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Formuler des équations automatiquement pour les différentes bases de données bibliographiques

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Site de modèles d’infographie ou de PPT

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Wide collection of free PowerPoint templates and Google Slides themes. Download professional diagrams, charts and maps to create attractive presentations.

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Blog "Statistique et logiciel R" & Prestations stat / méthodo

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Blog "Statistique et logiciel R" & Prestations stat / méthodo

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Mme Della-Vedova publie des actualités sur les statistiques et le logiciel R mais propose aussi des prestation de méhtodologiste ou statisticienne (devis).

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Bienvenue sur le blog Statistiques et logiciel R !

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Le site supersurvey qui propose un outils et offre d'enquête met à disposition des ressources pour bien construire une enquête quantitatives ecrites par des scientifiques.

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Toutes les infos ici.

La Fédération Française des CER regroupe depuis décembre 2018 les différents comités d'éthique de la recherche (CER) organisés sur tout le territoire.

En France, les recherches biomédicales ont depuis longtemps été encadrées par des législations spécifiques, dont le respect est assuré notamment par les comités de protection de la personne (CPP). Depuis le décret de 2016, la loi Jardé formalise un cadre juridique pour émettre un avis éthique sur les études menées chez l'être humain ayant pour objectif une amélioration des connaissances biologiques et médicales. Cependant, de nombreuses recherches, notamment dans les disciplines des Sciences Humaines, de l'Ergonomie ou de la Robotique Humanoïde, requièrent un avis éthique en dehors de ce qui est couvert par la loi Jardé. Les CER examinent ces recherches qui ne sont pas tenues par la loi Jardé de passer devant un CPP.

Ce site web de la fédération des CER a été conçu pour être utile

(1) aux chercheurs et enseignants-chercheurs membres d'une université ou d'une institution française, qui souhaitent demander une évaluation éthique de leur protocole et cherchent à contacter le CER de leur université ou institution

(2) aux chercheurs et enseignants-chercheurs ayant le projet de créer un CER dans leur université ou leur institution

3) aux membres des CER qui cherchent des informations ou des échanges avec d'autres membres de CER dans le cadre de leurs évaluations de projets.

On trouvera sur ce site la plupart des éléments pour savoir dans quel cadre se situe une recherche (loi Jardé ou hors loi Jardé), ainsi que les informations sur les décrets de lois encadrant les recherches hors loi Jardé (lien vers " dossier juridique ").

La question du respect de la règlementation européenne sur la protection des données fait également l'objet d'une rubrique.

Remarque : ce site web est hébergé, à titre gracieux, sur le serveur de l'Université de Reims Champagne-Ardenne. Son contenu relève cependant du bureau de la Fédération Française des CER.

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URCA, SAVE THE DATE : rencontre-débat éthique Le Comité d'éthique du CNRS (COMETS) et le comité Éthique en Commun INRAE-Cirad-Ifremer-IRD organisent une

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Cycles de conférences sur l'éthique de la recherche et la protection des données personnelles

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Cycles de conférences sur l'éthique de la recherche et la protection des données personnelles

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Proposée par l'Université de Lille, en collaboration avec la Fédération des comités d'éthique de la recherche (CER).

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Ethique et protection des données en recherche

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Les CER et autres démarches

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Taxonomie des rôles des auteurs (CRediT)

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Taxonomie des rôles des auteurs (CRediT)

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Ensemble des domaines d'activités attribuables à des auteurs dans un article.

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CRediT (Contributor Roles Taxonomy) is a high-level taxonomy, including 14 roles, that can be used to represent the roles typically played by contributors to research outputs. The roles describe each contributor's specific contribution to the scholarly output.

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Logiciel payant mais avec des tarifs éducation

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Sécurité à l'échelle de l'entreprise

Protège votre vie privée

Sécurité étant le second prénom d'EdrawMax, vos données y sont privées, protégées et sécurisées. Grâce à la sécurité à échelle de l'entreprise, toutes vos informations et tous vos transferts de fichiers sont protégés au moyen du plus haut niveau de cryptage SSL. Nul ne peut accéder à vos données sans autorisation. Pour EdrawMax, la sécurité des données et la confidentialité des clients sont une priorité absolue.

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EdrawMax | Logiciel de diagramme tout-en-un

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Sécurité à l'échelle de l'entreprise Sécurité étant le second prénom d'EdrawMax, vos données y sont privées, protégées et sécurisées. Grâce à la sécurité à échelle de l'entreprise, toutes vos informations et tous vos transferts de fichiers sont protégés au moyen du plus haut niveau de cryptage SSL.

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Plateforme en ligne, conforme RGPD et gratuite pour les enquêtes. Coût modique pour des etudes de cohorte.

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Bibliothèque Python pour Trial Pathfinder, un cadre d'IA permettant d'évaluer systématiquement les critères d'éligibilité des essais cliniques. Fonctions fournies par TrialPathfinder : encodage des critères d'éligibilité, émulation d'essais existants selon des combinaisons de règles d'éligibilité, évaluation des règles d'éligibilité individuelles avec la valeur de Shapley et suggestion de critères basés sur des données.

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Python library for Trial Pathfinder, an AI framework to systematically evaluate clinical trial eligibility criteria. Functions provided by TrialPathfinder: encoding eligibility criteria, emulating existing trials under combinations of eligibility rules, evaluating individual eligibility rule with Shapley value and suggesting data-driven criteria. Reference paper: Evaluating Oncology Trial Eligibility Criteria using Real-World Data and AI.

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https://www.paperdigest.org/

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The International Conference on Computer Vision (ICCV) is one of the top computer vision conferences in the world. In 2023, it is to be held in Paris. To help the community quickly catch up on the work presented in this conference, Paper Digest Team processed all accepted papers, and generated one highlight sentence (typically the main topic) for each paper. Readers are encouraged to read these machine generated highlights / summaries to quickly get the main idea of each paper.

To search or review papers within ICCV-2023 related to a specific topic, please use the search by venue (ICCV-2023) and review by venue (ICCV-2023) services. To browse papers by author, here is a list of all authors (ICCV-2023). You may also like to explore our "Best Paper" Digest (ICCV), which lists the most influential ICCV papers since 1988.

The Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS) is one of the top machine learning conferences in the world. Paper Digest Team analyzes all papers published on NIPS in the past years, and presents the 15 most influential papers for each year. This ranking list is automatically constructed based upon citations from both research papers and granted patents, and will be frequently updated to reflect the most recent changes. To find the latest version of this list or the most influential papers from other conferences/journals, please visit Best Paper Digest page. Note: the most influential papers may or may not include the papers that won the best paper awards. (Version: 2023-09)

To search or review papers within NIPS related to a specific topic, please use the search by venue (NIPS) and review by venue (NIPS) services. To browse the most productive NIPS authors by year ranked by #papers accepted, here is a list of most productive NIPS authors.

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Based in New York, we serve users from thousands of universities & companies on search, review, text rewriting and more.

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Semantic Scholar | AI-Powered Research Tool

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Semantic Scholar uses groundbreaking AI and engineering to understand the semantics of scientific literature to help Scholars discover relevant research.

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The platform to build next‒gen apps | Airtable

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The platform to build next‒gen apps | Airtable

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Airtable is a low‒code platform to build next‒gen apps. Move beyond rigid tools, operationalize your critical data, and reimagine workflows with AI.

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Obsidian is the private and flexible note‑taking app that adapts to the way you think.

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Your connected workspace for wiki, docs & projects | Notion

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A new tool that blends your everyday work apps into one. It's the all-in-one workspace for you and your team.

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Copyright your contribution

You can put Creative Commons license on original drafts to protect your IP. For shared files, RAx always maintains a copy in case of deletion by collaborators or revoked access.

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Literature Review & Critical Analysis Tool for Researchers

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RAx - AI-based research assistant helps with discovery, literature review, critical analysis, paper summary and organize research papers. Free Sign-up!

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The Researcher Workspace

A comprehensive platform for all your research processing: Smart search and a wide range of smart filters, reading list analysis, auto-generated summaries, autonomous extraction and systematizing of data.

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Iris.ai - Your Researcher Workspace - Leading AI for your research challenge

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AI for scientific text understanding - literature reviews, research data extraction, post-market surveillance, and other tedious tasks.

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Litmaps | Your Literature Review Assistant

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Join the 250,000+ researchers, students, and professionals using Litmaps to accelerate their literature review. Find the right papers faster. Get started for free!

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Using citations to find the most relevant literature

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Connected Papers | Find and explore academic papers

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Connected Papers is a visual tool to help researchers and applied scientists find academic papers relevant to their field of work.

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Silvi is an end-to-end screening and data extraction tool supporting Systematic Literature Review and Meta-analysis.

Silvi helps create systematic literature reviews and meta-analyses that follow Cochrane guidelines in a highly reduced time frame, giving a fast and easy overview. It supports the user through the full process, from literature search to data analyses. Silvi is directly connected with databases such as PubMed and ClinicalTrials.gov and is always updated with the latest published research. It also supports RIS files, making it possible to upload a search string from your favorite search engine (i.e., Ovid). Silvi has a tagging system that can be tailored to any project.

Silvi is transparent, meaning it documents and stores the choices (and the reasons behind them) the user makes. Whether publishing the results from the project in a journal, sending them to an authority, or collaborating on the project with several colleagues, transparency is optimal to create robust evidence.

Silvi is developed with the user experience in mind. The design is intuitive and easily available to new users. There is no need to become a super-user. However, if any questions should arise anyway, we have a series of super short, instructional videos to get back on track.

To see Silvi in use, watch our short introduction video.

Silvi.ai was founded in 2018 by Professor in Health Economic Evidence, Tove Holm-Larsen, and expert in Machine Learning, Rasmus Hvingelby. The idea for Silvi stemmed from their own research, and the need to conduct systematic literature reviews and meta-analyses faster.

The ideas behind Silvi were originally a component of a larger project. In 2016, Tove founded the group "Evidensbaseret Medicin 2.0" in collaboration with researchers from Ghent University, Technical University of Denmark, University of Copenhagen, and other experts. EBM 2.0 wanted to optimize evidence-based medicine to its highest potential using Big Data and Artificial Intelligence, but needed a highly skilled person within AI.

Around this time, Tove met Rasmus, who shared the same visions. Tove teamed up with Rasmus, and Silvi.ai was created.

Silvi.ai

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Silvi is an end-to-end screening and data extraction tool supporting Systematic Literature Review and Meta-analysis. Silvi helps create systematic literature reviews and meta-analyses that follow Cochrane guidelines in a highly reduced time frame, giving a fast and easy overview. It supports the user through the full process, from literature search to data analyses.

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Research Guides: AI-Based Literature Review Tools: Home

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Research Guides: AI-Based Literature Review Tools: Home

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"The best thing is that you don't have to go through all the struggle to figure out what words are required for your research and you can just sit back put a link of paper that you already have and start reading."

- A Happy Rabbit

"Having papers suggested that are both earlier and later than those already on my list, as well as the similar papers function, have helped me to find work I would have needed to pore over reference lists for ages to find otherwise. It's a huge time-saver!"

- An Efficient Rabbit

"It's intuitive and tremendously useful. You save a lot of time identifying the most influential papers in a topic/field. Every scientist should know this!"

- A Delighted Rabbit

"You have done an amazing job with this app-Revolutionary, in my humble opinion."

- A Jubilant Rabbit

"I'm delighted with this excellent app. How easy it is to get related papers, how fast it is to get a similar article. But mostly, the way to cluster papers by their relationship and by timeline is a fantastic feature. You have done something incredible."

- An Analytical Rabbit

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The most powerful discovery app ever built for researchers 🔥

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Outils gratuits pour vérifier le plagiat

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Outils gratuits pour vérifier le plagiat

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While plagiarism checkers are great for catching stolen content, you can't always trust the results. And with the consequences of using something that's plagiarized being so severe, you need a checker that you can rely on. But with so many plagiarism checkers out there, which ones can you trust? Well, we're here to answer exactly that. Because even the accidental use of plagiarized content can lead to your website being blacklisted by Google, cause damage to your reputation, or even get you fired. And with the astronomical amount of content that's online, even something you wrote yourself isn't safe from coincidentally containing sentences that seem plagiarized. To help you avoid using something that's plagiarized, we ran a little test. We put a couple bits of content-one that's fully plagiarized and one that's about half-through the main plagiarism checkers available. We found some that rocked, others that did alright, and plenty that outright failed. These are the five that rose to the top. So for a plagiarism checker that you know you can trust, check out our list.

What We Look For in the Best Plagiarism Checkers

Accuracy: This is obviously the most important feature of any plagiarism checker. We've only included options that passed our tests.

