# data[].attributes.attachment_link.readable_text
Food loss and waste reduction should be seen as a means toward achieving other objectives, including improving food security and nutrition, reducing greenhouse gas emissions, lowering pressure on water and land resources and can increase productivity and economic growth. The formulation of effective policies toward food loss and waste reduction requires comprehensive information as to how much and where - both geographically and along the supply chain - various foods are lost or wasted. FAO's work on measurement and support to countries to take action to reduce food loss and waste is critical to tracking progress made by countries.

# data[].attributes.attachment_link.title
Technical Platform on the Measurement and Reduction of Food Loss and Waste | Food and Agriculture Organization of the United Nations

# data[].attributes.attachment_link.description
Food loss and waste reduction should be seen as a means toward achieving other objectives, including improving food security and nutrition, reducing greenhouse gas emissions, lowering pressure on water and land resources and can increase productivity and economic growth.

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
A volume in Woodhead Publishing Series in Food Science, Technology and Nutrition

Book * 2011

Edited by:

Christophe Lacroix

A volume in Woodhead Publishing Series in Food Science, Technology and Nutrition

Book * 2011

Edited by:

Christophe Lacroix

Book description

Consumers favour foods with fewer synthetic additives, but products must also be safe to eat and have a sufficiently long shelf-life. Biopreservation, the use of a product's natura ... read full description

Browse content

Table of contents

1. Part I: Food biopreservation

2. Part II: Applications of protective cultures, bacteriocins and bacteriophages in food animals and humans

3. Part III: Applications of protective cultures, bacteriocins and bacteriophages in foods and beverages

Description

Consumers favour foods with fewer synthetic additives, but products must also be safe to eat and have a sufficiently long shelf-life. Biopreservation, the use of a product's natural microflora and its antibacterial products for protection against pathogens and spoilage, is a method of growing interest for the safe production of high quality minimally-processed foods. This book provides an essential overview of key topics in this area.

Initial chapters review central aspects in food biopreservation, including the identification of new protective cultures and antimicrobial culture components, existing commercial fermentates including nisin and natamycin and the potential of novel fermentates and bacteriophages to improve food safety. Part II concentrates on the use of protective cultures, bacteriocins and bacteriophages to control the carriage of pathogenic microorganisms in food animals and to modulate human gut microflora. Chapters in the final section of the book review biopreservation of different types of foods, including milk and dairy products, fermented meats, fresh seafood and fruit. A review of active packaging for food biopreservation completes the volume.

Edited by a leading expert, Protective cultures, antimicrobial metabolites and bacteriophages for food and beverage biopreservation is a fundamental reference for researchers and food industry professionals working to ensure the safety of the food supply.

Show more

Consumers favour foods with fewer synthetic additives, but products must also be safe to eat and have a sufficiently long shelf-life. Biopreservation, the use of a product's natural microflora and its antibacterial products for protection against pathogens and spoilage, is a method of growing interest for the safe production of high quality minimally-processed foods. This book provides an essential overview of key topics in this area.

Initial chapters review central aspects in food biopreservation, including the identification of new protective cultures and antimicrobial culture components, existing commercial fermentates including nisin and natamycin and the potential of novel fermentates and bacteriophages to improve food safety. Part II concentrates on the use of protective cultures, bacteriocins and bacteriophages to control the carriage of pathogenic microorganisms in food animals and to modulate human gut microflora. Chapters in the final section of the book review biopreservation of different types of foods, including milk and dairy products, fermented meats, fresh seafood and fruit. A review of active packaging for food biopreservation completes the volume.

Edited by a leading expert, Protective cultures, antimicrobial metabolites and bacteriophages for food and beverage biopreservation is a fundamental reference for researchers and food industry professionals working to ensure the safety of the food supply.

Key Features

Reviews the central aspects in food biopreservation, including the identification of new protective cultures and antimicrobial culture components

Examines the use of protective cultures, bacteriocins and bacteriophages to control the carriage of pathogenic microorganisms

Provides an overview of the biopreservation of different types of foods, including milk and dairy products, fermented meats, fresh seafood and fruit

Show more

Reviews the central aspects in food biopreservation, including the identification of new protective cultures and antimicrobial culture components

Examines the use of protective cultures, bacteriocins and bacteriophages to control the carriage of pathogenic microorganisms

Provides an overview of the biopreservation of different types of foods, including milk and dairy products, fermented meats, fresh seafood and fruit

Details

Copyright

Copyright © 2011 Woodhead Publishing Limited. All rights reserved.

