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El zoológico abrió sus puertas al público oficialmente el 25 de Julio del 2002 bajo la dirección de Nelson Chiriboga, pero sus antecedentes datan de los años 80, tras reclutar aves heridas sin posibilidad de ser devueltas a su hábitat natural, mascotas silvestres abandonadas por sus propietarios y principalmente animales de otros zoológicos que cerraron sus puertas. Luego, 10 años después se constituyó en un Centro de Rescate de Vida Silvestre avalado por en ese entonces Inefan (hoy Ministerio del Ambiente) por lo cual incremento la cantidad de ejemplares sumados por los decomisos de la Policía Nacional (hoy U.P.MA.).

Fue entonces, que surgió la necesidad de encontrar una manera de financiar su alimentación y estadía, abriéndolo al público. El sitio, además sirve al país como un lugar Turístico, Ecológico y Educativo en el que se encuentra gran parte de la Flora y Fauna nativa del Ecuador.

En el campo de la conservación, el zoológico trabaja tanto en rescate como en rehabilitación y protección de aproximadamente 60 especies en peligro de extinción.

El parque zoológico "El Pantanal", situado a 15 minutos de Guayaquil, es un lugar mágico que nos acerca a la naturaleza animal y que nos permite ver de cerca especies muy poco comunes, que son dignas de admiración y que está a la altura de los mejores zoológicos del mundo.

En un recorrido dirigido por un guía podemos ver: animales propios de la selva como jaguar, león africano, cebras, tigre de bengala, puma tigrillo, osos de anteojos; especies andinas como la llama; aves como las águilas: arpía, pechinegra y andina, los guacamayos militar y enano, la lechuza, el perico (cashetigris), flamingos, la garza bueyera y el único guayacamayo de Guayaquil; reptiles como la boa, el cocodrilo y el caimán; además de animales exóticos como la ardilla, venados de cola blanca, lobo costero, mapache cangrejo, camello, entre las especies que más llaman la atención.

Además podrá visitar el Acuario y el Herpetario (exhibición de peces, reptiles y anfibios), atracciones incluidas a inicios del 2015.

Estacionamiento, tiendas de souvenir, bar
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Zoológico El Pantanal | Bienvenidos a Guayaquil. Sitio web oficial turístico de la ciudad.

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El zoológico abrió sus puertas al público oficialmente el 25 de Julio del 2002 bajo la dirección de Nelson Chiriboga, pero sus antecedentes datan de los años 80, tras reclutar aves heridas sin posibilidad de ser devueltas a su hábitat natural, mascotas silvestres abandonadas por sus propietarios y principalmente animales de otros zoológicos que cerraron sus puertas.