Includes a free option: Not everyone needs an expensive subscription, so each of these tools can be used without paying a cent!

Detailed reports: All these checkers will give you the original source of any plagiarized content, as well as highlight the copy that was a bit too similar to someone else's.

Easy to use: Creating an account should be quick and easy. We also included a couple options that you can use without the hassle of signing up.

Grammarly - The Top Grammar and Plagiarism Checker

Not only is Grammarly one of thebest grammar checkers out there, but it's also an excellent plagiarism checker. This tool is a one-stop shop that covers everything a content creators or publishers could ask for. When you scan a document with Grammarly, not only will the tool tell you if it's original, but it'll also let you know if it's well-written. However, one thing to look out for is text that's only partially plagiarized. While Grammarly's free plagiarism checker was easily able to catch our fully plagiarized content, the tool didn't find a thing in the partially plagiarized sentences.

What I Liked

No account needed: With Grammarly's free online plagiarism checker, you can copy and paste or upload your text and have it scanned without giving any of your personal information.

Check your content in seconds: This plagiarism checker works fast. Once you've input the text you want scanned, Grammarly's checker will have your results in a matter of seconds.

Databases galore: Grammarly not only scans billions of webpages when looking for plagiarized content, but it also looks through ProQuest's academic databases so you can be certain your content's original.

Things I Didn't Care For

The details will cost you: The free version will alert you of plagiarism, but you'll have to upgrade to a paid subscription if you want to find out any more information than that.

Curious to learn more about Grammarly? Click here to read our in-depth review.
Plagiarisma - The Best Free Option

Of all the plagiarism checkers we tested, Plagiarisma was definitely one of the best. With the partially plagiarized content, it was able to recognize that only 42% of the text was unique. When I ran the fully plagiarized content through Plagiarisma, it correctly recognized that 0% was original. Beyond simply checking if your content is plagiarized, Plagiarisma can also check your grammar, and rewrite your content (although there is a fee for this service). And if you're a company that publishes content for an international audience, you can even scan documents in more than 190 different languages! For premium members, you can use a couple more cool features. These include a Similarity Checker, which compares the similarities between two documents; a Synonymizer, which rewrites your sentences using synonyms to make them one-of-a-kind; plus unlimited use of the plagiarism checker.

What I Liked

Get to the source of the problem: When using Plagiarisma - even with the free checker - you're given URLs to the matching content. If you're a writer, this can help you cite your sources. And if you're checking someone else's work, you can see exactly where the author is getting their material from.

Use it on the go: With free plagiarism checker software for Windows, Android, and even Blackberry operating systems, you'll always have access to this awesome tool.

Satisfaction guaranteed: If you upgrade to a paid membership, but later decide it's not for you, you can get a full refund within three days.

Things I Didn't Care For

You get what you pay for (or don't pay for): Unless you decide to upgrade to a premium membership, you can only use the free plagiarism checker three times a day. On top of this, without an account your searches are limited to 2,000 words or less.

Varying results: You can run a plagiarism check using either Google or Bing. Depending on the search engine I used to run my test, the results I received were different. It would be much better if the tool searched all sources simultaneously.

PaperRater - The Fastest Plagiarism Checker

Another plagiarism checker that did rather well in our plagiarism tests is PaperRater. This tool also offers a grammar and spell checker. PaperRater is free to use through the website, although if you want to run unlimited tests, you'll need to upgrade to a premium plan. When we ran our test, PaperRater was pretty accurate. It caught most of the plagiarized sentences in our edited content, claiming that it was 59% original. It did a little worse with the completely plagiarized text, as it claimed the copy was 11% original - although that's still pretty darn good. PaperRater also did an awesome job at identifying the source of the plagiarized content, and provided the correct URL in both tests.

What I Liked

Generous basic account: With the free version of PaperRater you can submit up to five pages at a time, with a total of 50 submissions per month. The free version also offers a grammar checker, spelling checker, and writing suggestions.

Crazy fast: Due to PaperRater's great artificial intelligence, your text will be checked in as little as 10 to 15 seconds!

Stay anonymous: You can use PaperRater's online plagiarism checker without creating an account, giving any personal information, or downloading anything.

Perfect your writing: When you use PaperRater's grammar and spell checkers, it'll offer you feedback so you won't make the same mistakes in the future.

Things I Didn't Care For

Could be cheaper: The premium version of PaperRater is a little pricey when compared to the competition. You have the option of signing up for a monthly or annual subscription.

Results are not specific: Unless you are using the premium version of PaperRater, the exact phrases that match another source aren't highlighted, which is frustrating if you need to rewrite certain copy.

Overcrowded with ads: The free version comes with way too many annoying ads, in my opinion.

CopyLeaks - Reports That Won't Leave You Guessing

CopyLeaks turned out to be one of the most accurate checkers we tested. It was able to identify that 63% of our edited content was plagiarized, and also caught our 100% plagiarized text without a problem. While CopyLeak's free plan will leave many people wanting more, it does give you access to one of the best plagiarism checkers available. The free version is ideal if you're a student, or if you only need to use these tools occasionally. However, if you need to check documents often, you'll probably want to upgrade to a premium account.

What I Liked

Excellent reporting: CopyLeak's report places the text from the plagiarized content side-by-side with the original for easy comparison. It also highlights the content that's identical, any minor changes, and words with related meanings.

Only pay for what you need: With CopyLeak's credit system, you have plenty of plans to choose from. You can either commit to a monthly subscription if you think you'll use the service often, or buy a credit package if you only need it occasionally (each credit is good for one 250-word scan).

Awesome dashboard: On CopyLeak's dashboard, you can access all your past scans and reports, as well as see your remaining credits and your subscription plan.

No need to guess: CopyLeaks will layout the exact URLs any plagiarized content came from, including the percentage of words that are identical to each source's text.

Things I Didn't Care For

Not great for frequent users: If you decide to stick with the free version, you'll only get ten credits per month (2,500 words).

Account needed: To use this plagiarism checker, first you'll need to create an account. While the account creation process is pretty simple, it's not ideal if you just want to quickly check some text with minimal hassle.

PlagScan - The Most Thorough Plagiarism Scans

is a paid plagiarism checker, although it does offer a free trial. With it, you can check a limited number of words without paying or giving up your credit card info. PlagScan markets itself to everyone, and includes packages for schools, businesses, and individuals. Once again, PlagScan did a great job passing our little tests. This plagiarism checker was able to figure out that 46.4% of our edited content was original, although it did claim that 3.9% of the fully plagiarized content was original as well.

What I Liked

Checks multiple sources: All documents that are fed into PlagScan's powerful tool are checked across the web, against more than 20,000 journals, and even compared to documents scanned by other PlagScan users.

Maximum security: PlagScan uses 256-bit SSL encryption, so you can rest easy knowing your information is safe.

Use any language: No matter what language your text is written in, PlagScan will understand it.

Own your reports: Downloading your plagiarism report - either as a PDF or an MS Word docx - is as easy as clicking a button.

Things I Didn't Care For

Limited free version: With PlagScan's free trial, you're only able to check 2,000 words. Once they're used up, you'll have to pay if you want to keep using it.

Scans can lag: Depending on factors like a document's size and the server load, it can take ten minutes or more for PlagScan to run a plagiarism check.

The Best Plagiarism Checker for the Job

Regardless of the Plagiarism Checker you use, if it's on this list, you can trust that it'll be accurate. And while any of these checkers will get the job done, depending on your needs, some may be a better match than others. Checkers like PaperRater or Plagiarisma are perfect if you'd like to quickly scan a document and don't want to bother with making an account. These websites are great for students, writers, or anyone who only needs to run a few scans a week and doesn't want to pay. However, if you're looking for a checker that gives you thorough reports and an intuitive dashboard, you may want to consider CopyLeaks, Grammarly, or PlagScan. These tools are more suited for businesses and teachers who want a powerful plagiarism checker and don't mind paying for it (but if your needs are minimal, both can be used for free). If you're still not sure which is best for you, try them out! Sometimes it just comes down to personal preference, and you won't know which one you prefer unless you give it a go. In the end, no matter which of these plagiarism checkers you decide to use, our tests have proven that you'll be in good hands. Take a look at the table below for a quick comparison of each checker:

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5 Free Online Plagiarism Checkers - Which Works in 2023

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While plagiarism checkers are great for catching stolen content, you can't always trust the results. And with the consequences of using something that's plagiarized being so severe, you need a checker that you can rely on. But with so many plagiarism checkers out there, which ones can you trust?

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Plateforme en ligne qui offre gratuitement des services de mentorat et de collaboration en ligne, des cours en ligne et des ressources pour les chercheurs issus de pays a faible ressources. Utile pour tous.

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This kit consists of nine modules, each containing a PowerPoint presentation and a set of facilitator notes. The notes expand on the content of the slides and provide guidance in facilitating the modules, which combine presentation and small-group work.

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Infos : https://www.pvalue.io/fr/presentation/

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Outils et conseils pour construire un enseignement adapté.

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Vous pouvez obtenir une aide/assistance en déposant un ticket sur l'interface, rubrique Services pédagogiques - FSI.
Et utiliser la plateforme Moodle Sciences pour tous vos enseignements à distance.

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Vous pouvez obtenir une aide/assistance en déposant un ticket sur l'interface, rubrique Services pédagogiques - FSI.Et utiliser la plateforme Moodle Sciences pour tous vos enseignements à distance.

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Mon objectif est de vous révéler que la recherche peut être un plaisir et de faire en sorte que le chemin soit plus serein pour vous : je vous apporte des informations de méthode, certes, mais aussi des outils de compréhension sur ce que vous vivez, sur vos difficultés émotionnelles, organisationnelles, relationnelles.

Il y a plusieurs façons d'envisager la thèse, plusieurs points de vue : formellement, c'est un document académique destiné à être évalué ; c'est vrai. Mais c'est aussi un projet bien personnel, un texte où vous mettrez beaucoup de créativité et où votre singularité s'exprimera. Le doctorat est l'aboutissement d'un parcours d'apprentissage de la recherche ; mais il constitue aussi une sorte d'épreuve initiatique où vous serez confronté au doute, au manque de confiance : où vous devrez résoudre des difficultés de motivation, des difficultés émotionnelles.

Vous en sortirez changé(e) : plus assuré(e), plus fort(e) devant l'adversité, plus indépendant(e), plus patient(e). C'est du moins ce que je vous souhaite et c'est vers quoi je travaille pour vous : je vous donne des outils pour que vous résolviez positivement les enjeux scientifiques ET personnels de votre démarche.

Si cela vous intéresse, et que vous voulez en savoir plus, commencez ici par télécharger mon Guide et vous abonner à la Lettre de Réussir Sa Thèse.

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Mon objectif est de vous révéler que la recherche peut être un plaisir et de faire en sorte que le chemin soit plus serein pour vous : je vous apporte des informations de méthode, certes, mais aussi des outils de compréhension sur ce que vous vivez, sur vos difficultés émotionnelles, organisationnelles, relationnelles.

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--> Comité d'évaluation éthique
--> Comité d'éthique
--> Groupe de réflexion thématique

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Dans cette boîte à outils, vous trouverez des ressources pour vous aider à améliorer la qualité de vos recherches, à accroitre leur transparence et leur reproductibilité, et à assurer la valeur des résultats produits.
Les ressources proposées s'appliquent aux différentes étapes d'un projet de recherche, depuis la conception jusqu'à la publication et la diffusion des connaissances obtenues, sans oublier le partage des données. Il peut s'agir d'articles, de rapports, de recommandations, de sites web développés en France ou au sein de la communauté internationale. Certaines de ces ressources sont spécifiques d'un type de recherche (par exemple la recherche clinique ou la recherche en génétique), d'autres sont utiles pour plusieurs types de recherche.
Si une ressource est utilisable à différentes étapes, elle peut être mentionnée plusieurs fois.

Identifier sa question de recherche

L'important est de bien connaitre la littérature pour éviter de poser à nouveau une question scientifique qui a déjà été abordée et résolue par d'autres. Il peut être tout à fait pertinent de choisir de reproduire un travail déjà effectué, mais cela doit être délibéré.

Plusieurs articles discutent ce point :

How to increase value and reduce waste when research priorities are set, Chalmers et al., 2014

Value of information: a tool to improve research prioritization and reduce waste, Minelli et Baio, 2015

Un article récent discute l'impact, sur l'avancée des connaissances, de la manière dont les hypothèses scientifiques sont élaborées et réfutées :

How failure to falsify in high-volume science contributes to the replication crisis, Rajtmajer SM et al., 2022

Élaborer son projet pour répondre à un appel d'offres

Les guidelines du NIH vous aideront à améliorer la rigueur et la reproductibilité des projets et à répondre au mieux aux critères d'évaluation des projets : Guidance: rigor and reproducibility in grant applications.