Imprint

Woodhead Publishing

You currently don't have access to this book, however you can purchase separate chapters directly from the table of contents or buy the full version.
Purchase the book

# data[].attributes.attachment_link.title
Protective Cultures, Antimicrobial Metabolites and Bacteriophages for Food and Beverage Biopreservation

# data[].attributes.attachment_link.description
A volume in Woodhead Publishing Series in Food Science, Technology and Nutrition Book * 2011 Edited by: Christophe Lacroix Book * 2011 Edited by: Christophe Lacroix Consumers favour foods with fewer synthetic additives, but products must also be safe to eat and have a sufficiently long shelf-life.

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
This report of the EFSA and the European Centre for Disease Prevention and Control presents the results of zoonoses monitoring activities carried out in 2020 in 27 EU Member States (MS) and nine non‐MS. Key statistics on zoonoses and zoonotic agents in humans, food, animals and feed are provided and interpreted historically. Two events impacted 2020 MS data collection and related statistics: the Coronavirus Disease 2019 (COVID‐19) pandemic and the withdrawal of the United Kingdom from the EU. In 2020, the first and second most reported zoonoses in humans were campylobacteriosis and salmonellosis, respectively. The EU trend for confirmed human cases of these two diseases was stable (flat) from 2016 to 2020. Fourteen of the 26 MS reporting data on Salmonella control programmes in poultry met the reduction targets for all poultry categories. Salmonella results for carcases of various species performed by competent authorities were more frequently positive than own‐checks conducted by food business operators. This was also the case for Campylobacter quantification results from broiler carcases for the MS group that submitted data from both samplers, whereas overall at EU level, those percentages were comparable. Yersiniosis was the third most reported zoonosis in humans, with 10‐fold less cases reported than salmonellosis, followed by Shiga toxin‐producing Escherichia coli (STEC) and Listeria monocytogenes infections. Illnesses caused by L. monocytogenes and West Nile virus infections were the most severe zoonotic diseases with the highest case fatality. In 2020, 27 MS reported 3,086 foodborne outbreaks (a 47.0% decrease from 2019) and 20,017 human cases (a 61.3% decrease). Salmonella remained the most frequently reported causative agent for foodborne outbreaks. Salmonella in 'eggs and egg products', norovirus in 'crustaceans, shellfish, molluscs and products containing them' and L. monocytogenes in 'fish and fish products' were the agent/food pairs of most concern. This report also provides updates on tuberculosis due to Mycobacterium bovis or Mycobacterium caprae, Brucella, Trichinella, Echinococcus, Toxoplasma, rabies, Coxiella burnetii (Q fever) and tularaemia.

# data[].attributes.attachment_link.title
The European Union One Health 2020 Zoonoses Report

# data[].attributes.attachment_link.description
This report of the EFSA and the European Centre for Disease Prevention and Control presents the results of zoonoses monitoring activities carried out in 2020 in 27 EU Member States (MS) and nine non‐MS. Key statistics on zoonoses and zoonotic agents in humans, food, animals and feed are provided and interpreted historically.

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 2 - bact lactiques généralités

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 2 - Mode d'action bact lactiques

# data[].attributes.headline
Autres bactéries à activité bioprotectrice

# data[].attributes.subject
Autres bactéries à activité bioprotectrice

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 2 - Autres bactéries

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 2 - Lev moisissures

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 2 - Phages

# data[].attributes.headline
"Pour en savoir plus" : Revue de littérature

# data[].attributes.subject
"Pour en savoir plus" : Revue de littérature

# data[].attributes.headline
Qu'est que le Réseau Mixte Technologique FLOREPRO ?

# data[].attributes.subject
Qu'est que le Réseau Mixte Technologique FLOREPRO ?

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
ITAI (INSTITUTS TECHNIQUES AGRO-INDUSTRIELS)

