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El bulbo raquídeo posee cuerpos celulares neuronales en el centro, y están rodeados por una capa de axones cubiertos por mielina. Controla varias funciones automáticas:

-respiración
-el ritmo cardíaco
-la presión arterial
-la deglución.

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Conduce impulsos motores desde la corteza cerebral hasta el puente troncoencefálico y conduce impulsos sensitivos desde la médula espinal hasta el tálamo. La formación reticular interviene en el sueño y la vigilia, las emociones, el tono muscular, así como en ciertos movimientos y reflejos. Filtra las
señales sensoriales antes de que lleguen a las regiones conscientes del encéfalo.

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El prosencéfalo incluye el tálamo, el sistema límbico y la corteza cerebral.
El cerebro consta de dos hemisferios cerebrales. Cada hemisferio está compuesto por una corteza cerebral exterior; haces de axones, algunos de los que interconectan los dos hemisferios y otros que ligan los hemisferios con el mesencéfalo y el rombencéfalo; y varios cúmulos de neuronas bajo la corteza cerca del tálamo.

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El hipotálamo (ubicado literalmente bajo el tálamo) es aquel conformado por muchos cúmulos (gran acumulación) de neuronas. Algunos liberan hormonas en la sangre, y otros controlan la liberación de hormonas desde la hipófisis.
Las células neurosecretoras, sintetizan hormonas peptídicas, las almacenan y las liberan cuando reciben un estímulo.
El hipotálamo controla la liberación de hormonas de ambas partes, de la hipófisis anterior y de la posterior.
Produce ADH y oxitocina, hormonas regulatorias para la hipófisis anterior.
El hipotálamo también libera tiroxina y controla su liberación.
El hipotálamo ayuda a generar emociones y genera instintos.

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El cerebelo recibe información de los centros de mando de las áreas consientes del encéfalo que controlan el movimiento. Luego compara información de dos fuentes (ej: sensores de posición de los músculos y las articulaciones) y guía movimientos contiguos y precisos. El cerebelo también se vuelve más reponsable al asegurarse de que las acciones se realizan de la forma adecuada.

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Está ubicado arriba del bulbo raquídeo. Su función principal es comunicar el cerebro con la médula espinal, y controla las transiciones entre el sueño y la vigilia. Además, otras neuronas influyen en el ritmo y el patrón de la respiración

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Es una estación de transmisión compleja que canaliza la información sensorial, desde todas las partes del cuerpo hacia la corteza cerebral. Las señales que viajan desde la médula espinal, el cerebelo, bulbo raquídeo, la protuberancia, y la formación reticular, también pasan a través del tálamo.