Le site de Victoria University propose des conseils généraux sur la conduite à tenir pour répondre à un appel d'offre ou à un contrat de recherche : Preparing a tender or research contract.

Le NIH et le Hopkins Hospital proposent des méthodes pas-à-pas pour répondre aux appels d'offres :
How to write an NIH proposal Guidelines for writing and reviewing a research grant proposal

Rédiger un protocole de recherche

Le format et le contenu des protocoles d'essais cliniques sont normalisés et doivent suivre un certain nombre de recommandations. Pour vous aider, vous pouvez vous appuyer sur les documents suivants qui sont complémentaires.
L'OMS a fait des recommandations sur la rédaction des protocoles de recherche :Recommended format for a research protocol.

Un guide téléchargeable permet d'avoir accès à des informations pratiques sur les caractéristiques d'une bonne question de recherche en santé, la conduite de la recherche, la présentation des résultats de la recherche et les principes éthiques : A practical guide for health researchers.

Il existe une recommandation intitulée SPIRIT concernant le contenu minimal d'un protocole d'essai clinique, qui a été approuvée comme une norme internationale et permet de guider la rédaction des protocoles d'essais cliniques : Guidance for clinical trial protocols. La version électronique appelée SEPTRE (SPIRIT Electronic Protocol Tool & Resource) permet de créer son protocole en ligne avec une interface web intuitive et de l'enregistrer dans les registres d'essais cliniques : Create, register, and manage trial protocols with SEPTRE

Les " reporting guidelines " : il est important de les connaître, afin de prendre en compte dès la conception du projet les éléments qu'il sera nécessaire de rapporter en termes de méthodes ou de résultats lors de la publication plutôt que de découvrir au moment de la rédaction de l'article ces éléments (dont certains n'auront parfois jamais été collectés). Les reporting guidelines peuvent donc aussi être considérées comme des " conducting guidelines ".

Vous trouverez sur le site EQUATOR les principales recommandations qui décrivent quels éléments doivent être rapportés dans les publications et que de très nombreux journaux scientifiques demandent de suivre. Ces recommandations concernent par exemple les essais cliniques, le développement d'outils pronostiques ou diagnostiques, les études pré-cliniques avec des animaux. Dans la plupart des cas, il existe à la fois une version courte de ces recommandations parfois sous forme d'une liste d'items, et un article plus complet ( elaboration and explanation paper) qui décrit précisément les items retenus et explique en détail le contenu de chaque item : enhancing the quality and transparency of research.

Choisir
le meilleur design
et anticiper les risques de biais

Choisir le meilleur design possible pour votre recherche, avant de débuter, est un point crucial. Certains outils peuvent vous aider à concevoir votre expérimentation, soit en vous donnant accès à des méthodes pour éviter certaines limites expérimentales, soit en vous donnant accès à des protocoles de travaux réalisés par d'autres équipes. Pour rendre votre recherche la plus reproductible possible, il est important de clarifier au préalable certaines caractéristiques de conception de votre expérience. L'une d'elles concerne l'analyse de puissance nécessaire pour estimer la taille d'échantillon appropriée pour votre expérience. D'autres aident à mettre en œuvre des mesures pour réduire le risque de biais subjectif comme la mise en aveugle et la randomisation. Se poser les questions de la randomisation, de l'aveugle, de la taille de l'échantillon, et des biais potentiels dans les études précliniques est essentiel : A call for transparent reporting to optimize the predictive value of preclinical research, Landis et al., 2012.

Il existe par exemple des outils pour améliorer le design des études animales proposés par le National Centre for the Replacement, Refinement & Reduction of Animals Research (Royaume-Uni) qui aident à concevoir des expériences robustes plus susceptibles de produire des résultats fiables et reproductibles comme l'Experimental design assistant.

Une présentation est disponible sur et un article dans Plos Biology : The experimental design assistant, Percie du Sert et al., 2017.

Protocols.io est un entrepôt en libre accès où vous pourrez retrouver des protocoles expérimentaux conçus par d'autres, afin d'améliorer la reproductibilité de vos recherches. Il est aussi possible de partager vos protocoles pour augmenter la visibilité de vos propres méthodes.

Pour vous sensibiliser aux biais cognitifs : Evidence of experimental bias in the life sciences: why we need blind data recording, Holman et al., 2015.

Anticiper les questions de reproductibilité

Plusieurs articles insistent sur l'importance des problèmes de reproductibilité dans nos recherches actuelles et suggèrent des propositions aux différentes étapes de la recherche :

A manifesto for reproducible science, Munafo et al., 2017

What does research reproducibility mean? Goodman et al., 2016

Reproducibility in science. Improving the standard for basic and preclinical research, Begley et Ioannidis, 2015

Un rapport de l'Académie américaine des sciences, de l'ingénierie et de la médecine explore les nombreuses facettes de la recherche sur l'animal qui pourraient contribuer à des résultats non reproductibles. Ce rapport donne des perspectives sur (i) l'amélioration de la planification, de la conception et de l'exécution des expériences, (ii) l'importance de rapporter tous les détails méthodologiques, et (iii) l'intérêt d'établir des principes d'harmonisation des rapports sur les soins et l'utilisation des animaux dans les études de recherche : Reproducibility issues in research with animals and animal models: workshop in brief.

Dans ce rapport sont notamment rappelés les principes d'harmonisation proposés par le conseil scientifique international pour les animaux de laboratoire ( ICLAS).

Identifier les questions éthiques

La recherche concernant l'être humain : des règles juridiques nationales et internationales encadrent étroitement la conduite des expérimentations chez l'être humain, mais le respect de ces règles ne peut à lui seul garantir l'acceptabilité d'un projet de recherche : un questionnement éthique est nécessaire avant la mise en œuvre de chaque projet de recherche. C'est pour cette raison que tout projet de recherche impliquant l'être humain doit recevoir l'avis d'un comité d'éthique de la recherche (CER), avant sa mise en œuvre. En France, ces CER sont les comités de protection des personnes (CPP) encadrés par le code de la santé publique pour les recherches qualifiées RIPH (recherches impliquant la personne humaine) et des CER non encadrés par la loi pour les recherches non qualifiées RIPH. Voir par exemple le guide de qualification des recherches en santé.

Dans tous les cas (RIPH et non RIPH) le traitement des données de la recherche doit être conforme au RGPD et à la loi informatique et libertés.

L'utilisation d'animaux à des fins scientifiques : il existe un guide de l'évaluation éthique des projets impliquant l'utilisation d'animaux à des fins scientifiques, document élaboré par le GRICE (groupe de réflexion interprofessionnel sur les comités d'éthique), un groupe de travail du GIRCOR (groupe interprofessionnel de réflexion et de communication sur la recherche) suivant les recommandations du CNREEA (comité national de réflexion éthique sur l'expérimentation animale) et à la demande du ministère chargé de l'enseignement supérieur et de la recherche.

Pour toutes les questions relatives au principe des " 3R " (remplacement, réduction, raffinement), un groupement d'intérêt scientifique impliquant notamment l'Inserm, le FC3R vient d'être créé avec pour missions la formation aux 3R, le design de projets conformes aux 3R, leur financement, la diffusion d'informations pertinentes et des appels à projets FC3R.

La reconnaissance des contributions des personnels impliqués dans le projet est à définir avant le début du projet de recherche ; préciser les conditions de participation de chaque équipe et membre d'équipe dans la conduite du projet ; discuter avec l'ensemble des participants leur contribution attendue et la reconnaissance de ces contributions ; et suivre ensemble l'évolution de ces éléments tout au long du projet (ordre des signataires, etc). Un document INSERM rappelle les bonnes pratiques pour la signature des publications scientifiques.

Identifier les exigences règlementaires, dont la protection des données

Un grand nombre de sites vous permettront de compléter vos connaissances sur les aspects réglementaires associés à vos recherches. Notamment :

Les principes relatifs aux recherches impliquant la personne humaine

La loi relative aux recherches impliquant la personne humaine, dite loi Jardé

L'utilisation des animaux à des fins scientifiques.

Le guide pour la recherche du CNRS est très complet. Il renseigne également sur des ressources qui peuvent aider à rédiger un plan de gestion des données, demandé aujourd'hui par de nombreuses sources de financement et faisant partie intégrante de la recherche.

Des informations utiles sur le RGPD sont présentées sur le site de la CNIL.

Pré-enregistrer le protocole

Selon l'OMS, " l'enregistrement de tous les essais cliniques interventionnels est une responsabilité scientifique, éthique et morale " pour tous les scientifiques.

Depuis 2005, tous les essais cliniques doivent obligatoirement être enregistrés sur un registre reconnu comme ClinicalTrials.gov ou . Cet enregistrement doit avoir lieu avant le début de l'essai et toute modification du protocole (par exemple du critère de jugement principal) doit entrainer une modification de cet enregistrement. Aucune publication n'est possible en l'absence d'enregistrement préalable.

Enregistrer les protocoles de recherche devient de plus en plus fréquent dans de nombreux domaines autres que les essais cliniques. On parle alors plutôt de pré-enregistrement. Un article discute l'intérêt de l'enregistrement des études précliniques : Should preclinical studies be registered? Kimmelman et Anderson, 2012. De même, l'article suivant vous donne des précisions pratiques sur le pré-enregistrement des protocoles : The preregistration revolution, Nosek et al., 2018.

Vous pouvez par exemple pré-enregistrer votre protocole sur Open Science Framework (OSF). OSF est maintenu et développé par le Center for Open Science (COS), une organisation à but non lucratif américaine soutenue par des agences fédérales, des fondations privées et des entités commerciales. OSF vous permet de télécharger le protocole de votre projet et d'inviter tous ceux qui y collaborent à y travailler avec vous. Vous pouvez le partager ouvertement afin que tout le monde puisse voir ce sur quoi vous travaillez. Si vous avez peur que l'on vous " vole " votre idée, vous pouvez mettre un embargo. Dans ce cas, vous gardez le protocole en mode privé et réservé à un usage interne, durant une période donnée après laquelle il sera rendu public.

De même, PreclinicalTrials est un registre international en ligne permettant d'enregistrer les protocoles des études précliniques sur l'animal.
Il existe aussi un registre pour les études utilisant l'animal géré par leGerman centre for the protection of laboratory animals (Bf3R). Ce registre permet d'enregistrer les études sans les rendre immédiatement accessibles et d'obtenir un DOI ( Digital Object Identifyer) pour les identifier.

Publier le protocole

Un modèle qui se développe est celui du " registered report " dans lequel, sur la base du protocole, l'article est accepté de principe avant que ne commence la collecte des données. Ensuite, si l'analyse s'est déroulée en conformité avec le protocole, l'article sera publié quel que soit le résultat, comme décrit dans :

Protocol transparency is vital for registered reports, Chambers et Mellor, 2018

The past, present and future of registered reports, Chambers et Tzavella, 2022

Vous pouvez aussi publier a posteriori le protocole de votre travail dans les journaux suivants :

Exécuter le projet et documenter le travail

Tout travail de recherche doit être rigoureusement documenté par un cahier de laboratoire (cahier de laboratoire électronique ou, à défaut, papier). Les personnels des unités affiliées à l'Inserm ont accès à une solution sécurisée de cahier de laboratoire électronique (CLÉ) nommée LabGuru. Vous trouverez sur le site de l'Inserm plusieurs rubriques sur la mise en place du cahier de laboratoire électronique.

Le cahier de laboratoire n'est pas une solution de stockage de données personnelles concernant les participant(e)s aux études. Si l'archivage des résultats nécessite d'y inscrire des données relatives à des personnes , ces données doivent être préalablement pseudonymisées (codées) et elles ne pourront en tout état de cause être communiquées qu'après avoir été anonymisées (c'est à dire rendues non identifiantes ou ne permettant pas, compte tenu de leur niveau d'agrégation, d'identifier les personnes concernées). Vigilance, donc, sur la nature des informations que vous consignez dans votre cahier de laboratoire.

Écrire un plan d'analyse

Une analyse statistique implique parfois un nombre conséquent de choix qu'il convient de documenter en amont et en toute transparence dans un plan d'analyse statistique rédigé au préalable.
Ces plans d'analyses statistiques sont indispensables en recherche clinique, mais ils devraient être rédigés pour tous les types de recherche.

Différentes recommandations sont disponibles :
Statistical principles for clinical trials Guidelines for the content of statistical analysis plans in clinical trials Quantitative analysis documents
DEBATE-statistical analysis plans for observational studies, Hiemstra et al., 2019

Des r ecommandations de Plos sur comment rapporter les analyses statistiques.