ENSEIGNEMENT & RECHERCHE

ÉnilV de La Roche-sur-Foron

Libio (université de Lorraine, Ensaia)

UMR Fromage (Inrae, université Clermont-Auvergne, VetAgro Sup)

UMR Medis (Inrae, université Clermont-Auvergne)

UMR Micalis (AgroParisTech, Inrae, université Paris-Saclay)

UMR Qualisud (Cirad, L’Institut Agro, IRD, universités d'Avignon, La Réunion et Montpellier)

UMR SayFood (AgroParisTech, Inrae, université Paris-Saclay)

UMR Secalim (Inrae, Oniris)

Université de Bretagne occidentale (UBO)

Université de Caen Normandie

Le RMT Actia Florepro a pour objectif de cerner les freins et verrous limitant l’application des cultures protectrices, destinées à améliorer la qualité microbiologique des aliments issus de quatre filières agro-alimentaires (produits carnés, de la mer, végétaux, laitiers et fromages).

Pour cette nouvelle période d’agrément (2021-2025), le RMT s’est basé sur différents constats :
- une forte attente sociétale autour de la naturalité ;
- un besoin de développement des industriels prenant en compte la dimension durabilité ;
- les avancées scientifiques récentes résultant de l’accessibilité aux outils de génomique et séquençage à haut débit ;
- un besoin d’outils de mesure opérationnels pour la détection et la traçabilité des cultures protectrices ainsi que l’évaluation de leur efficacité, qui permettraient de progresser sur la réglementation relative à la technologie de biopréservation.

Ces différents enjeux ont défini les priorités du RMT Actia Florepro qui propose d’évaluer la technologie de biopréservation en prenant en considération l’impact de l’environnement abiotique et des pratiques amont et aval (précisément, l’ajout des micro-organismes de biocontrôle et de biopréservation) sur les interactions des communautés microbiennes dans les aliments. Cette évaluation nécessite le développement d’outils et de méthodes de mesure de l’efficacité et de l’implantation des micro-organismes de bioprotection, ainsi que l’évaluation de l’impact de la technologie en termes d’avantages et inconvénients pratiques, scientifiques, techniques et économiques.

Ces objectifs sont déclinés autour de trois axes principaux et un axe transversal :

Axe 1 : acquisition de connaissances scientifiques à l’échelle de l’écosystème microbien : diversité, variabilité, dynamique, interactions, mécanismes et molécules d’intérêt.

Axe 2 : adaptation d’outils et de méthodes de mesures pour l’évaluation de l’implantation et de l’efficacité des agents de biopréservation.

Axe 3 : évaluation de l’impact environnemental et économique de la technologie de biopréservation, avantages, inconvénients et identification des points de vigilance.

Axe 4 : valorisation, communication, diffusion des résultats et actions de formations. Les travaux des quatre axes s’inscrivent dans une dynamique nationale et européenne et en partenariat avec d’autres RMT, qui détiennent des expertises complémentaires à celles du RMT Actia Florepro (environnement, durée de vie, emballage/conditionnement…).

Téléchargez la plaquette

RMT Actia Florepro et projet ANR Redlosses - 12 octobre 2021

Programme

Présentations

Présentation du RMT Actia Florepro, par Souad Chistieans (Adiv)

Recensement des pratiques de biopréservation utilisées par les entreprises à l’échelle nationale, par Carole Feurer (Ifip)

Projet ANR Pathofood, conduit par le RMT Actia Florepro et le RMT Actia Qualima, par Sabine Leroy (Inrae)

Modéliser les compétitions microbiennes dans les aliments : évaluation des risques et établissement des mesures de maîtrise, par Laurent Guillier (Anses)

Organisation spatiale et paternes d’expression génétique de Listeria monocytogenes et Escherichia coli O157 : H7 dans des matrices gélifiées, par Cédric Saint Martin (Inrae)

Stratégie d’assemblage de souches bactériennes pour des fonctionnalités ciblées, par Hélène Falentin (STLO, Inrae Rennes)

