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Prod attendue + bilan Act 5 Immuno Elisa

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Prod attendue + bilan Act 9 Ch2 Immuno Rôle pivot des LT4

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Prod attendue + bilan Act 8 Ch2 Immuno RIMC

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P4 Immuno Ch3 Elèves Connaissances et responsabilité humaine en matière de santé publique - 1SVT - 2020

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P4 Immuno - Ch2 Elèves Immunité adaptative - 1SVT - 2020

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Prod attendue + bilan Act 5 Ch3 Immuno résistance antibios

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Intro  Act 5 Ch3 Immuno résistance antibios

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Quiz Act 4 Ch3 Immuno mode d'action antibios

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Docs Act 4 Ch3 Immuno mode d'action antibios

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Prod attendue + bilan Act 2 Ch3 Immuno comparer les vaccins préventifs et thérapeutiques 

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Prod attendue + bilan Act 1 Ch3 Immuno vaccination préventive

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Docs Ch2 - V) Place du système immunitaire dans l’organisme

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MOOC - Neurosciences - Le double aveugle MCAM-4/9

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"C'est bien de se fier au bouche-à-oreille pour choisir un restaurant. Mais pour choisir un traitement contre le cancer, est-ce que c'est une bonne méthode ?" Théories du complot, médecines alternatives... C'est ce que décryptent les zététiciens. Brut a rencontré deux d'entre eux.

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Ep20 Les deux vitesses de la pensée, et le "Bullshitomètre"

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Vous rentrez chez vous après une dure nuit de garde à l'hôpital Foch, à Suresnes (dans les Hauts-de-Seine). Vous comptez vous détendre un peu devant une série quand vous voyez apparaître dans vos mails un message titré "urgent" de la part de votre collègue et ami, l'infectiologue Dr Ramoray.

Prendre un taxi pour se rendre chez RAMORAY

La concierge vient juste de sortir, il semblerait qu'elle ait fait tomber quelque chose de son sac !

Vous souvenez que votre collègue et ami habite au 3ème étage de cet immeuble.

"Cela fait un moment que M. Ramoray ne sort plus de chez lui, je vais faire quelques courses et à mon retour j'irai jeter un œil, j'ai sa clé de porte d'entrée dans mon sac. Bonne journée Mme Dupont".

C'était la concierge. Vite, cachez-vous quelques secondes le temps qu'elle sorte !

Visiblement, la concierge a un très bon goût pour la déco !

La concierge semble tenir pas mal de ragots dans ces petits carnets

grrrrrrr

Vous perdez du temps pour pas grand chose, là !

Vous êtes dans le hall d'entrée du Dr Ramoray.

Fouillez toutes les pièces pour collecter le plus d'informations possibles sur cette situation inquiétante...

L'enquête est terminée ? Vous avez tous les éléments en main ? Alors prenez le taxi pour rentrer à la maison

La porte est verrouillée !

"Monkey with her child", par Ohara Koson

Voici une peinture réalisée par le moine et peintre japonais Sengaï vers 1800 environ, peinture sans titre de 28 x 48 cm que certains ont appelé" L'Univers " ou " Cosmos " (L'originale est conservée à l'Idemitsu Museum de Tokyo).

Sengaï Gibon (1750-1837) faisait partie de l'école de Rinzai, l'une des trois écoles principales du bouddhisme zen au Japon, connue pour son enseignement très extrême, et s'installa au temple Shofukuji à Hakata, sur l'île de Kyushu, premier monastère de la secte zen fondé au Japon (en 1195). Là il développa une pratique de la peinture dans une grande discipline, reflétant sa compréhension profonde du zen. Pour lui, peindre était une chose d'un grand sérieux. "Chaque trait de mon pinceau est l'aboutissement de l'énergie la plus profonde de mon cœur", écrivait-il.

Sengaï fut très admiré, regardé et commenté au XXe siècle par Malraux ou Lévi-Strauss par exemple. Il fut surtout une figure majeure du Zen sur laquelle Daisetz Teitaro Suzuki a beaucoup écrit, ce qui joua sans conteste un rôle important dans l'intérêt porté au zen en Occident.

le code de la porte du labo de Ramoray.

Tu es bloqué(e) ?

Tu as besoin d'un peu d'aide ?

Tu es sûr d'avoir bien cherché, hein ?

Alors descends le curseur vers le bas de cette fenêtre pour trouver un petit coup de pouce.

Un indice pour trouver le code de la porte du labo de Ramoray ? Jette un œil dans sa valise !

Porte OUVERTE !

Il n'a pas l'air en forme ...

