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En esta práctica, los estudiantes aprenderán el método de extracción de ADN utilizando fenol-cloroformo. Este método se basa en la separación de componentes celulares mediante la adición de fenol y cloroformo, seguidos de la precipitación del ADN.

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1. Lisis celular: Añadir solución de lisis a la muestra.
2. Fenol: Agregar fenol para separar las proteínas del ADN.
3. Cloroformo: Añadir cloroformo para purificar el ADN.
4. Centrifugación: Separar fases acuosa y orgánica.
5. Precipitación: Usar alcohol frío para precipitar el ADN.
6. Recolección: Recuperar el ADN precipitado.

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DNA Extraction Protocols | Thermo Fisher Scientific - US

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A collection of DNA Extraction Protocols for research, provided by Invitrogen

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Los estudiantes deben obtener una capa de ADN purificado en la fase acuosa tras la centrifugación y precipitación. Este ADN se puede utilizar para experimentos posteriores como PCR o secuenciación.

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En esta práctica, exploraremos el método salting out para la extracción de ADN. Este método utiliza sales y detergentes para eliminar proteínas y otros contaminantes, permitiendo la separación del ADN de la solución.

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1. Lisis: Añadir solución de lisis con detergente a la muestra.
2. Salting Out: Agregar solución saturada de sal para precipitar proteínas.
3. Centrifugación: Realizar centrifugación para separar el ADN de las proteínas precipitadas.
4. Precipitación: Utilizar alcohol isopropílico frío para precipitar el ADN.
5. Recolección: Recuperar el ADN precipitado para su análisis.

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DNA extraction is a routine procedure used to isolate DNA from the nucleus of cells.

Scientists can buy ready-to-use DNA extraction kits. These kits help extract DNA from particular cell types or sample types. However, they can be expensive to use routinely, so many labs have their own methods for DNA extraction

What does DNA extraction involve?

Step 1. Breaking cells open to release the DNA

The cells in a sample are separated from each other, often by a physical means such as grinding or vortexing, and put into a solution containing salt. The positively charged sodium ions in the salt help protect the negatively charged phosphate groups that run along the backbone of the DNA.

A detergent is then added. The detergent breaks down the lipids in the cell membrane and nuclei. DNA is released as these membranes are disrupted.

Step 2. Separating DNA from proteins and other cellular debris

To get a clean sample of DNA, it's necessary to remove as much of the cellular debris as possible. This can be done by a variety of methods. Often a protease ( protein enzyme) is added to degrade DNA-associated proteins and other cellular proteins. Alternatively, some of the cellular debris can be removed by filtering the sample.

Step 3. Precipitating the DNA with an alcohol

Finally, ice-cold alcohol (either ethanol or isopropanol) is carefully added to the DNA sample. DNA is soluble in water but insoluble in the presence of salt and alcohol. By gently stirring the alcohol layer with a sterile pipette, a precipitate becomes visible and can be spooled out. If there is lots of DNA, you may see a stringy, white precipitate.

Step 4. Cleaning the DNA

The DNA sample can now be further purified (cleaned). It is then resuspended in a slightly alkaline buffer and ready to use.

Step 5. Confirming the presence and quality of the DNA

For further lab work, it is important to know the concentration and quality of the DNA.

Optical density readings taken by a spectrophotometer can be used to determine the concentration and purity of DNA in a sample. Alternatively, gel electrophoresis can be used to show the presence of DNA in your sample and give an indication of its quality.

What can this DNA be used for?

Once extracted, DNA can be used for molecular analyses including PCR, electrophoresis, sequencing, fingerprinting and cloning.

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DNA extraction is a routine procedure used to isolate DNA from the nucleus of cells. Scientists can buy ready-to-use DNA extraction kits. These kits help extract DNA from particular cell types or sample types.

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Después del procedimiento, el ADN debe aparecer como un precipitado blanco. Este se puede disolver en agua o buffer TE para su cuantificación y uso en experimentos adicionales.

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En esta práctica, usaremos un kit comercial para la extracción de ADN, que proporciona reactivos y columnas de sílice para purificar el ADN de forma rápida y eficiente.

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1. Lisis: Añadir buffer de lisis del kit a la muestra.
2. Unión: Aplicar la muestra a la columna de sílice para que el ADN se una.
3. Lavado: Lavar la columna con el buffer de lavado del kit.
4. Elución: Eluir el ADN puro con un buffer adecuado.
5. Cuantificación: Medir la concentración de ADN con un espectrofotómetro.

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Los kits comerciales permiten una extracción de ADN rápida y reproducible, siendo útiles en aplicaciones tanto de investigación como clínicas, como la amplificación por PCR y análisis genómicos.

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Métodos de purificación de ácidos nucleicos actualizado

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Infografía Biología Laboratorio Ilustrado Informativo Morado 