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 4 - Criblage

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 4 - Produits laitiers

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 4 - Produits carnés

# data[].attributes.headline
Exemples dans la filière "produits de la mer"

# data[].attributes.subject
Exemples dans la filière "produits de la mer"

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 4 - Produits de la mer

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 4 - Produits végétaux

# data[].attributes.attachment_link.title
191014 -Cours_biopreservation séq 4 - Bactériophages autorisés

# data[].attributes.headline
Guide pédagogique des procédures réglementaires applicables aux produits de biocontrôle

# data[].attributes.subject
Guide pédagogique des procédures réglementaires applicables aux produits de biocontrôle

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
Ce guide dresse un état des lieux de l'ensemble des règlementations européennes et nationales applicables aux produits de bio-contrôle, utilisables dans le cadre de la protection des cultures. Il ne concerne en aucun cas les produits utilisés dans le cadre de la fertilisation des cultures.
Cet ouvrage permet ainsi d'accompagner les metteurs en marché dans l'homologation des produits de bio-contrôle.
Il reprend les différentes étapes concernant la mise sur le marché des produits de bio-contrôle, allant du règlement européen concernant l'approbation de substances au sens du RCE n°1107/2009, en passant par la règlementation nationale concernant les Autorisations de Mises sur le Marché, jusqu'à la réglementation européenne de la production biologique (RCE n°834/2007 et RCE n°889/2008), établissant les conditions d'utilisations de ce type de produits dans le cadre de la
production biologique. Ce guide comprend également quatre " fiches produits " permettant de retrouver directement l'information réglementaire et législative applicable à chaque catégorie de produits de bio-contrôle.

POUR EN SAVOIR PLUS

Liens

Info +

Info +

Info +

# data[].attributes.attachment_link.title
Guide pédagogique " Procédures réglementaires applicables aux produits de biocontrôle "

# data[].attributes.attachment_link.description
Ce guide dresse un état des lieux de l'ensemble des règlementations européennes et nationales applicables aux produits de bio-contrôle, utilisables dans le cadre de la protection des cultures. Il ne concerne en aucun cas les produits utilisés dans le cadre de la fertilisation des cultures.

# data[].attributes.headline
Flores protectrices pour la conservation des aliments

# data[].attributes.subject
Flores protectrices pour la conservation des aliments

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
Des livres au cœur des sciences

Caractéristiques

Référence Livre papier : 02367

Référence eBook [ePub] : 02367EPB

Référence eBook [PDF] : 02367NUM

EAN13 Livre papier : 9782759219209

EAN13 eBook [ePub] : 9782759220915

EAN13 eBook [PDF] : 9782759219216

Format (en mm) Livre papier : 160 x 240

Nombre de pages Livre papier : 160

Nombre de pages eBook [PDF] : 160

Poids (en grammes) : 304 (Livre papier)

Taille(s) : 1,8 Mo (ePub), 2,5 Mo (PDF)

Vidéo

# data[].attributes.attachment_link.title
Flores protectrices pour la conservation des aliments - - (EAN13 : 9782759220915) | Librairie Quae : des livres au coeur des sciences

# data[].attributes.attachment_link.description
Des livres au cœur des sciences Caractéristiques Référence Livre papier : 02367 Référence eBook [ePub] : 02367EPB Référence eBook [PDF] : 02367NUM EAN13 Livre papier : 9782759219209 EAN13 eBook [ePub] : 9782759220915 EAN13 eBook [PDF] : 9782759219216 Format (en mm) Livre papier : 160 x 240 Nombre de pages Livre papier : 160 Nombre de pages eBook [PDF] : 160 Poids (en grammes) : 304 (Livre papier) Taille(s) : 1,8 Mo (ePub), 2,5 Mo (PDF) Vidéo

# data[].attributes.headline
Contribution of omics to biopreservation : towards food microbiome engineering

# data[].attributes.subject
Contribution of omics to biopreservation : towards food microbiome engineering

# data[].attributes.body
F. Borges, R. Briandet, C. Callon, M.-C. Champomier-Vergès, S. Christieans, S. Chuzeville, C. Denis, N. Desmasures, M.-H. Desmonts, C. Feurer, F. Leroi, S. Leroy, J. Mounier, D. Passerini, M.-F. Pilet, M. Schlusselhuber, V. Stahl, C. Strub, R. Talon, M. Zagorec. 2022. Contribution of omics to biopreservation: towards food microbiome engineering. Front. Microbiol. 13:951182. doi: 10.3389/fmicb.2022.951182.