L'élaboration d'un plan de gestion des données (PGD) est obligatoire pour tous les projets financés par l'ANR depuis 2019. Sur le site de l'ANR, vous trouverez un ensemble complet de recommandations, conseils pratiques et ressources.

Analyser les données

Interpréter les données implique de connaitre, pour les éviter, les principaux pièges statistiques de l'analyse des données. Par exemple :

Ten simple rules for effective statistical practice, Kass et al., 2016

Science forum: ten common statistical mistakes to watch out for when writing or reviewing a manuscript, Makin et Orban de Xivry, 2019

Augmenter la confiance dans l'analyse

Partager ses codes d'analyse renforce la confiance dans les analyses obtenues, surtout lorsque ces analyses nécessitent un traitement complexe. Pour rendre les méthodes utilisées dans l'analyse plus transparentes et reproductibles (à la fois pour vous-même et pour les autres), vous pouvez utiliser les outils de programmation suivants :

Git, un système de contrôle de version distribué ouvert et gratuit qui vous permet d'enregistrer votre processus lors de la génération du code d'analyse. Enregistrez les versions fonctionnelles de votre code et construisez votre pipeline d'analyses étape par étape.
https://git-scm.com/
RStudio, qui vous permet d'intégrer vos codes d'analyse R ou Python dans un carnet qui contient les codes d'analyses, les résultats obtenus, des explications sur vos méthodes d'analyse.
https://www.rstudio.com/

Améliorer la visualisation des données

La représentation graphique des données a une importance croissante : Beyond bar and line graphs: time for a new data presentation paradigm, Weissgerber et al., 2015.

Une description des principaux problèmes d'images observés dans les publications scientifiques de biologie et des recommandations sur les améliorations possibles du traitement d'image est disponible : creating clear and informative image-based figures for scientific publications, Jambor et al., 2021.

Une vidéo de conseils sur la façon d'améliorer la visualisation de ses données, pour en augmenter la transparence et améliorer la reproductibilité de vos travaux de recherche est proposée par eLife, une organisation à but non lucratif qui propose des outils et documents pour encourager les comportements les plus responsables.

De nombreux outils existent pour aider les personnes n'ayant aucune connaissance en programmation à réaliser des graphiques statiques et interactifs pour des articles scientifiques. Ces outils permettent d'explorer différentes manières de visualiser les données et de produire des graphiques de bonne qualité pour publications.
Parmi ces outils on peut citer :

Interactive dotplot vous permet de créer des dot plots, des box plots, des violin plots et des combinaisons de ces graphiques,

Interactive line graph vous permet de créer des graphes linéaires interactifs,

Interactive repeated experiments dotplot vous permet de fabriquer des dotplots interactifs pour des expériences répétées indépendantes.

Choisir un mode de publication

Différents modes de publication existent. Des informations complètes sont disponibles sur le site CoopIST de la délégation à l'intégrité scientifique du Cirad.

Vous pouvez par exemple choisir de publier un préprint de votre publication avant de publier dans un journal après revue par des pairs. Les serveurs de prépublication sont utilisés pour publier une version préliminaire de votre publication avant de la soumettre à une revue à comité de lecture. Publier ainsi permet de partager des résultats et de rendre son travail accessible plus rapidement.

Un guide pratique sur les prépublications a été publié par le consortium néerlandais des bibliothèques universitaires et la bibliothèque nationale des Pays-Bas (UKB), l'association des universités des Pays-Bas (VSNU) et le conseil néerlandais de la recherche (NWO). Dans ce guide, vous trouverez en particulier des informations très pratiques sur les différents serveurs de préprints, comment publier un préprint, comment préparer un préprint, comment réviser un préprint, comment lier un préprint à un article publié dans une revue.

Parmi les serveurs de préprints on citera notamment :

, un serveur de preprints pour la biologie

, un serveur de préprints pour les sciences de la santé

OSFPreprints de l'Open Science Framework, pour toutes les disciplines

Vous pouvez choisir de publier dans une revue en libre accès.

Une liste des journaux en Open Access qui obéissent à certaines normes de qualité a été réalisée par le Berlin Institute of Health. Cette liste vous permet de retrouver les revues en accès libre adaptées à votre domaine de recherche et vous donne des informations, pour chaque revue ,sur les coûts et les délais moyens de publication.

Le Directory of open access journals (DOAJ) propose une base de données plus approfondie et complète de revues en libre accès pour tous les domaines de recherche. Les revues doivent être évaluées pour leur qualité avant d'être répertoriées sur DOAJ.

Vous pouvez publier dans une archive ouverte même si vous n'avez pas publié dans une revue en libre accès (souvent après une période d'embargo). Les informations utiles sont disponibles sur le site ouvrir la science.
HAL est une archive ouverte pluridisciplinaire destinée au dépôt et à la diffusion d'articles scientifiques, publiés ou non, et de thèses, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, et de laboratoires publics ou privés. HAL-Inserm est le portail Inserm de cette archive.

Pensez à sélectionner des revues de qualité et éviter les revues prédatrices. Des dizaines de milliers de revues existent et de nouvelles revues sont lancées chaque jour. Parmi ces revues, il y a près de 15 000 revues prédatrices : avant de soumettre un article, il est donc indispensable de vérifier la qualité du journal. Une checklist pour vérifier que le journal auquel on pense soumettre son article est un journal de qualité a été proposée par le collectif international " Think check submit ". De même, Coop'IST propose des outils pour aider à détecter les revues et éditeurs prédateurs.

Une vidéo vous permettra de mieux comprendre les aspects financiers de la publication scientifique.

Écrire le manuscrit

Écrire le manuscrit c'est aussi s'assurer qu'il comporte suffisamment d'informations pour être reproduit. Des guidelines de reporting pourront vous aider. Par exemple,
How to integrate reporting guidelines in your journal's workflow
Ten simple rules for writing research papers , Zhang, 2014

Partager et diffuser

Le journal Nature offre un service pour vous aider à répondre à vos questions sur le partage et la mise à disposition des données de la recherche.

Un FAQ sur les politiques concernant les données de recherche est disponible sur le site de Nature : Research data policies FAQs.

Il existe également un guide pratique pour celles et ceux qui ne savent pas où déposer leurs données : Data repository guidance.

Enfin, vous trouverez un ensemble de ressources sur les déclarations de disponibilité des données sur le site de Nature : Data availibility statement : guidance for authors and editors.

Communiquer

L'Inserm a publié un petit guide de conseils sur l'usage des médias sociaux qui s'adresse à tous les personnels qui souhaitent s'exprimer et partager leurs connaissances sur un média social, quel qu'il soit : Guide pour un bon usage des médias sociaux.

Chaque jour ou presque, des résultats d'enquêtes épidémiologiques sont portés à la connaissance du public, commentés dans les médias, sur la blogosphère, ou fondent des décisions politiques. L'Inserm vous propose un document d'aide à la " traduction " de notions courantes et parfois complexes de l'épidémiologie, définies et illustrées à l'aide d'exemples concrets : Diffuser des connaissances en épidémiologie.

Archiver les données

Vous trouverez un ensemble de ressources sur le site Coop'IST et sur le site de DoRANum.

Partager les données

Le partage des données de recherche est très utile car il permet la réutilisation des données, la synthèse des données individuelles. Ce partage est également important pour améliorer la reproductibilité de la recherche. De nombreux gouvernements (dont le gouvernement français), revues et institutions scientifiques encouragent à ce partage.

A noter que, s'il s'agit de données portant sur des personnes, des règles spécifiques s'appliquent, et une analyse éthique rigoureuse est nécessaire.

Quelques règles simples pour renforcer l'utilité de vos données :

Une application, Shiny, a été conçue par le centre QUEST (Charité-Berlin) pour aider les scientifiques du secteur biomédical à identifier le format de publication le plus approprié pour leurs données.

Pour déposer vos données de recherche ouvertes et citables dans une archive appropriée, des référentiels vous permettent de télécharger tout le matériel lié à votre projet de recherche - donc non seulement la publication mais également les données associées ou les scripts d'analyse.

Zenodo - Un référentiel à accès ouvert à usage général développé dans le cadre du programme européen OpenAIRE et exploité par le CERN. Cet entrepôt permet de déposer des documents de recherche, des ensembles de données, des logiciels de recherche, des rapports et tout autre artefact numérique lié à une recherche. Pour chaque soumission, un identifiant d'objet numérique persistant (DOI) est créé, ce qui rend les éléments stockés facilement citables. Il n'a pas de limite de taille.
https://zenodo.org/
Figshare - Un entrepôt polyvalent permettant de mettre à disposition des documents, des données, des résultats de recherche non traditionnels. Des fichiers jusqu'à 20 Go peuvent être téléchargés.
https://figshare.com/
Open Science Framework - Un entrepôt pour enregistrer des documents et des données de votre projet de recherche avant et après la publication.
https://www.cos.io/products/osf

Écrire un plan de management des données

Des recommandations FAIR ( Findability, Accessibility, Interoperability, and R euse of digital assets) pour la gestion des données scientifiques ont été publiées et l'INSERM soutient ce mouvement. Ces recommandations ont pour objectifs d'améliorer la repérabilité, l'accessibilité, l'interopérabilité et la réutilisation des actifs numériques. Les principes mettent l'accent sur l'actionnabilité par la machine (c'est-à-dire la capacité des systèmes informatiques à trouver, accéder, interagir et réutiliser des données avec aucune ou une intervention humaine minimale) parce que les humains s'appuient de plus en plus sur le support informatique pour traiter les données en raison de l'augmentation du volume de la complexité et la vitesse de création des données.
https://www.go-fair.org/fair-principles/ https://www.nature.com/articles/sdata201618
Un guide de rédaction, rédigé par l'université de Paris, ayant pour vocation d'accompagner les responsables de projets dans la rédaction de plans de gestion de données de la recherche ( Data Management Plans, DMP) est disponible en ligne. La structure proposée tient compte du cycle de vie des données, de leur création dans le cadre d'un projet de recherche jusqu'à leur archivage. Elle s'appuie également sur divers modèles de plans de gestion de données tels que celui de la National Science Foundation (NSF) ou de l'Interuniversity Consortium for Political and Social Research (ICPSR). Ce guide intègre en particulier les attendus de la Commission européenne dans le cadre d'Horizon 2020 et du FAIR data management.
http://www.bu.parisdescartes.fr/doc/recherche/Realiser_un_DMP_V2_2018_Def_HRS4R.pdf

Identifier sa question de recherche

L'important est de bien connaitre la littérature pour éviter de poser à nouveau une question scientifique qui a déjà été abordée et résolue par d'autres. Il peut être tout à fait pertinent de choisir de reproduire un travail déjà effectué, mais cela doit être délibéré.

Plusieurs articles discutent ce point :

How to increase value and reduce waste when research priorities are set, Chalmers et al., 2014

Value of information: a tool to improve research prioritization and reduce waste, Minelli et Baio, 2015

Un article récent discute l'impact, sur l'avancée des connaissances, de la manière dont les hypothèses scientifiques sont élaborées et réfutées :

How failure to falsify in high-volume science contributes to the replication crisis, Rajtmajer SM et al., 2022

Élaborer son projet pour répondre à un appel d'offres

Les guidelines du NIH vous aideront à améliorer la rigueur et la reproductibilité des projets et à répondre au mieux aux critères d'évaluation des projets : Guidance: rigor and reproducibility in grant applications.

Le site de Victoria University propose des conseils généraux sur la conduite à tenir pour répondre à un appel d'offre ou à un contrat de recherche : Preparing a tender or research contract.

Le NIH et le Hopkins Hospital proposent des méthodes pas-à-pas pour répondre aux appels d'offres :
How to write an NIH proposal Guidelines for writing and reviewing a research grant proposal

Rédiger un protocole de recherche

Le format et le contenu des protocoles d'essais cliniques sont normalisés et doivent suivre un certain nombre de recommandations. Pour vous aider, vous pouvez vous appuyer sur les documents suivants qui sont complémentaires.
L'OMS a fait des recommandations sur la rédaction des protocoles de recherche :Recommended format for a research protocol.

Un guide téléchargeable permet d'avoir accès à des informations pratiques sur les caractéristiques d'une bonne question de recherche en santé, la conduite de la recherche, la présentation des résultats de la recherche et les principes éthiques : A practical guide for health researchers.

