta 30 años.

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El primer periodo (1958-1982): Marca la transición de la violencia bipartidista a la subversiva, caracterizada por la proliferación de las guerrillas que contrasta con el auge de la movilización social y la marginalidad del conflicto armado. Se presentaron disputas y persecuciones entre liberales y conservadores por el control de los puestos públicos, ideología, religión, poder, tenencia de la tierra, además de  las diferencias ocasionadas por el establecimiento del orden burgués. El Estado en Colombia había evolucionado hacia la forma unitaria y centralista a partir de la constitución de 1886. El estado carecía de los instrumentos suficientes para extender su acción a los distintos planos de la vida nacional y adecuarse a las nuevas situaciones derivadas del desarrollo de la economía y de la aparición
de nuevos grupos sociales. Aunque en su origen el conflicto armado en Colombia esta imbricado con la llamada violencia bipartidista y el frente nacional, también esta relacionado con las iniquidades que se derivaron de este ultimo. Los intentos fallidos de reforma a la estructura de tenencia de tierras, de una parte, y la limitada capacidad de incidencia de los actores disidentes que cuestionaban el acuerdo bipartidista, son, tal vez los fenómenos políticos mas notables asociados a esta época.

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Este se distingue por la proyección política, expansión territorial y crecimiento militar de las guerrillas, el surgimiento de los grupos paramilitares, la crisis y el colapso parcial del Estado, la irrupción y propagación del narcotráfico, el auge y declive de la Guerra Fría junto con el posicionamiento de el Narcotrafico en la agenda global, la nueva Constitución Política de 1991, y los procesos de paz y las reformas democráticas con resultados parciales y ambiguos. El narcotráfico creó prototipos de vida, permeó a las guerrillas, alimentó a los paramilitares, engendró un modelo sicarial ‘de exportación’, implantó en la mente de los jóvenes la consigna del ‘dinero fácil’, cambió los cuerpos de las mujeres, corrompió a la política, alienó a los más dignos integrantes de la Fuerza Pública y se convirtió en el vital combustible del conflicto armado. Las operaciones se centraron en el cartel de Medellín, batalla que terminó el 2 de diciembre de 1993, cuando cayó abatido Pablo Escobar. Posteriormente el de Cali (1995), el de la Costa (1997), el de Bogotá y luego el cartel del norte del Valle (2008). Pero toda la droga que llegaba a las manos de los narcos era cultivada en las zonas controladas por las Farc y las autodefensas.Allí se crearon microciudades en torno al negocio. En el 2000, la cifra de terrenos sembrados con coca sobrepasaba las 162.000 hectáreas, con epicentro en el departamento del Putumayo. Paralelo a los diálogos de paz que se adelantaban (1998-2002), el presidente Andrés Pastrana anunció la puesta en marcha de un Plan antidrogas apoyado por Estados Unidos. El 19 de diciembre del año 2000 entró en operación el Plan Colombia. Tras la ruptura de los diálogos, en la última conferencia (la 9.ª), las Farc definieron crear un modelo agrícola cocalero como respuesta a la política gubernamental antidrogas de erradicación forzosa, desarrollo alternativo y sustitución de cultivos.