# data[].attributes.headline
Les flores protectrices, agents de biopréservation

# data[].attributes.subject
Les flores protectrices, agents de biopréservation

# data[].attributes.body
Chapitre 4 de l'ouvrage "Agents antimicrobiens et sécurité sanitaire des aliments" https://www.lavoisier.fr/livre/agro-alimentaire/agents-antimicrobiens-et-securite-sanitaire-des-aliments/descriptif-9782743025977

# data[].attributes.body
Journée de restitution - Vidéos et documents

# data[].attributes.headline
Les nouvelles technologies de conservation des aliments : Biopréservation et Haute-Pression

# data[].attributes.subject
Les nouvelles technologies de conservation des aliments : Biopréservation et Haute-Pression

# data[].attributes.body
Journée de restitution du projet Blac-HP et présentation des travaux du RMT FLOREPRO

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
Cette journée technique coorganisée par le RMT Florepro et l'équipe du projet ANR BlacHP, vise à informer les industriels des produits transformés, mais aussi leurs prescripteurs et fournisseurs, les enseignants-chercheurs et tout acteur des filières agroalimentaires.

Elle répond en effet aux nouveaux enjeux de leur métier : proposer des produits innovants adaptés à la demande des consommateurs c'est à dire durables, de haute qualité, à des prix compétitifs et avec une une durée de vie appropriée.

# data[].attributes.attachment_link.title
BLac HP : les Bactéries LACtiques et Hautes Pressions

# data[].attributes.attachment_link.description
L'objectif du projet ANR Blac HP est de combiner l'utilisation en biopréservation de bactéries lactiques avec l'application de hautes pressions pour obtenir des produits réfrigérés stables à base de viande

# data[].attributes.headline
Produits carnés et de la mer : ECOBIOPRO

# data[].attributes.subject
Produits carnés et de la mer : ECOBIOPRO

# data[].attributes.body
Description du projet et des résultats - Contacts

# data[].attributes.attachment_link.title
Description et évolution des écosystèmes microbiens des produits carnés et de la mer par pyroséquençage: influence des cultures bio-protectrices | ANR

# data[].attributes.attachment_link.description
Mieux conserver les aliments frais périssables est un enjeu pour limiter le gaspillage et les pertes. On peut y contribuer en contrôlant le développement des bactéries indésirables grâce à de bonnes bactéries. Pour cela il faut connaître l’ensemble de l’écosystème des produits.

# data[].attributes.headline
PATHOGENES ET COMMUNAUTES MICROBIENNES DES ALIMENTS : "PATHOFOOD"

# data[].attributes.subject
PATHOGENES ET COMMUNAUTES MICROBIENNES DES ALIMENTS : "PATHOFOOD"

# data[].attributes.body
Décrypter l'hétérogénéité cellulaire et la distribution spatiale de pathogènes dans les matrices alimentaires en interaction avec les communautés microbiennes – PathoFood - Partenariat RMT Actia QUALIMA (https://www.actia-asso.eu/projets/qualima-2/) et RMT Actia FLOREPRO

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
L'hétérogénéité cellulaire des bactéries pathogènes alimentaires E. coli O157:H7 et L. monocytogenes est étudiée par des approches de microbiologie " cellule unique " basées sur la technique du nombre le plus probable (NPP) en appliquant des plans d'expérience visant à évaluer l'effet de différentes conditions environnementales, telles que le pH, la température, la concentration en acides organiques ou encore la structure de la matrice et le microbiote. La capacité d'adaptation, la croissance et la survie de ces pathogènes sont ainsi évaluées au niveau populationnel et cellulaire dans différentes conditions de micro-environnements rencontrés dans l'aliment. Par ailleurs, la distribution spatiale et l'expression différentielles de gènes d'intérêt sont suivies par des approches de microscopie de fluorescence basées sur l'utilisation de gènes rapporteurs fluorescents. Outre le comportement de ces pathogènes en réponse à différentes conditions représentatives des biotopes alimentaires, les interactions avec les communautés microbiennes (microbiote) des aliments sont aussi étudiées, notamment par des approches basées sur la luminescence comme marqueur de l'état physiologique des bactéries pathogènes. Les paramètres de croissance populationnels et cellulaires des pathogènes ont été ainsi déterminés en interactions avec le microbiote des aliments. Enfin, les données générées sont utilisées pour élaborer des modèles de microbiologie prévisionnelle, en particulier des modèles mathématiques prédictifs stochastiques visant à intégrer le faible niveau de contamination et la notion d'hétérogénéité de comportement des pathogènes alimentaires.