Il existe une recommandation intitulée SPIRIT concernant le contenu minimal d'un protocole d'essai clinique, qui a été approuvée comme une norme internationale et permet de guider la rédaction des protocoles d'essais cliniques : Guidance for clinical trial protocols. La version électronique appelée SEPTRE (SPIRIT Electronic Protocol Tool & Resource) permet de créer son protocole en ligne avec une interface web intuitive et de l'enregistrer dans les registres d'essais cliniques : Create, register, and manage trial protocols with SEPTRE

Les " reporting guidelines " : il est important de les connaître, afin de prendre en compte dès la conception du projet les éléments qu'il sera nécessaire de rapporter en termes de méthodes ou de résultats lors de la publication plutôt que de découvrir au moment de la rédaction de l'article ces éléments (dont certains n'auront parfois jamais été collectés). Les reporting guidelines peuvent donc aussi être considérées comme des " conducting guidelines ".

Vous trouverez sur le site EQUATOR les principales recommandations qui décrivent quels éléments doivent être rapportés dans les publications et que de très nombreux journaux scientifiques demandent de suivre. Ces recommandations concernent par exemple les essais cliniques, le développement d'outils pronostiques ou diagnostiques, les études pré-cliniques avec des animaux. Dans la plupart des cas, il existe à la fois une version courte de ces recommandations parfois sous forme d'une liste d'items, et un article plus complet ( elaboration and explanation paper) qui décrit précisément les items retenus et explique en détail le contenu de chaque item : enhancing the quality and transparency of research.

Choisir
le meilleur design
et anticiper les risques de biais

Choisir le meilleur design possible pour votre recherche, avant de débuter, est un point crucial. Certains outils peuvent vous aider à concevoir votre expérimentation, soit en vous donnant accès à des méthodes pour éviter certaines limites expérimentales, soit en vous donnant accès à des protocoles de travaux réalisés par d'autres équipes. Pour rendre votre recherche la plus reproductible possible, il est important de clarifier au préalable certaines caractéristiques de conception de votre expérience. L'une d'elles concerne l'analyse de puissance nécessaire pour estimer la taille d'échantillon appropriée pour votre expérience. D'autres aident à mettre en œuvre des mesures pour réduire le risque de biais subjectif comme la mise en aveugle et la randomisation. Se poser les questions de la randomisation, de l'aveugle, de la taille de l'échantillon, et des biais potentiels dans les études précliniques est essentiel : A call for transparent reporting to optimize the predictive value of preclinical research, Landis et al., 2012.

Il existe par exemple des outils pour améliorer le design des études animales proposés par le National Centre for the Replacement, Refinement & Reduction of Animals Research (Royaume-Uni) qui aident à concevoir des expériences robustes plus susceptibles de produire des résultats fiables et reproductibles comme l'Experimental design assistant.

Une présentation est disponible sur et un article dans Plos Biology : The experimental design assistant, Percie du Sert et al., 2017.

Protocols.io est un entrepôt en libre accès où vous pourrez retrouver des protocoles expérimentaux conçus par d'autres, afin d'améliorer la reproductibilité de vos recherches. Il est aussi possible de partager vos protocoles pour augmenter la visibilité de vos propres méthodes.

Pour vous sensibiliser aux biais cognitifs : Evidence of experimental bias in the life sciences: why we need blind data recording, Holman et al., 2015.

Anticiper les questions de reproductibilité

Plusieurs articles insistent sur l'importance des problèmes de reproductibilité dans nos recherches actuelles et suggèrent des propositions aux différentes étapes de la recherche :

A manifesto for reproducible science, Munafo et al., 2017

What does research reproducibility mean? Goodman et al., 2016

Reproducibility in science. Improving the standard for basic and preclinical research, Begley et Ioannidis, 2015

Un rapport de l'Académie américaine des sciences, de l'ingénierie et de la médecine explore les nombreuses facettes de la recherche sur l'animal qui pourraient contribuer à des résultats non reproductibles. Ce rapport donne des perspectives sur (i) l'amélioration de la planification, de la conception et de l'exécution des expériences, (ii) l'importance de rapporter tous les détails méthodologiques, et (iii) l'intérêt d'établir des principes d'harmonisation des rapports sur les soins et l'utilisation des animaux dans les études de recherche : Reproducibility issues in research with animals and animal models: workshop in brief.

Dans ce rapport sont notamment rappelés les principes d'harmonisation proposés par le conseil scientifique international pour les animaux de laboratoire ( ICLAS).

Identifier les questions éthiques

La recherche concernant l'être humain : des règles juridiques nationales et internationales encadrent étroitement la conduite des expérimentations chez l'être humain, mais le respect de ces règles ne peut à lui seul garantir l'acceptabilité d'un projet de recherche : un questionnement éthique est nécessaire avant la mise en œuvre de chaque projet de recherche. C'est pour cette raison que tout projet de recherche impliquant l'être humain doit recevoir l'avis d'un comité d'éthique de la recherche (CER), avant sa mise en œuvre. En France, ces CER sont les comités de protection des personnes (CPP) encadrés par le code de la santé publique pour les recherches qualifiées RIPH (recherches impliquant la personne humaine) et des CER non encadrés par la loi pour les recherches non qualifiées RIPH. Voir par exemple le guide de qualification des recherches en santé.

Dans tous les cas (RIPH et non RIPH) le traitement des données de la recherche doit être conforme au RGPD et à la loi informatique et libertés.

L'utilisation d'animaux à des fins scientifiques : il existe un guide de l'évaluation éthique des projets impliquant l'utilisation d'animaux à des fins scientifiques, document élaboré par le GRICE (groupe de réflexion interprofessionnel sur les comités d'éthique), un groupe de travail du GIRCOR (groupe interprofessionnel de réflexion et de communication sur la recherche) suivant les recommandations du CNREEA (comité national de réflexion éthique sur l'expérimentation animale) et à la demande du ministère chargé de l'enseignement supérieur et de la recherche.

Pour toutes les questions relatives au principe des " 3R " (remplacement, réduction, raffinement), un groupement d'intérêt scientifique impliquant notamment l'Inserm, le FC3R vient d'être créé avec pour missions la formation aux 3R, le design de projets conformes aux 3R, leur financement, la diffusion d'informations pertinentes et des appels à projets FC3R.

La reconnaissance des contributions des personnels impliqués dans le projet est à définir avant le début du projet de recherche ; préciser les conditions de participation de chaque équipe et membre d'équipe dans la conduite du projet ; discuter avec l'ensemble des participants leur contribution attendue et la reconnaissance de ces contributions ; et suivre ensemble l'évolution de ces éléments tout au long du projet (ordre des signataires, etc). Un document INSERM rappelle les bonnes pratiques pour la signature des publications scientifiques.

Identifier les exigences règlementaires, dont la protection des données

Un grand nombre de sites vous permettront de compléter vos connaissances sur les aspects réglementaires associés à vos recherches. Notamment :

Les principes relatifs aux recherches impliquant la personne humaine

La loi relative aux recherches impliquant la personne humaine, dite loi Jardé

L'utilisation des animaux à des fins scientifiques.

Le guide pour la recherche du CNRS est très complet. Il renseigne également sur des ressources qui peuvent aider à rédiger un plan de gestion des données, demandé aujourd'hui par de nombreuses sources de financement et faisant partie intégrante de la recherche.

Des informations utiles sur le RGPD sont présentées sur le site de la CNIL.

Pré-enregistrer le protocole

Selon l'OMS, " l'enregistrement de tous les essais cliniques interventionnels est une responsabilité scientifique, éthique et morale " pour tous les scientifiques.

Depuis 2005, tous les essais cliniques doivent obligatoirement être enregistrés sur un registre reconnu comme ClinicalTrials.gov ou . Cet enregistrement doit avoir lieu avant le début de l'essai et toute modification du protocole (par exemple du critère de jugement principal) doit entrainer une modification de cet enregistrement. Aucune publication n'est possible en l'absence d'enregistrement préalable.

Enregistrer les protocoles de recherche devient de plus en plus fréquent dans de nombreux domaines autres que les essais cliniques. On parle alors plutôt de pré-enregistrement. Un article discute l'intérêt de l'enregistrement des études précliniques : Should preclinical studies be registered? Kimmelman et Anderson, 2012. De même, l'article suivant vous donne des précisions pratiques sur le pré-enregistrement des protocoles : The preregistration revolution, Nosek et al., 2018.

Vous pouvez par exemple pré-enregistrer votre protocole sur Open Science Framework (OSF). OSF est maintenu et développé par le Center for Open Science (COS), une organisation à but non lucratif américaine soutenue par des agences fédérales, des fondations privées et des entités commerciales. OSF vous permet de télécharger le protocole de votre projet et d'inviter tous ceux qui y collaborent à y travailler avec vous. Vous pouvez le partager ouvertement afin que tout le monde puisse voir ce sur quoi vous travaillez. Si vous avez peur que l'on vous " vole " votre idée, vous pouvez mettre un embargo. Dans ce cas, vous gardez le protocole en mode privé et réservé à un usage interne, durant une période donnée après laquelle il sera rendu public.

De même, PreclinicalTrials est un registre international en ligne permettant d'enregistrer les protocoles des études précliniques sur l'animal.
Il existe aussi un registre pour les études utilisant l'animal géré par leGerman centre for the protection of laboratory animals (Bf3R). Ce registre permet d'enregistrer les études sans les rendre immédiatement accessibles et d'obtenir un DOI ( Digital Object Identifyer) pour les identifier.

Publier le protocole

Un modèle qui se développe est celui du " registered report " dans lequel, sur la base du protocole, l'article est accepté de principe avant que ne commence la collecte des données. Ensuite, si l'analyse s'est déroulée en conformité avec le protocole, l'article sera publié quel que soit le résultat, comme décrit dans :

Protocol transparency is vital for registered reports, Chambers et Mellor, 2018

The past, present and future of registered reports, Chambers et Tzavella, 2022

Vous pouvez aussi publier a posteriori le protocole de votre travail dans les journaux suivants :

Exécuter le projet et documenter le travail

Tout travail de recherche doit être rigoureusement documenté par un cahier de laboratoire (cahier de laboratoire électronique ou, à défaut, papier). Les personnels des unités affiliées à l'Inserm ont accès à une solution sécurisée de cahier de laboratoire électronique (CLÉ) nommée LabGuru. Vous trouverez sur le site de l'Inserm plusieurs rubriques sur la mise en place du cahier de laboratoire électronique.

Le cahier de laboratoire n'est pas une solution de stockage de données personnelles concernant les participant(e)s aux études. Si l'archivage des résultats nécessite d'y inscrire des données relatives à des personnes , ces données doivent être préalablement pseudonymisées (codées) et elles ne pourront en tout état de cause être communiquées qu'après avoir été anonymisées (c'est à dire rendues non identifiantes ou ne permettant pas, compte tenu de leur niveau d'agrégation, d'identifier les personnes concernées). Vigilance, donc, sur la nature des informations que vous consignez dans votre cahier de laboratoire.

Écrire un plan d'analyse

Une analyse statistique implique parfois un nombre conséquent de choix qu'il convient de documenter en amont et en toute transparence dans un plan d'analyse statistique rédigé au préalable.
Ces plans d'analyses statistiques sont indispensables en recherche clinique, mais ils devraient être rédigés pour tous les types de recherche.

Différentes recommandations sont disponibles :
Statistical principles for clinical trials Guidelines for the content of statistical analysis plans in clinical trials Quantitative analysis documents
DEBATE-statistical analysis plans for observational studies, Hiemstra et al., 2019

Des r ecommandations de Plos sur comment rapporter les analyses statistiques.

L'élaboration d'un plan de gestion des données (PGD) est obligatoire pour tous les projets financés par l'ANR depuis 2019. Sur le site de l'ANR, vous trouverez un ensemble complet de recommandations, conseils pratiques et ressources.

Analyser les données

Interpréter les données implique de connaitre, pour les éviter, les principaux pièges statistiques de l'analyse des données. Par exemple :

Ten simple rules for effective statistical practice, Kass et al., 2016

Science forum: ten common statistical mistakes to watch out for when writing or reviewing a manuscript, Makin et Orban de Xivry, 2019

Augmenter la confiance dans l'analyse

Partager ses codes d'analyse renforce la confiance dans les analyses obtenues, surtout lorsque ces analyses nécessitent un traitement complexe. Pour rendre les méthodes utilisées dans l'analyse plus transparentes et reproductibles (à la fois pour vous-même et pour les autres), vous pouvez utiliser les outils de programmation suivants :

Git, un système de contrôle de version distribué ouvert et gratuit qui vous permet d'enregistrer votre processus lors de la génération du code d'analyse. Enregistrez les versions fonctionnelles de votre code et construisez votre pipeline d'analyses étape par étape.
https://git-scm.com/
RStudio, qui vous permet d'intégrer vos codes d'analyse R ou Python dans un carnet qui contient les codes d'analyses, les résultats obtenus, des explications sur vos méthodes d'analyse.
https://www.rstudio.com/

Améliorer la visualisation des données

La représentation graphique des données a une importance croissante : Beyond bar and line graphs: time for a new data presentation paradigm, Weissgerber et al., 2015.