De toute évidence, c'est le chat de Ramoray ! (Il a l'air bien nourri ...).

Un bol de CASSIS ... On dirait que cela fut le dernier repas du pauvre homme ...
0 2 3 4 5 6 7 8 9
Tape (très) lentement le code de la valise.
0 2 3 4 5 6 7 8 9 0 2 3 4 5 6 7 8 9 0 2 3 4 5 6 7 8 9
De toute évidence, c'est le chat de Ramoray !

Un bol de CASSIS ... On dirait que cela fut le dernier repas du pauvre homme ...
0 2 3 4 5 6 7 8 9
De toute évidence, c'est le chat de Ramoray !

Un bol de CASSIS ... On dirait que cela fut le dernier repas du pauvre homme ...
0 2 3 4 5 6 7 8 9
Tu es bloqué(e) ?

Tu as besoin d'un peu d'aide ?

Tu es sûr d'avoir bien cherché, hein ?

Alors descends le curseur vers le bas de cette fenêtre pour trouver un petit coup de pouce.

Un indice pour trouver le code de la valise se trouve dans le coffre-fort de Ramoray !

Tape (très) lentement le code puis appuie sur "E" pour valider.

Ce n'est pas le bon code ?

Tu es bloqué(e) ?

Tu as besoin d'un peu d'aide ?

Tu es sûr d'avoir bien cherché, hein ?

Alors descends le curseur vers le bas de cette fenêtre pour trouver un petit coup de pouce.

Le code du coffre contient 7 chiffres !

De toute évidence, c'est le chat de Ramoray ! (Il a l'air bien nourri ...).

Un bol de CASSIS ... On dirait que cela fut le dernier repas du pauvre homme ...

Une astuce ?

Il est encore temps de chercher (et de trouver) tout(e) seul(e) !

Bientôt, tu ne pourra plus faire marche arrière !
Regarde bien la forme des antigènes ... n'as-tu pas comme un sentiment de déjà vu ?
Les anticorps, ou immunoglobulines, sont des protéines pouvant détecter les éléments étrangers pénétrant dans l'organisme. Les anticorps détectent en général des parties concrètes de ces corps étrangers, par exemple certaines protéines présentes à la surface des bactéries ou des virus, appelées " antigènes " (bactériens ou viraux). Les anticorps sont constitués de 4 parties, appelées chaînes. Les deux parties longues sont appelées chaînes lourdes (heavy ou H), les deux parties courtes sont appelées chaînes légères (light ou L). Ces parties sont reliées entre elles par des ponts disulfures, ce qui leur donne une forme de Y. Grâce à cette conformation, un anticorps peut se lier à deux antigènes en même temps. Les parties dites hypervariables des anticorps sont celles qui possèdent une grande variation d'acides-aminés. On peut les identifier sur Anagène/Geniegen par comparaison (avec discontinuité/alignement multiple) : ce sont les acides-aminés différents pour au moins 4 séquences comparées. Attention on peut comparer des séquences de chaines L seules ou H seules mais pas L et H entre elles.

Les anticorps, ou immunoglobulines, sont des protéines pouvant détecter les éléments étrangers pénétrant dans l'organisme. Les anticorps détectent en général des parties concrètes de ces corps étrangers, par exemple certaines protéines présentes à la surface des bactéries ou des virus, appelées " antigènes " (bactériens ou viraux).

Les anticorps sont constitués de 4 parties, appelées chaînes. Les deux parties longues sont appelées chaînes lourdes (heavy ou H), les deux parties courtes sont appelées chaînes légères (light ou L). Ces parties sont reliées entre elles par des ponts disulfures, ce qui leur donne une forme de Y. Grâce à cette conformation, un anticorps peut se lier à deux antigènes en même temps.

Les parties dites hypervariables des anticorps sont celles qui possèdent une grande variation d'acides-aminés. On peut les identifier sur Anagène/Geniegen par comparaison (avec discontinuité/alignement multiple) : ce sont les acides-aminés différents pour au moins 4 séquences comparées. Attention : on peut comparer des séquences de chaines L seules ou H seules mais pas L et H entre elles.

Du CASSIS ? Ramoray est addict !

Il faut allumer le PC pour savoir ce qu'elle contient.

Du CASSIS !

Tu as besoin d'un peu d'aide ?

Tu es sûr, hein ? Parce que c'est quand même plus amusant de résoudre les énigmes tout(e) seul(e) !

(Et tellement plus gratifiant !)