Nous avons pu déterminer l'impact des facteurs abiotiques (température, pH, acides organiques, structure du milieu) sur la probabilité de croissance cellulaire et populationnelle de ces deux pathogènes. La température et le pH ainsi que la structure du milieu présentent les effets les plus importants. Nous avons pu mettre en évidence par différentes approches culturales que ces deux pathogènes pouvaient présenter une meilleure tolérance à certains stress lorsqu'ils sont cultivés dans des matrices modèles gélifiées plutôt que dans des cultures liquides. La colonisation de ces matrices se fait sous forme de cellules isolées sessiles ou motiles ou de micro-colonies de tailles et de formes variables en fonction des milieux. L'utilisation de techniques de fluorescence avancées nous ont permis de visualiser et quantifier l'hétérogénéité cellulaire au sein de ces structures à l'échelle de la cellule unique. Les déterminants moléculaires impliqués dans la colonisation de la matrice alimentaire ont été également étudiés. Par ailleurs, la croissance populationnelle et cellulaire des deux pathogènes a été investiguée en présence de consortia microbien représentatifs des matrices alimentaires étudiées. Les résultats pour les consortia fromagers (bactéries lactiques, d'affinage et levures) montrent que leur présence module fortement la concentration maximale atteinte (Nmax) par les pathogènes. L'impact sur le pathogène dépend de la niche écologique et des taux de population des microorganismes constituant les communautés microbiennes de l'aliment. Les modèles développés pour la croissance cellulaire et les compétitions entre espèces ont été validées sur matrice alimentaire.

Par la suite, les impacts des communautés microbiennes, prédominantes dans la viande hachée et dans le fromage à pâte molle, sur la physiologie et la localisation spatiale de ces deux pathogènes devraient être évalués (en milieu modèle et sur produit). Les données générées sur l'effet de ces différentes interactions seront utilisées pour élaborer des modèles mathématiques prédictifs. Ces modèles seront validés dans les écosystèmes de la viande hachée et du fromage à pâte molle. Une meilleure compréhension des interactions des bactéries pathogènes avec les écosystèmes alimentaires, en prenant en compte le biotope et la biocénose, reste un défi crucial pour prédire l'évolution de ces pathogènes dans les aliments et ainsi améliorer leur sécurité microbiologique. Ce projet représente une première étape cruciale vers une compréhension et une intégration plus avancée de l'hétérogénéité cellulaire dans l'écophysiologie et la microbiologie prédictive des pathogènes alimentaires L. monocytogenes et EHEC.