Une description des principaux problèmes d'images observés dans les publications scientifiques de biologie et des recommandations sur les améliorations possibles du traitement d'image est disponible : creating clear and informative image-based figures for scientific publications, Jambor et al., 2021.

Une vidéo de conseils sur la façon d'améliorer la visualisation de ses données, pour en augmenter la transparence et améliorer la reproductibilité de vos travaux de recherche est proposée par eLife, une organisation à but non lucratif qui propose des outils et documents pour encourager les comportements les plus responsables.

De nombreux outils existent pour aider les personnes n'ayant aucune connaissance en programmation à réaliser des graphiques statiques et interactifs pour des articles scientifiques. Ces outils permettent d'explorer différentes manières de visualiser les données et de produire des graphiques de bonne qualité pour publications.
Parmi ces outils on peut citer :

Interactive dotplot vous permet de créer des dot plots, des box plots, des violin plots et des combinaisons de ces graphiques,

Interactive line graph vous permet de créer des graphes linéaires interactifs,

Interactive repeated experiments dotplot vous permet de fabriquer des dotplots interactifs pour des expériences répétées indépendantes.

Choisir un mode de publication

Différents modes de publication existent. Des informations complètes sont disponibles sur le site CoopIST de la délégation à l'intégrité scientifique du Cirad.

Vous pouvez par exemple choisir de publier un préprint de votre publication avant de publier dans un journal après revue par des pairs. Les serveurs de prépublication sont utilisés pour publier une version préliminaire de votre publication avant de la soumettre à une revue à comité de lecture. Publier ainsi permet de partager des résultats et de rendre son travail accessible plus rapidement.

Un guide pratique sur les prépublications a été publié par le consortium néerlandais des bibliothèques universitaires et la bibliothèque nationale des Pays-Bas (UKB), l'association des universités des Pays-Bas (VSNU) et le conseil néerlandais de la recherche (NWO). Dans ce guide, vous trouverez en particulier des informations très pratiques sur les différents serveurs de préprints, comment publier un préprint, comment préparer un préprint, comment réviser un préprint, comment lier un préprint à un article publié dans une revue.

Parmi les serveurs de préprints on citera notamment :

, un serveur de preprints pour la biologie

, un serveur de préprints pour les sciences de la santé

OSFPreprints de l'Open Science Framework, pour toutes les disciplines

Vous pouvez choisir de publier dans une revue en libre accès.

Une liste des journaux en Open Access qui obéissent à certaines normes de qualité a été réalisée par le Berlin Institute of Health. Cette liste vous permet de retrouver les revues en accès libre adaptées à votre domaine de recherche et vous donne des informations, pour chaque revue ,sur les coûts et les délais moyens de publication.

Le Directory of open access journals (DOAJ) propose une base de données plus approfondie et complète de revues en libre accès pour tous les domaines de recherche. Les revues doivent être évaluées pour leur qualité avant d'être répertoriées sur DOAJ.

Vous pouvez publier dans une archive ouverte même si vous n'avez pas publié dans une revue en libre accès (souvent après une période d'embargo). Les informations utiles sont disponibles sur le site ouvrir la science.
HAL est une archive ouverte pluridisciplinaire destinée au dépôt et à la diffusion d'articles scientifiques, publiés ou non, et de thèses, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, et de laboratoires publics ou privés. HAL-Inserm est le portail Inserm de cette archive.

Pensez à sélectionner des revues de qualité et éviter les revues prédatrices. Des dizaines de milliers de revues existent et de nouvelles revues sont lancées chaque jour. Parmi ces revues, il y a près de 15 000 revues prédatrices : avant de soumettre un article, il est donc indispensable de vérifier la qualité du journal. Une checklist pour vérifier que le journal auquel on pense soumettre son article est un journal de qualité a été proposée par le collectif international " Think check submit ". De même, Coop'IST propose des outils pour aider à détecter les revues et éditeurs prédateurs.

Une vidéo vous permettra de mieux comprendre les aspects financiers de la publication scientifique.

Écrire le manuscrit

Écrire le manuscrit c'est aussi s'assurer qu'il comporte suffisamment d'informations pour être reproduit. Des guidelines de reporting pourront vous aider. Par exemple,
How to integrate reporting guidelines in your journal's workflow
Ten simple rules for writing research papers , Zhang, 2014

Partager et diffuser

Le journal Nature offre un service pour vous aider à répondre à vos questions sur le partage et la mise à disposition des données de la recherche.

Un FAQ sur les politiques concernant les données de recherche est disponible sur le site de Nature : Research data policies FAQs.

Il existe également un guide pratique pour celles et ceux qui ne savent pas où déposer leurs données : Data repository guidance.

Enfin, vous trouverez un ensemble de ressources sur les déclarations de disponibilité des données sur le site de Nature : Data availibility statement : guidance for authors and editors.

Communiquer

L'Inserm a publié un petit guide de conseils sur l'usage des médias sociaux qui s'adresse à tous les personnels qui souhaitent s'exprimer et partager leurs connaissances sur un média social, quel qu'il soit : Guide pour un bon usage des médias sociaux.

Chaque jour ou presque, des résultats d'enquêtes épidémiologiques sont portés à la connaissance du public, commentés dans les médias, sur la blogosphère, ou fondent des décisions politiques. L'Inserm vous propose un document d'aide à la " traduction " de notions courantes et parfois complexes de l'épidémiologie, définies et illustrées à l'aide d'exemples concrets : Diffuser des connaissances en épidémiologie.

Archiver les données

Vous trouverez un ensemble de ressources sur le site Coop'IST et sur le site de DoRANum.

Partager les données

Le partage des données de recherche est très utile car il permet la réutilisation des données, la synthèse des données individuelles. Ce partage est également important pour améliorer la reproductibilité de la recherche. De nombreux gouvernements (dont le gouvernement français), revues et institutions scientifiques encouragent à ce partage.

A noter que, s'il s'agit de données portant sur des personnes, des règles spécifiques s'appliquent, et une analyse éthique rigoureuse est nécessaire.

Quelques règles simples pour renforcer l'utilité de vos données :

Une application, Shiny, a été conçue par le centre QUEST (Charité-Berlin) pour aider les scientifiques du secteur biomédical à identifier le format de publication le plus approprié pour leurs données.

Pour déposer vos données de recherche ouvertes et citables dans une archive appropriée, des référentiels vous permettent de télécharger tout le matériel lié à votre projet de recherche - donc non seulement la publication mais également les données associées ou les scripts d'analyse.

Zenodo - Un référentiel à accès ouvert à usage général développé dans le cadre du programme européen OpenAIRE et exploité par le CERN. Cet entrepôt permet de déposer des documents de recherche, des ensembles de données, des logiciels de recherche, des rapports et tout autre artefact numérique lié à une recherche. Pour chaque soumission, un identifiant d'objet numérique persistant (DOI) est créé, ce qui rend les éléments stockés facilement citables. Il n'a pas de limite de taille.
https://zenodo.org/
Figshare - Un entrepôt polyvalent permettant de mettre à disposition des documents, des données, des résultats de recherche non traditionnels. Des fichiers jusqu'à 20 Go peuvent être téléchargés.
https://figshare.com/
Open Science Framework - Un entrepôt pour enregistrer des documents et des données de votre projet de recherche avant et après la publication.
https://www.cos.io/products/osf

Écrire un plan de management des données

Des recommandations FAIR ( Findability, Accessibility, Interoperability, and R euse of digital assets) pour la gestion des données scientifiques ont été publiées et l'INSERM soutient ce mouvement. Ces recommandations ont pour objectifs d'améliorer la repérabilité, l'accessibilité, l'interopérabilité et la réutilisation des actifs numériques. Les principes mettent l'accent sur l'actionnabilité par la machine (c'est-à-dire la capacité des systèmes informatiques à trouver, accéder, interagir et réutiliser des données avec aucune ou une intervention humaine minimale) parce que les humains s'appuient de plus en plus sur le support informatique pour traiter les données en raison de l'augmentation du volume de la complexité et la vitesse de création des données.
https://www.go-fair.org/fair-principles/ https://www.nature.com/articles/sdata201618
Un guide de rédaction, rédigé par l'université de Paris, ayant pour vocation d'accompagner les responsables de projets dans la rédaction de plans de gestion de données de la recherche ( Data Management Plans, DMP) est disponible en ligne. La structure proposée tient compte du cycle de vie des données, de leur création dans le cadre d'un projet de recherche jusqu'à leur archivage. Elle s'appuie également sur divers modèles de plans de gestion de données tels que celui de la National Science Foundation (NSF) ou de l'Interuniversity Consortium for Political and Social Research (ICPSR). Ce guide intègre en particulier les attendus de la Commission européenne dans le cadre d'Horizon 2020 et du FAIR data management.
http://www.bu.parisdescartes.fr/doc/recherche/Realiser_un_DMP_V2_2018_Def_HRS4R.pdf

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Mener un projet de recherche - Lorier - INSERM

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Dans cette boîte à outils, vous trouverez des ressources pour vous aider à améliorer la qualité de vos recherches, à accroitre leur transparence et leur reproductibilité, et à assurer la valeur des résultats produits. Les ressources proposées s'appliquent aux différentes étapes d'un projet de recherche, depuis la conception jusqu'à la publication et la diffusion des connaissances obtenues, sans oublier le partage des données.

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Warning: Your browser does not support JavaScript - RANDOM.ORG may not work as expected

Advisory: We only operate services from the RANDOM.ORG domain. Other sites that claim to be operated by us are impostors. If in doubt, contact us.

What's this fuss about true randomness?

Perhaps you have wondered how predictable machines like computers can generate randomness. In reality, most random numbers used in computer programs are pseudo-random, which means they are generated in a predictable fashion using a mathematical formula. This is fine for many purposes, but it may not be random in the way you expect if you're used to dice rolls and lottery drawings.

RANDOM.ORG offers true random numbers to anyone on the Internet. The randomness comes from atmospheric noise, which for many purposes is better than the pseudo-random number algorithms typically used in computer programs. People use RANDOM.ORG for holding drawings, lotteries and sweepstakes, to drive online games, for scientific applications and for art and music. The service has existed since 1998 and was built by Dr Mads Haahr of the School of Computer Science and Statistics at Trinity College, Dublin in Ireland. Today, RANDOM.ORG is operated by Randomness and Integrity Services Ltd.

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RANDOM.ORG offers true random numbers to anyone on the Internet. The randomness comes from atmospheric noise, which for many purposes is better than the pseudo-random number algorithms typically used in computer programs.

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Vous pouvez également  télécharger le livre en version électronique.

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Comment pouvez-vous savoir qu'un traitement est meilleur qu'un autre ou que les preuves concernant les bénéfices et les risques d'un traitement sont fiables ? Les recherches actuelles répondent-elles à vos questions ? Si ce n'est pas le cas, que pouvez-vous faire pour que les recherches sur les traitements soient plus pertinentes pour vous ?
Tester les traitements en version interactive (TTi) est destiné aux patients, aux professionnels de santé et à toute personne s'intéressant à ces questions.

Ce site internet vous aidera à comprendre l'importance des essais contrôlés des effets des traitements et à savoir comment les mettre en pratique.

Avertissement :

Ce site ne traite pas des traitements spécifiques ou des problèmes de santé, mais de la façon dont tous les traitements doivent être évalués. Pour obtenir des renseignements à jour sur les problèmes ou les traitements spécifiques, nous recommandons:
Les résumés Cochrane en français Le fardeau du traitement
Afin d'améliorer la prise en charge des malades, il est nécessaire de trouver des traitements efficaces et moins contraignants. Vous pouvez aider la recherche en participant à une étude sur le fardeau du traitement.

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Bienvenue dans Tester les traitements en version interactive

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Comment pouvez-vous savoir qu'un traitement est meilleur qu'un autre ou que les preuves concernant les bénéfices et les risques d'un traitement sont fiables ? Les recherches actuelles répondent-elles à vos questions ? Si ce n'est pas le cas, que pouvez-vous faire pour que les recherches sur les traitements soient plus pertinentes pour vous ?

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Logiciel intuitif, gratuit et open source de statistiques. Basé sur R. Préférentiellement statistique bayésiennes.