Définition : Le cassis est une baie qui est le fruit de l'arbrisseau Cassissier (Ribes nigrum). Cet arbrisseau de la famille des Grossulariacées, originaire de l'Europe septentrionale et du nord de l'Asie, pousse spontanément dans les régions montagneuses et froides de la zone paléoarctique. source : WIKIPEDIA

Prononciation : [ka-sis] Prononc. du s final. Prononcé ds la majorité des dict. (Passy 1914, Dub., Pt Rob., Pt Lar. 1968, Warn. 1968 et Lar. Lang. fr.; cf. aussi Nod. 1844, Besch. 1845 et Fél. 1851, enfin l'indication ds Ac. 1835 et 1878); à ce sujet cf. Fouché Prononc. 1959, p. 399, Kamm. 1964, p. 198 et Mart. Comment prononce 1913, p. 37 (note 1) et 302 : " Le "s" s'est maintenu ou définitivement rétabli depuis plus ou moins longtemps dans maïs, jadis, fils et lis (y compris fleur de lis le plus souvent malgré l'Académie); dans métis, cassis, vis (subst.) et tournevis. La prononc. de ces mots sans "s" est tout à fait surannée; on ne peut plus la conserver que pour les nécessités de la rime et encore. "
Source : CNRTL - Ortolang - Outils et Ressources pour un Traitement Optimisé de la LANGue Lien : https://www.cnrtl.fr/definition/cassis
Mais qu'est-ce que cette clé peut bien contenir ?

Rentre le mot de passe pour le savoir !

Mot de passe erroné. Taper sur "Entrée" pour recommencer.

La clé USB de Ramoray contient deux fichiers :-exemples séquences des chaînes lourdes (H) et légères (L) de 4 anticorps.edi

-liaison antigène anticorps.PDB

Le fichier en ".edi" ne s'ouvre qu'à partir de GENIEGEN ou d'ANAGENE.

Le fichier en ".PDB" ne s'ouvre qu'à partir de RASTOP ou de LIBMOL.

Besoin d'un petit coup de pouce ?

"Au secours !!! Je n'y arrive pas !!! "

http://acces.ens-lyon.fr/acces/logiciels/applications/geniegen/presentation-du-logiciel-geniegen Dans le Dossier "Téléchargements", faites un Clic droit sur le dossier Geniegen et choisir l'option "Extraire tout...". Puis, f aites un double-clic gauche pour entrer dans le dossier Geniegen décompressé, et cliquez sur l'application. A partir de Géniegen, vous pouvez charger les séquences des chaînes lourdes et des chaînes légères et les étudier. https://drive.google.com/open?id=1buS-g5gyB-oTq9HAxb-h0Ce4rFIpUgJ2
Si vous ne l'avez pas déjà, vous devez télécharger sur votre ordinateur le logiciel gratuit GENIEGEN :
Vous devez faire des comparaisons avec alignement des séquences protéiques des chaînes légères d'une part, et des chaînes lourdes d'autre part.
Vous trouverez ci-dessous les captures d'écran des comparaisons avec alignement des séquences protéiques des chaînes légères. Regardez ci-dessous puis essayez de faire vous même la comparaison des séquences protéiques des chaînes lourdes ! Comparaison des séquences protéiques des chaînes légères de 5 anticorps différents, avec GENIEGEN, mettant en évidence les acides aminés "hypervariables"
(Enregistrez-les sur votre disque dur !)
Comparaison des séquences protéiques des chaînes lourdes de 4 anticorps différents, avec GENIEGEN, mettant en évidence les acides aminés "hypervariables"
Essayez de faire le travail par vous-même pour les chaines lourdes maintenant !

Un conseil ? Notez bien le numéro des acides aminés différents.

Besoin d'un petit coup de pouce ?

"Au secours !!! Je n'y arrive pas !!! "

Si vous ne l'avez pas déjà, vous devez télécharger sur votre ordinateur le logiciel gratuit RASTOP :

Téléchargez RASTOP en cliquant sur "RasTop en français Version 2.03 Exécutable et répertoire d'aide" et téléchargez les fichiers ".DLL" en cliquant sur "Télécharger les DLL de RasTop".
A partir du dossier "rastop_dll" dézippé, copiez les 3 fichiers dans le dossier "rastopvf" qui se trouve lui-même dans "rastop203vf+help". https://drive.google.com/open?id=1buS-g5gyB-oTq9HAxb-h0Ce4rFIpUgJ2
A partir des dossiers téléchargés, "extraire tous" les fichiers grâce à un clic Droit sur le fichier zippé.

Vérifiez bien que vous avez sélectionné pour "Types de fichiers" : "Tous fichiers (*.*)

Et à présent, traitez les données pour mettre en évidence les propriétés des anticorps !