L'organisation spatiale de bactéries pathogènes alimentaires en matrices alimentaires et l'hétérogénéité d'expression ont principalement donné lieu aux publications et communications suivantes :
-Saint Martin et al. 2022 Genetic, physiological and cellular heterogeneities of bacterial pathogens in food matrices: consequences on food safety. Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety. idHAL:hal-03762779
-Dubois-Brissonnet et al. 2022. Genetic, physiological and cellular heterogeneities of bacterial pathogens in food matrices: consequences on food safety. Iseki-food e-conference "Current innovation trends" 23 November 2022. idHAL:hal-03867169
-Saint Martin et al. 2022. Spatial organisation of L. monocytogenes and E. coli O157:H7 cultivated in gel matrices. Food Microbiology. idHAL:hal-03480607
-Saint Martin et al. 2023. Spatially localised expression of the glutamate decarboxylase gadB in E. coli O157:H7 microcolonies in hydrogel matrices. npj Science of Food. idHAL:hal-04242126
Les déterminants moléculaires de bactéries pathogènes alimentaires impliqués dans la colonisation de la matrice alimentaire ont donné lieu aux publications suivantes :
-Ageorges et al. 2020. Molecular determinants of surface colonisation in diarrhoeagenic E. coli: From bacterial adhesion to biofilm formation. FEMS Microbiology Reviews. idHAL:hal-02532777
-Monteiro et al. 2020. The secretome landscape of E. coli O157:H7: Deciphering the cell-surface, outer membrane vesicle and extracellular subproteomes. Journal of Proteomics. idHAL:hal-03103302
-Chafsey et al. 2022. Deep impact of the inactivation of the SecA2-only protein export pathway on the proteosurfaceome of L. monocytogenes. Journal of Proteomics. idHAL:hal-03413889
-Ageorges et al. 2023. Genome-Wide Analysis of Antigen 43 (Ag43) Variants: New Insights in Their Diversity, Distribution and Prevalence in Bacteria. International Journal of Molecular Sciences. idHAL:hal-04064345
-Monteiro et al. 2023. Specific proteomic identification of collagen-binding proteins in E. coli O157:H7: Characterisation of OmpA as a potent vaccine antigen. Cells. idHAL:hal-04138700
Les facteurs environnementaux et les communautés microbiennes alimentaires sur l'hétérogénéité cellulaire de bactéries pathogènes alimentaire ont donné lieu aux communications suivantes :
-Stahl et al. 2021. Quels sont les impacts de conditions abiotiques sur la croissance cellulaire de deux pathogènes alimentaires L. monocytogenes et E. coli 0157:H7 ? SFM Microbes, Nantes, France, 22-24 septembre 2021. idHAL:hal-03735731
-Stahl et al. 2022. E. coli O157:H7 exposée à des consortia microbiens alimentaires : quels impacts sur sa croissance cellulaire ? SFM Microbes, Montpellier, France, 3-5 octobre 2022. idHAL:hal-04193006
-Mangavel et al. 2023. Microbiome engineering as a biopreservation approach to reduce L. monocytogenes in food. BIC 2023, Lille, France 19-21 juin 2023. idHAL:hal-04193008

La maîtrise du risque microbiologique au niveau réglementaire est essentiellement basée sur la notion de seuil de contamination. Ce seuil ne prend pas en compte l'hétérogénéité de la population des pathogènes au sein de cet environnement complexe qu'est l'aliment. En effet, dans une matrice alimentaire, différents microenvironnements coexistent et se distinguent par leurs propriétés physico-chimiques et biochimiques et leurs communautés microbiennes endogènes. L'hétérogénéité phénotypique, observable au niveau de la cellule unique est une caractéristique intrinsèque des bactéries qui doit être prise en considération pour contrôler les pathogènes d'origine alimentaire. Ainsi, l'évaluation quantitative des risques microbiologiques doit englober la variabilité microbienne. L'objectif du projet est de comprendre l'hétérogénéité cellulaire et la répartition spatiale de bactéries pathogènes en interaction avec les communautés microbiennes des aliments en caractérisant leur physiologie à l'échelle de leur microenvironnement. Il vise ensuite à modéliser le comportement de ces bactéries pathogènes en prenant en compte l'écosystème alimentaire. Le projet PathoFood est ciblé sur la caractérisation de deux bactéries pathogènes d'origine alimentaire qui généralement contaminent les aliments à des niveaux initiaux très bas : Listeria monocytogenes et Escherichia coli O157:H7. Ces deux pathogènes ne représentent que quelques cas d'infection par an dues à l'ingestion d'aliments contaminés, mais sont responsables de séquelles graves pour les patients. Les produits alimentaires ciblés sont la viande avec le steak haché de bœuf et les fromages avec un fromage de type pâte molle en raison du risque microbiologique qu'ils peuvent représenter vis-à-vis d'une contamination à L. monocytogenes et E. coli O157:H7 et de l'importante hétérogénéité de ces matrices alimentaires. Dans ces matrices complexes, ces pathogènes rencontreront de multiples microenvironnements et pourront interagir avec les communautés microbiennes en présence. La capacité d'adaptation, la croissance et la survie de L. monocytogenes et E. coli O157:H7, ainsi que leur hétérogénéité cellulaire et leur distribution spatiale en interaction avec le microenvironnement alimentaire seront caractérisées. De plus, les déterminants moléculaires impliqués dans leur interaction avec les composants de la matrice alimentaire seront identifiés. Les impacts des communautés microbiennes, prédominantes dans un steak haché et chez un fromage à pâte molle, sur la physiologie et la localisation spatiale de ces deux pathogènes seront évalués. Les données générées sur l'effet de ces différentes interactions seront utilisées pour élaborer des modèles mathématiques prédictifs. Ces modèles seront validés dans les écosystèmes du steak haché et du fromage à pâte molle. Une meilleure compréhension des interactions des bactéries pathogènes avec les écosystèmes alimentaires, en prenant en compte le biotope et la biocénose, reste un défi crucial pour prédire l'évolution de ces pathogènes dans les aliments et ainsi améliorer leur sécurité microbiologique.

