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Todo inicia desde que los arboles de este manglar como por ejemplo: el Mangle Blanco, Mangle jeli, Avicennia germinans, Conocarpus erectus y otros más, absorben el agua que proviene de los suelos, esta queda en las hojas de estos arboles y los ayuda a la fotosintesis del árbol, y en algunos crecen frutos de los cuales caen al suelo y son el alimento de consumidores, además hay animales como el venado, ciervos, insectos y etc, que son vegetarianos y se alimentan de las hojas de algunas plantas que han crecido y desarrollado gracias a la absorbción de H²0en estas.
Después de que estas especies se alimentan de las plantas, algunos animales carnivoros como arañas, gavilanes, cocodrilos y etc, se alimentan de estos animales herviboros que se mencionan en el parrafo anterior, y despues estos carnivoros llegan a ser cazados por animales más grandes o incluso por nuestra especie ( el ser humano), como por ejemplo, hay seres humanos que han cazado y se han alimentado de cocodrilos, iguanas y etc. Y por ultimo antes de que estos animales anteriormente mencionados sean cazados, estos hacen sus heces o incluso sus cadaveres quedan por ahi tirados y eso ez materia inorganica que puede ser usada por productores.

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El agua de los mares cercanos al manglar (que por lo general acaban en el manglar Estero de Puntarenas) se evapora, y esto es debido a las altas temperaturas del ambiente, el sol calienta el agua de los mares, ríos, lagos y etc. Se convierte en gas o especificamente en vapor de la atmosfera. Despues, este vapor se libera a la atmosfera y esta agua proveniente de los mares se enfria y se vuelven gotas que provoca que se formen las nubes. Despues estas gotas de agua estan contenidas en las nubes, bajan en forma de lluvia y cae hacia la superficie terrestre, en este caso sería el manglar Estero de Puntarenas.
Y esto ocasiona que se llene y que aumente considerablemente el nivel del agua, ademas que en este manglar tambien llega agua de rios, lagos, oceanos y etc.Además, no solo incrementa el nivel del agua en la zona,  sino que tambien esta lluvia y agua de diferentes tipos de zonas, se inflitra en el suelo, y ayuda a los arboles,, como por ejemplo:  Mangle blanco, Mangle rojo y el Conocarpus Erectus y tambien ensi a la biodiversidad del manglar, ya que en este habitan muchas especies como por ejemplo: Cangrejos de mangle,mono narigudo, Ciervos, y especies marinas como el bagre, pargos y mojarras.
El agua que talvez no se inflitro en el suelo acaba llegando si o si al manglar Estero de Puntarenas.