Vous avez cet écran sous les yeux ?

Super ! Il ne vous reste plus qu'à mettre en évidence les acides aminés hypervariables des chaînes lourde et légère de l'anticorps !!!

Remarque 1 : La "chaîne" nommée Y est l' "Antigène". La chaîne H est la chaîne lourde de l'anticorps. La chaîne L est la chaîne légère de l'anticorps.
https://drive.google.com/open?id=1buS-g5gyB-oTq9HAxb-h0Ce4rFIpUgJ2
Remarque 2 : L'anticorps n'est pas représenté en entier sur cette modélisation. Seules les parties terminales des chaînes lourde et légère d'un seul "bras" sont représentées (si on considère qu'un anticorps a globalement la forme d'un "Y", avec un "pied" et deux "bras"). Et au-dessus de ces deux chaînes se trouve l'antigène.

*H and 99 : est la fonction qui permet de sélectionner l'acide aminé n°99 de la chaîne H (par exemple, pour changer sa forme ou sa couleur). Voilà ci-dessous une capture d'écran du complexe antigène/[ fragment d' ]anticorps avec RASTOP qui montre les deux chaînes lourde et légère, l'antigène, ainsi que les acides aminés hypervariables. Sauriez-vous distinguer qui est qui ? A présent, essayez de faire la même chose par vous-même, faites une capture d'image, légendez, et vérifiez que vous avez réussi grâce à la correction ci-dessous : Capture d'écran du complexe antigène/[ fragment d' ]anticorps avec RASTOP qui montre les deux fragments de chaînes lourde et légère, l'antigène, ainsi que les acides aminés hypervariables. Comprenez bien ce que cela signifie quant à la relation Antigène/Anticorps...
*H : est la fonction qui per met de sélectionner la chaîne H (par exemple, pour changer sa forme ou sa couleur).

BRAVO ! Quelle prouesse d'avoir réussi à déchiffrer toutes les énigmes que vous avait laissé le Docteur Ramoray !

La dernière étape se joue ici ...

Jetez un œil dans le microscope !
Sérums de personnes ayant survécu à l'infection d'Extrema Joliotis

Les différents types de dons du sang (tirés du site http://www.dondusang-doubs.org )

Don de plasma (plasmaphérèse).

Uniquement le plasma (= sérum + fibrinogène, protéine permettant la coagulation).

Soin des patients souffrants de :

Troubles de la coagulation.

Hémorragie aigues.

Fabrication de produits thérapeutiques :

Albumine, en cas de de brulures graves, maladies rénales,etc.

Protéines coagulantes (fibrinogène), en cas d'hémophilie.

Immunoglobulines, dont les anticorps (gamma globulines), pour prévenir les allergies et traiter des déficits immunitaires.

Don de plaquettes (aphérèse cellulaire).

Uniquement les plaquettes (nécessaires à une bonne coagulation du sang, en participant au colmatage des plaies vasculaires)

Soin des patients souffrants de :

De leucémie.

D'un cancer.

D'une aplasie : c'est la diminution ou l'arrêt de fabrication des cellules sanguines par la moelle osseuse.

D'une hémorragie importante.

Don de globules blancs.

Uniquement les globules blancs (lymphocytes)

Les globules blancs étaient très employés dans les années 70 et 80. Ce produit sanguin est beaucoup moins utilisé aujourd'hui.

Plusieurs paramètres l'expliquent :

L'avènement de nouveaux antibiotiques, constituant des armes particulièrement efficaces contre les infections.

La difficulté de recruter dans un contexte d'urgence des volontaires pour un don de globules blancs.

Extrema Joliotis

Sérum

Extrema Joliotis

Extrema Joliotis

Extrema Joliotis

Extrema Joliotis

Sérum

Sérum

Sérum

Extrema Joliotis

Sérum

Sérum

Quelle boîte de pétri est la plus pertinente ?

Sérum

Sérum

Extrema Joliotis

Sérum

Sérum

Extrema Joliotis

Sérum

Sérum

Sérum

Extrema Joliotis

Sérum

Sérum

Résultats incohérents

Euh ... L'enquête n'est pas tout à fait finie ?

Prendre un taxi pour se rendre chez RAMORAY

Coup de pouce ?

Vous avez réussi à terminer le travail du Docteur Drake RAMORAY ?

Alors écrivez un mail aux personnes immunisées pour les convaincre de vous aider à combattre la

Besoin d'un dernier petit coup de pouce pour rédiger votre réponse ?