# data[].attributes.attachment_link.title
Décrypter l'hétérogénéité cellulaire et la distribution spatiale de pathogènes dans les matrices alimentaires en interaction avec les communautés microbiennes

# data[].attributes.attachment_link.description
La maîtrise du risque microbiologique au niveau réglementaire est essentiellement basée sur la notion de seuil de contamination qui ne prend pas en compte l'hétérogénéité de la population des pathogènes au sein de l'environnement complexe qu'est l'aliment. L'hétérogénéité phénotypique, observable au niveau de la cellule unique est une caractéristique intrinsèque des bactéries qui doit être prise en compte pour l'évaluation des risques microbiologiques.

# data[].attributes.headline
Publications en lien avec le projet ANR Blac-HP

# data[].attributes.subject
Publications en lien avec le projet ANR Blac-HP

# data[].attributes.headline
Publications en lien avec le projet ANR Redlosses

# data[].attributes.subject
Publications en lien avec le projet ANR Redlosses

# data[].attributes.headline
Publications en lien avec le projet ANR Pathofood

# data[].attributes.subject
Publications en lien avec le projet ANR Pathofood

# data[].attributes.body
A COMPLETER UNE FOIS LES REFERENCES VALIDEES

# data[].attributes.headline
Biopréservation et hautes pressions : effet sur les communautés microbiennes

# data[].attributes.subject
Biopréservation et hautes pressions : effet sur les communautés microbiennes

# data[].attributes.body
Revue professionnelle Viandes et Produits carnés

# data[].attributes.headline
Les pertes alimentaires liées aux altérations dans les  industries agro-alimentaires

# data[].attributes.subject
Les pertes alimentaires liées aux altérations dans les  industries agro-alimentaires

# data[].attributes.body
Revue professionnelle Viandes et Produits Carnés

# data[].attributes.headline
Utilisation des microbiotes comme modèles

# data[].attributes.subject
Utilisation des microbiotes comme modèles

# data[].attributes.body
Revue professionnelle Viandes et Produits carnés

# data[].attributes.attachment_link.title
Utilisation des microbiotes comme modèles

# data[].attributes.attachment_link.description
L’étude microbiologique des aliments est limitée par la variabilité entre lots (diversité et abondance des espèces) et la présence possible de bactéries inconnues ou non encore cultivées. On peut contourner cette limite par deux approches. L’une reconstitue des cocktails de souches à partir de cultures pures dans des aliments modèles simplifiés et permet la construction de modèles mathématiques. L’autre récolte les microbiotes naturels des aliments sans culture préalable. Dans ce cas,la modélisation est plus difficile mais les microbiotes sont reproductibles et plus proches de la réalité. La complémentarité de ces approches est discutée

# data[].attributes.body
Revue professionnelle Viandes et Produits carnés

# data[].attributes.headline
Biopréservation et hautes pressions : effet sur les communautés microbiennes

# data[].attributes.subject
Biopréservation et hautes pressions : effet sur les communautés microbiennes

# data[].attributes.body
Revue professionnelle Viandes et Produits carnés

# data[].attributes.headline
Hautes pressions et biopréservation : effets sur la qualité du jambon cuit

# data[].attributes.subject
Hautes pressions et biopréservation : effets sur la qualité du jambon cuit

# data[].attributes.body
Revue professionnelle Viandes et Produits carnés