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Las bacterias pueden dividirse en dos grupos

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Se utilizan colorantes para aumentar el contraste entre sus estructuras, para asi mejorar la observacion de una muestra

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Se observan muestras enteras. la muestra se recubre con metal pesado, y el haz de electrones la barren reflejandose y recogiendose en una pantalla. oferece una imagen tridimencional de la muestra

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Se produce una imagen por contraste en una pantalla fluorecente gracias a que el haz de electrones insida sobre la muestra; las zonas que permiten paso de electrones se ven mas claras mientras que las zonas densas se ven mas oscuras

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Utiliza un haz de electrones en lugar de un haz de luz