Votre compte-rendu doit prendre la forme d'un mail adressé aux personnes immunisées contre Extrema joliotis.

Vous devez l'envoyer, via l'ENT, au professeur qui vous a proposé cette activité.

Pour que les personnes immunisées soient convaincues de donner leur propre sang :

1) Décrivez-leur précisément ce que l'on va récupérer dans leur sang.

2) Expliquez-leur exactement comment ce remède va agir dans le corps des personnes contaminées pour détruire .
Sources : * D'après un scénario original de Lorianne BERTHAUD : https://scape.enepe.fr/pandemie.html * Images et Vidéo et son :
NB : Des captures d'écran de GENIEGEN (ou ANAGENE) et de RASTOP (ou LIBMOL) sont les bienvenues.

- Page d'accueil : Poche de sang : Photo by marzena osuchowicz from FreeImages https://fr.freeimages.com/photo/blood-1493439

- Cadre ensanglanté : Photo by B S K from FreeImages https://fr.freeimages.com/photo/blood-frame-1174086

- Bureau blanc : Domaine public, https://pxhere.com/fr/photo/49799

- Vidéo : Guillaume Dubreuil, filmé par Lorianne Berthaud

- Tableaux du couloir : Commons Wikimedia : Monkey with her child : https://commons.wikimedia.org/wiki/File:%27Monkey_with_her_child%27_by_Ohara_Koson.jpg

- L'Univers : Commons Wikimedia : https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Sengai_3.jpg

- Salon de Ramoray : Image par Pexels de Pixabay : https://pixabay.com/fr/photos/canap%C3%A9-meubles-l-int%C3%A9rieur-1835923/

- Estampe japonaise : Domaine public : https://publicdomainvectors.org/fr/gratuitement-des-vecteurs/Umezawa-mars-dans-la-Province-de-Segami-couleur-une-image-clipart/32271.html

- Table de la "cuisine" avec tout un tas d'accessoires : Designed by Freepik, https://fr.freepik.com/photos-gratuite/bloc-notes-spirale-vierge-presse-papiers-disposes-bureau-medical-tasse-cafe_5234420.htm#page=1&query=medical%20desk&position=13

- Vidéo : Guillaume Dubreuil, filmé par Lorianne Berthaud

- Tableau Triangles : Public Domain Pictures : https://www.google.com/search?q=fond%20g%C3%A9ometrique%20photo%20domaine%20public&tbm=isch&tbs=sur%3Af&client=firefox-b-d&hl=fr&ved=0CAQQpwVqFwoTCJi2waDJn-kCFQAAAAAdAAAAABAC&biw=1663&bih=936#imgrc=jtZWSjZj5OoLFM

- Bureau de Ramoray avec vue sur les tableaux : PickPic : https://i1.pickpik.com/photos/804/442/377/poster-mockup-decor-desk-thumb.jpg

- Bureau de Ramoray avec vue de l'ordi : Image par Photo Mix de Pixabay, https://pixabay.com/fr/photos/portatif-vintage-appartement-1890547/

- Photo du labo secret de Ramoray : "Designed by pressfoto / Freepik", https://fr.freepik.com/photos-gratuite/interieur-laboratoire-moderne_5576465.htm#page=1&query=medical%20desk&position=49
* Applications :
- Bande son : In the House - In a Heartbeat, de John Murphy (2003).

° La Roue César de S'CAPE : https://scape.enepe.fr/rouecesar.html

° Le Polychromacryptographe de S'CAPE : https://scape.enepe.fr/polychromacryptographe.html

° Le convertisseur de Lipenchais de S'CAPE : https://scape.enepe.fr/lipenchais.html

Escape Game numérique réalisé par Lorianne BERTHAUD et Fleur YPRES - Mai 2020

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Un mug que vous avez piqué chez Ramoray. Il lui avait été offert par une patiente, particulièrement reconnaissante !

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Vous rentrez chez vous après une dure nuit de garde à l'hôpital Foch, à Suresnes (dans les Hauts-de-Seine). Vous comptez vous détendre un peu devant une série quand vous voyez apparaître dans vos mails un message titré "urgent" de la part de votre collègue et ami, l'infectiologue Dr Ramoray.

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Logiciel "défenses immunitaires 3ème" en ligne 

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Logiciel "défenses immunitaires 3ème" en ligne 

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Microsoft Internet Explorer Mozilla Firefox Google Chrome Apple Safari

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Tuto pour télécharger Rastop si vous n'arrivez pas à le récupérer juste au dessus directement...

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Tuto pour télécharger Rastop si vous n'arrivez pas à le récupérer juste au dessus directement...