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JASP - Free and User-Friendly Statistical Software

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JASP is an open-source statistics program that is free, friendly, and flexible. Armed with an easy-to-use GUI, JASP allows both classical and Bayesian analyses.

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Sonal est un logiciel gratuit d'analyse qualitative.

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Sonal est un logiciel gratuit d'enquête qualitative. Il vous permet de collecter, d'organiser, de transcrire et d'analyser des fichiers audio/vidéo. La présentation ci-dessous fait le point sur ses fonctionnalités.

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Registre des registres d'essais clinique

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Registre des registres d'essais clinique

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D'après l'OMS

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WHO’s primary role is to direct international health within the United Nations’ system and to lead partners in global health responses.

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Présenter ses données sous formes d'un cercle montrant des relations. Logiciel : ici

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Découvrez les méthodes statistiques dans un environnement wiki, utilisez l'outil de comparaison des méthodes pour comparer les méthodes entre elles, découvrez quelle méthode adaptée est à utiliser avec l'outils de sélection de méthodes.

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Practice Environment. Large and dynamic question base.

Our question base includes many statistical subjects. A lot of questions are dynamic and change after a correct answer is given, allowing infinite exercise. Made a mistake or need help? No worries, hints and extensive explanations are available on request. Explanations are dynamically tailored to each question and answer, and help you understand a subject step-by-step. Go to our practice environment...

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Statkat - Online help and support in learning statistics

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Our question base includes many statistical subjects. A lot of questions are dynamic and change after a correct answer is given, allowing infinite exercise. Made a mistake or need help? No worries, hints and extensive explanations are available on request. Explanations are dynamically tailored to each question and answer, and help you understand a subject step-by-step.

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Carte pour expliquer des données qualitatives. Aide à l'installation et utilisation par le CESAR de l'UdeM.

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Cmap Products

Cmap products empowers users to construct, navigate, share and criticize knowledge models represented as concept maps. View our products to see how you can utilize our software in your work, studies, or research.

Learn About Concept Maps

Concept maps are graphical tools for organizing and representing knowledge in an organized fashion. Learn what concept maps are, how to construct them, and use them.

Cmaps Around the World

Cmap software is used by individuals, schools, and institutions all around the world. See a variety a of uses of concept mapping and Cmap software by users of all ages.

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Cmap Products Cmap products empowers users to construct, navigate, share and criticize knowledge models represented as concept maps. View our products to see how you can utilize our software in your work, studies, or research. Learn About Concept Maps Concept maps are graphical tools for organizing and representing knowledge in an organized fashion.

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Collection de graphiques simples réalisés avec D3.js.
qui est une bibliothèque JavaScript pour la manipulation de documents basés sur des données.

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The D3 Graph Gallery – Simple charts made in d3.js

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The D3 graph gallery displays hundreds of charts made with D3.js, always providing the reproducible code.

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Il s'agit d'un site web qui tente de présenter toutes les visualisations de données pertinentes, afin que vous puissiez trouver la bonne visualisation et vous inspirer de la manière de les réaliser.

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Collection of data visualizations to get inspired and find the right type

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Classification des types de graphiques basée sur le format des données d'entrée, présenté sous la forme d'un arbre de décision menant à un ensemble de visualisations potentiellement appropriées pour représenter l'ensemble des données. Renvoie aux codes avec R et autres outils.

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From data to Viz | Find the graphic you need

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A classification of chart types based on their input data format.

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Le site Carrefour communication scientifique de l’Université du Québec présente les bonnes pratiques en communication scientifique, à l’aide de guides, de conseils, de gabarits et de grilles de critères d’évaluation. Les différents aspects de création d'une affiche scientifique (poster) ou d’une communication scientifique à l’oral abordés ici vous permettront de compléter efficacement toutes les étapes du processus menant à leur réalisation.

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Aller au contenu principal

Il semble que vous utilisez Internet Explorer 11 ou une version antérieure. Ce site Web fonctionne mieux avec les navigateurs modernes tels que les dernières versions de Chrome, Firefox, Safari et Edge. Si vous continuez avec ce navigateur, vous pouvez vo

La communication scientifique est au cœur du métier d'étudiant et de ses productions, pourtant c'est une tâche en soi qui mérite d'en apprendre les rudiments et les codes.

Le site Carrefour communication scientifique de l'Université du Québec présente les bonnes pratiques en communication scientifique, à l'aide de guides, de conseils, de gabarits et de grilles de critères d'évaluation. Les différents aspects de création d'une affiche scientifique (poster) ou d'une communication scientifique à l'oral abordés ici vous permettront de compléter efficacement toutes les étapes du processus menant à leur réalisation.

Le site et les ateliers sur la communication scientifique ont été développés par les professionnels des bibliothèques de l'Université du Québec pour guider les premiers pas des étudiant·es dans leurs productions scientifiques. Il découle d'une initiative du Groupe de travail de la Promotion du développement des compétences informationnelles (PDCI) de l'Université du Québec.

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Aller au contenu principal Il semble que vous utilisez Internet Explorer 11 ou une version antérieure. Ce site Web fonctionne mieux avec les navigateurs modernes tels que les dernières versions de Chrome, Firefox, Safari et Edge.

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Auteur : Lucas Morin. Les trames proposé par l'auteur sont disponible en bas du thread.

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Thread by @lucasmorin_eolc on Thread Reader App

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@lucasmorin_eolc: Comment créer un poster pour un congrès (en ~45 minutes) ? Un thread 👇 Pourquoi cette soudaine envie de partager quelques astuces sur Twitter ? Parce que je suis fatigué de voir les doctorant(e)s, ...…

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Logiciel libre de dessin en vectoriel.

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Inkscape est un logiciel professionnel de dessin vectoriel pour Windows, Mac OS X et GNU/Linux. Il est libre et gratuit.

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Comment paraphraser, faire des assertions, et synthétiser la littérature

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Comment paraphraser, faire des assertions, et synthétiser la littérature

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Developing Your Scholarly Voice: How to Paraphrase, Make Claims, and Synthesize Literature

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Ce site indique les étapes et critères de qualité à produire pour une recherche qualitative. Il convient toujours de renforcer la méthode par des ouvrages plus spécifique traitant du design qui est envisagé.

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Qualitative Research Guidelines Project.Using Qualitative Methods in Healthcare Research.A Comprehensive Guide for Designing, Writing, Reviewing and Reporting Qualitative Research.The Robert Wood Johnson Foundation has sponsored the Qualitative Research Guidelines Project to develop a web-site that…

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Ce site indique les étapes et critères de qualité à produire pour une recherche qualitative. Il convient toujours de renforcer la méthode par des ouvrages plus spécifique traitant du design qui est envisagé.

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Qualitative Research Guidelines Project.Using Qualitative Methods in Healthcare Research.A Comprehensive Guide for Designing, Writing, Reviewing and Reporting Qualitative Research.The Robert Wood Johnson Foundation has sponsored the Qualitative Research Guidelines Project to develop a web-site that…

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Retrouver les données à jours par pathologies

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Data pathologies est un site d'open data et de datavisualisation des données de l'Assurance Maladie sur la prise en charge des pathologies en France.

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Se prononce sur :

La finalité et la méthodologie de la recherche

La nécessité du recours à des données de santé à caractère personnel

La pertinence éthique

La qualité scientifique du projet

Le cas échéant sur le caractère d'intérêt public que présente le projet.

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Le CESREES a été créé à la parution du décret d’application de la loi informatique et libertés le 15 mai 2020 et de l’arrêté de nomination de ses membres le 9 juin 2020. Son règlement intérieur porté par un arrêté en date du 5 mai 2021 précise son fonctionnement.

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Le livre : en achat en ligne ici
Un résumé, téléchargeable ici

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Assieds-toi et écris Ta thèse ! Trucs pratiques pour la rédaction scientifique

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Choisir, publier, réviser.. guides simples et utiles

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Browse our free eBook guides to help you in your publishing journey.

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Fonctionne sous environnement android.

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Simple, Robust and Powerful Tools
For Data Collection

Created by users for users

Build, Collect, Analyze — Online or Offline

Easy Form Creation

Used in the most demanding contexts

Features

Form Builder

Design forms quickly and easily using our intuitive form builder

Reuse existing questions and blocks of questions and manage them in the question library

Build complex forms with skip logic and validation

More than 20 different question types available including location, image, video, rating, matrix, etc.

Easily share projects with colleagues and set granular permission levels

Import and export XLSForms Import via URL or upload from your computer

Collect Data

Online and Offline

On phones, tablets or any browser Using KoBoCollect on Android devices and Enketo on any modern browser

Synchronize data via SSL Ensures data can't be read by a third party

Strong safeguards against data loss Even on very long interviews

Data immediately available right after it's collected

Analyze and Manage Data

Create summary reports with graphs and tables and fine-tune your report's charts, colors and questions

Visualize collected data on a map includes a heatmap, clustering, other base layers, etc.

Disaggregate data in reports and mapsi.e. by gender, region or educational level

Export all your data at any time Supported formats: Excel, CSV, KML, ZIP (for media) and SPSS

Access your data through our robust API

Get Started

Get started with KoBoToolbox now: it's free, and it takes under a minute. We have two publicly-available instances of KoBoToolbox you can choose from:

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Unlimited Submissions
Unlimited Data Storage
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Provided by KoBoToolbox
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For more information on the differences between the two servers and to help determine which one is right for you, please read our Which Server Should I Use? support article.

Advanced users can also install KoBoToolbox on their own server (or on a local machine) using Docker. See our kobo-install repository on GitHub for details.

Open Source Development supported by

with additional support from

About KoBoToolbox

KoBoToolbox is a suite of tools for field data collection for use in challenging environments. Our software is free and open source. Most of our users are people working in humanitarian crises, as well as aid professionals and researchers working in developing countries. Our teams of developers and researchers are based in Cambridge, MA and many other places around the world.

Quickly collecting reliable information in a humanitarian crisis – especially following a natural disaster such as a large earthquake or a typhoon – is the critical link to saving the lives of the most vulnerable. Understanding the population’s needs is often neglected for lack of quick means to gather and analyze this crucial information. KoBoToolbox was created as a free and open-source toolkit for data collection and analysis in humanitarian emergencies and other challenging environments to address this urgent need. KoBoToolbox is funded entirely through generous grants and donations from our partners.

We localize our products using Transifex.

Development

Our work is open-source. For more on our projects and to learn how you can contribute, visit our organization page on GitHub.

Our Team

Phuong Pham co-founder

Patrick Vinck co-founder

Tino Kreutzer chief operating & innovation officer

John Milner lead developer

Alex Dorey systems architect

Alexander Mtembenuzeni knowledge transfer specialist

Anji Tong developer

David Burke developer

Hadeel Tawfik user engagement specialist

Ignacio Giménez-Rebollo design lead

Jacqueline Morrissette developer

Joshua Beretta developer

Kalyan Lama user support lead

Leszek Pietrzak front-end lead

Mae-Lin DeLange communications associate

Olivier Leger back-end lead

Phil Edwards developer

Stephane Aloo support specialist

We test our products using BrowserStack.

Examples from the field

KoBoToolbox is used by many organizations and researchers in a variety of contexts all over the world.
Here are a few examples of KoBoToolbox in action:

Support

For issues, questions, ideas, or to read anouncements on new releases, please head to our community forum at

community.kobotoolbox.org

To learn how to get started, read help articles, or watch tutorials, please head to our help page at

support.kobotoolbox.org

You can also follow us on Twitter for product updates, media mentions and service notices. For any other inquires or just to get in touch, please email info@kobotoolbox.org

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KoBoToolbox | Data Collection Tools for Challenging Environments

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Data Collection Tools for Challenging Environments

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- Vidéo présentation
- Utilisation par une chercheuse

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What are Page Credits?

When you begin using Lateral and add PDF files, it uses up 'Page Credits' based on how many pages are in your PDFs. You start with 1,000 Page Credits when you join. Once you use them all, you'll have to get a subscription plan, called Lateral Supreme, to get more Credits. If you delete any documents, this will not return Credits.

If you have a Supreme subscription, you can buy extra Credits.

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Lateral - Streamline Your Research Workflow

# data[].attributes.attachment_link.description
Seamlessly Search, Save and Organise findings across your papers.Complete your research up to 10x faster.

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Trouver des serious games ou animation d'ateliers.

