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Se establece según la red de coordenadas geográficas. Se expresa en grados (°), minutos (') y segundos (''). Su definición permite identificar las zonas climáticas y los usos horarios.

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Está determinada por el continente o la región geográfica a la que pertenece un sitio. Panamá se localiza en la franja central del contintente americano; equidistante entre el Polo Norte y el Polo Sur.

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Panamá se encuentra en el hemisferio norte y en el hemisferio occidental.

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Las variaciones estacionales en el océano Pacífico.

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Las variaciones estacionales en el océano Pacífico.

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En el invierno, los vientos alisos son detenidos por una masa de aire frío que conforma la zona de convergencia intertropical y provoca que estos asciendan y se produzcan copiosas lluvias. En verano los vientos alisos desplazan el agua de las costas, permitiendo que las aguas frías del fondo del mar, ricas en nutrientes se desplacen a la superficie.

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La flora y fauna del Pacífico y Atlántico quedaron aisladas, evolucionando de forma diferente.
Las aguas al norte del Istmo redujeron su ciclo de mareas, se hicieron cálidas, saladas y con menos nutrientes, esto favoreció la formación de los arrecifes de coral. En el Pacífico las aguas se enfriaron, disminuyeron su sanilidad y temperatura, pero aumentaron sus nutrientes.

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La dirección de las corrientes oceánicas. 

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La dirección de las corrientes oceánicas. 

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La corriente ecuatorial del Atlántico, que fluía a través del Caribe hacia el Pacífico, giró hacia el norte y se convirtió en la actual corriente del golfo de México.

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Por el intercambio de flora y fauna producto de las migraciones de especies entre el norte de sur del continente. Los animales comenzaron a desplazarse originando un intercambio sin precedentes. Por ejemplo, especies de la fauna primitiva gigante que curzaron al norte, tal es el caso el tigre dientes de sable, el perezoso y el armadillo.

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Panamá como barrera natural y puente bio-cultural 

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Panamá como barrera natural y puente bio-cultural 

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Las últimas tierras en formarse en el Istmo son las que cubren la cuenca del Canal y la provincia del Darién, la edad se estima en un millón de años.

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El archipiélago que surgió y que corresponde a las actuales penínsulas de Burica y Azuero, formaron tres corredores de agua entre los océanos: El corredor de Tempisque, el corredor del Canal y el corredor del Atrato, que luego desaparecieron.

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La historia del origen de la lengua de tierra que cubre el territorio panameño comienza hace unos 15 millones de años cuando pociones de tierra aisladas, ubicadas al sur de la parte continental de Centroamérica, iban surgiendo del fondo del mar.

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En los límites de las placas es donde se presenta la mayor actividad tectónica.

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Centroamérica descansa sobre una zona geológica compleja producto de la interacción de las placas tectónicas Caribe, Cocos, Nazca y Suramericana, y la microplaca de Panamá, que se forma por el continuo empuje de estas.

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Placas tectónicas que rodean Centroamérica y Panamá 

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Placas tectónicas que rodean Centroamérica y Panamá 

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Tercera fase geológica hace 100 000 millones de años

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Tercera fase geológica hace 100 000 millones de años

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La formación del istmo de Panamá fue el evento geológico final que unió América del Norte con América del Sur.

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Segunda fase geológica hace 1,8 millones de años

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Segunda fase geológica hace 1,8 millones de años

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A partir de la subducción de la placa del Pacífico por debajo de la placa del Caribe, hace unos 5 millones de años, se formó la cordillera Centra del istmo centroamericano.

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Primeras fase geológica hace 200 millones de años

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Primeras fase geológica hace 200 millones de años

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Hace 200 de años, producto de una intensa actividad tectónica, aparece el arco insular externo formado por islas volcánicas en el canal que separaba el continente americano.

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Antes de la foramción del istmo centroamericano, la existencia de un canal entre América del Norte y América del Sur permitía el intercambio de las aguas de los océanos Atlántico y Pacífico.

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Geológicamente, el Salvador, Guatemala, Honduras y gran parte de Nicaragua estaban relacionadas con América del Norte. El resto del territorio nicaragüense, Costa Rica y el occidente de Panamá se formaron como un cinturón de islas volcánicas producto de la intensa actividad tectónica en el área.