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Nous souhaitons développer la transmission des connaissances avec l’usage (entre autres) des Serious Games. Le secteur des Serious Games (numérique, présentiel, ou phygital, ....) étant en pleine croissance depuis plusieurs années, nous avons décidé de recenser les bases de Serious Games disponibles en ligne.
Vous trouverez sur cette page un ensemble de bases de Serious Games,

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Webinaires : Clinical Outcome Assessment

# data[].attributes.subject
Webinaires : Clinical Outcome Assessment

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
The National Health Council hosted a 12-part webinar series on Clinical Outcome Assessment (COA), intended to help the patient community better equip itself to engage with regulators, researchers, and other stakeholders to drive patient centeredness across health care research, but especially medical product development.

As a part of the 21st Century Cures legislation and the Prescription Drug User Fee Act VI Reauthorization, the FDA committed to develop four guidances on Patient-Focused Drug Development - focusing on identifying outcomes that are important to patients and on COAs more specifically.

COAs "measure a patient's symptoms, overall mental state, or the effects of a disease or condition on how the patient functions" - in short, COAs tell you something about how a patient feels or functions. The COA umbrella includes several different types of outcomes: patient-reported outcomes (PROs), clinician-reported outcomes (ClinROs), observer-reported outcomes (ObsROs), and performance outcomes (PerfOs).

View the webinar recordings here:

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Clinical Outcome Assessment (COA) Webinar Series - National Health Council

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The National Health Council hosted a 12-part webinar series on Clinical Outcome Assessment (COA), intended to help the patient community better equip itself to engage with regulators, researchers, and other stakeholders to drive patient centeredness across health care research, but especially medical product development.

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La Conférence Nationale des Comités de Protection des Personnes (CNCP) est une association de loi 1901 regroupant les Comités de Protection des Personnes (CPP), Comité d’Ethique de la Recherche en France.

Les CPP ont pour mission de donner un avis sur les projets de recherche impliquant la personne humaine (RIPH) au regard notamment de la protection des personnes se prêtant à la recherche. L’avis des CCPPRB était consultatif, l’avis des CPP vaut autorisation, c’est-à-dire que la recherche ne peut pas être engagée en cas d’avis défavorable d’un CPP.

Les CPP sont en outre sollicités pour donner un avis sur les projets d’utilisation d’éléments et de produits du corps humain à des fins scientifiques au cours des RIPH ou faisant l’objet d’un changement de finalité.

La CNCP, dont les statuts ont été déposés en 1992, est une association relevant de la loi de 1901.

Les Comités de Protection des Personnes (CPP) ont été mis en place par la loi du 9 août 2004 relative à la politique de santé publique, ils remplacent les Comités Consultatifs de Protection des Personnes dans la Recherche Biomédicale (CCPPRB) créés  par la loi du 20 Décembre 1988.

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Conférence Nationale des Comités de Protection des Personnes - CNCPP

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La Conférence Nationale des Comités de Protection des Personnes regroupe les comités d'Ethique de la recherche en France.

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Design et méthodologie des essais cliniques

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Design et méthodologie des essais cliniques

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Préface

La rédaction d'un livre blanc et sa diffusion constituent des actions de communication qui confinent parfois au marketing. Ici, rien de cela. Rédigé par un groupe d'expert dans une période où les éléments les plus simples et les plus évidents de la méthodologie des essais cliniques sont parfois remis en cause ou à tout le moins oubliés, ce livre blanc a été construit comme un guide pratique pour le lecteur préoccupé de la juste évaluation des médicaments. Dans ce contexte, ce document apporte une vue d'ensemble sur les éléments qui justifient les conditions de réalisation des essais cliniques contribuant ainsi à affiner le regard critique sur les conditions de mise à disposition de nouveaux médicaments. Bien qu'assez technique sur plusieurs aspects, ce document reste néanmoins accessible à un large lectorat, les plus aguerris ou les plus curieux trouveront dans les documents compagnons des éléments supplémentaires pour les aider dans la compréhension de tel ou tel point particulier. Enfin, ce livre blanc a aussi pour but de désacraliser la méthodologie des essais cliniques qui ne doit pas rester l'apanage de quelques initiés mais bien devenir ou redevenir un outil largement diffusé, dont les préceptes demeurent indispensables à l'évaluation des médicaments et des thérapeutiques non médicamenteuses. Pour faciliter la diffusion de ce livre blanc, nous avons fait le choix de le rendre disponible à tous sans restriction. Il me reste alors à vous en souhaiter une bonne lecture et à vous demander de bien vouloir le partager avec toute personne préoccupée de près ou de loin par l'évaluation clinique des médicaments.

Dominique DEPLANQUE
Président de la SFPT

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La rédaction d'un livre blanc et sa diffusion constituent des actions de communication qui confinent parfois au marketing. Ici, rien de cela. Rédigé par un groupe d'expert dans une période où les éléments les plus simples et les plus évidents de la méthodologie des essais cliniques sont parfois remis en cause ou à tout le moins oubliés, ce livre blanc a été construit comme un guide pratique pour le lecteur préoccupé de la juste évaluation des médicaments.

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Evaluer une source, un article, une référence

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Evaluer une source, un article, une référence

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Foutaisomètre (" Bullshit-o-meter ") : liste de contrôle gamifiée pour évaluer les sources académiques

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GitHub - pmartinolli/TM-bullshitometer: Bullshit-o-meter (" Foutaisomètre ") : gamified checklist to assess academic sources

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Fiche en français (PDF), fichier source (*.PUB) Translated in English (PDF), Original source file (*.PUB) Évaluer une source avec une grille d'analyse quantifiée et ludifiée. Chaque élément apporte ou retire du crédit à une source, selon une échelle numérique qui va de -10 à +5. Pour : Aller plus loin que le simple oui/non.

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Outils permettant d'évaluer si une revue est fiable ou s'il s'agit d'une revue prédatrice.

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Are you suspicious of a journal's authenticity? Is it a predatory journal?

These are legitimate questions if you're invited to submit a paper that:

promises your rapid publication;

has procedures and/or policies that look suspicious;

is outside of your area(s) of expertise.

Compass to Publish

helps you determine the degree of authenticity of open access journals requiring or hiding article processing charges (APCs) using a criteria-based evaluation

aims to help the scholarly community to better understand predatory journals and publishers

offers a transparent methodology and weighing method

is not designed for open access journals that explicitly state that they do not require article processing charges (APCs)

does not evaluate the quality of a journal, but its degree of authenticity

does not pretend to offer an exhaustive list of criteria for the identification of predatory journals

does not pretend to offer a formal evaluation in a few clicks, but aims to involve researchers in a critical and analytical process

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Are you suspicious of a journal's authenticity? Is it a predatory journal? These are legitimate questions if you're invited to submit a paper that: promises your rapid publication; has procedures and/or policies that look suspicious; is outside of your area(s) of expertise.

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L'accélérateur des revues systématique (SRA) se compose de plusieurs outils d'automatisation, et permet d'accélérer plusieurs étapes du processus de la revue systématique : recherche de références, le filtrage et la rédaction des résultats de la RS.

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The Systematic Review Accelerator project is based at the Bond University Institute for Evidence-Based Healthcare. The aim is to reduce the amount of time it takes to construct a Systematic Review without impacting quality

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Livres, guides, références utiles et pas seulement pour les revues systématiques.

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Plateforme pour frappe et retranscription (gratuite)

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Plateforme pour frappe et retranscription (gratuite)

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A free HTML5 app to take the pain out of transcribing interviews. Useful for journalists, academics and anyone else transcribing audio. And it's open source, too.

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Outils gratuit qui n'est pas toujours précis mais permet de dégrossir la retranscription.

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360Converter provides different kinds of converters, primarily focusing on video, audio, speech and voice to text. You can transcribe video, audio, speech and voice file, which could be local file, internet file, or even file in cloud storage, Google Drive and Dropbox. YouTube video is also supported by simply copying & pasting YouTube video URL. Totally 13 languages are supported at this moment.

The transcript could be retrieved in text, docx, pdf and srt format. You can either download it directly, or send it to your or someone else's email box.

Offline Version

As there are too many conversion requests, each user now is allowed to transcribe short segment of file each time to serve as many users as possible for online version for free usage. To get ride of such limitation, and for sake of user's file privacy, 360converter developed Offline version - 360Converter Offline Transcriber software which could be installed locally in user's computer with which user does not need upload file to anywhere and no need wait in the queue.

Services

Besides the services listed below, you can check all Services provided by 360Converter.

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360Converter - transcribe video and transcribe audio in easy way

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360Converter provides different kinds of converters, primarily focusing on video, audio, speech and voice to text. You can transcribe video, audio, speech and voice file, which could be local file, internet file, or even file in cloud storage, Google Drive and Dropbox. YouTube video is also supported by simply copying & pasting YouTube video URL.

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Listing des revues présumées non prédatrice par Sorbonne Université

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Les publications dans des revues médicales et scientifiques sont la principale source d'information en médecine et elles contribuent au développement individuel des carrières des professionnels de santé. L'avènement des publications en libre accès s'est accompagné d'une multiplication de pratiques douteuses, voire frauduleuses, de la part d'éditeurs peu scrupuleux, motivés par les gains financiers résultant du paiement par les auteurs. Les revues dites " prédatrices " (ou illégitimes ou frauduleuses) constituent une menace croissante et mondiale, dupent les auteurs et les lecteurs, et participent à la mauvaise conduite scientifique. Le Code européen de conduite pour l'intégrité de la recherche et la Charte des facultés de médecine indique que le fait d'établir ou de soutenir des revues qui sapent le contrôle de la qualité de la recherche constitue une faute scientifique et une pratique inacceptable.

Une revue prédatrice est une revue qui ne suit pas les recommandations internationales des éditeurs de revues scientifiques et qui a comme priorité le profit réalisé aux dépens de toute considération de qualité de ce qui est publié. L'évaluation préalable critique et indépendante par les pairs est absente ou falsifiée, la vérification de la conformité éthique et réglementaire de la recherche ignorée ou négligée, et le processus d'évaluation de la qualité scientifique absent ou déficient. Ces revues ont le plus souvent une politique agressive et sans discernement de sollicitation des articles.

Toutefois, il n'y a pas aujourd'hui de définition pragmatique et consensuelle de ce qui est ou n'est pas une revue prédatrice ( https://www.nature.com/articles/d41586-019-03759-y) et les tentatives d'établir une liste des revues prédatrices ont été un échec. La Faculté de médecine de Sorbonne Université a constitué une liste non exhaustive de revues scientifiques, présumées non prédatrices et dans lesquelles il est recommandé de soumettre des articles pour publication.
Cette liste est centrée sur les domaines de la santé, de la médecine, et de la biologie sans se prononcer sur d'autres domaines scientifiques où notre expertise collective est moindre, et aux revues de langues anglaise et française. La présence d'une revue dans cette liste n'est pas non plus une garantie contre la publication d'articles médiocres ou ne respectant pas les principes de l'intégrité scientifique. Il s'agit seulement une indication pour l'auteur ou le lecteur que la revue scientifique qui y figure semble bien conforme aux exigences de qualité et d'intégrité prônées par la faculté de médecine. Pour une revue qui n'y figurerait pas, l'auteur est engagé à vérifier la qualité de celle-ci. Cette liste s'applique à nos étudiants pour les mémoires et thèses, est utile pour la citation de références et pour la participation à l'activité éditoriale d'une revue. Cette liste n'est pas figée mais destinée à être révisée régulièrement car elle peut involontairement inclure des revues prédatrices ou des revues qui le deviendrait et afin d'inclure de nouvelles revues. La faculté de Médecine de Sorbonne Université préconise également le dépôt des prépublications et des manuscrits en libre accès dans les archives ouvertes gérées ( https://hal.sorbonne-universite.fr/) par notre bibliothèque universitaire, en conformité avec la Charte pour le libre accès aux publications adoptée par Sorbonne Université en 2019.

A l'heure où la recherche et la parole scientifique sont volontiers malmenées, la faculté de médecine de Sorbonne Université espère ainsi initier une démarche positive pour le respect de l'intégrité scientifique et que cette liste s'efface un jour devant une liste nationale consensuelle, ou mieux devant un label européen de qualité des revues scientifiques.

Nous remercions tous les collègues qui ont participé à cette œuvre collective que nous croyons utile dans ces temps où la recherche et la parole scientifique sont parfois malmenées. Notre espoir est d'entraîner dans cette démarche l'ensemble des Faculté de santé et les différentes sous-sections du CNU qui participent au recrutement de nos jeunes hospitalo-universitaires.
Pr. Christian Funck-Brentano, référent intégrité scientifique Pr. Florence Tubach, présidente de la commission de déontologie et d'intégrité scientifique Pr. Bruno Riou, doyen
Faculté de médecine Sorbonne Université

Paris, le 3 septembre 2021

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Constitution et évolution de la liste des revues scientifiques La liste, a été constituée entre les mois d'octobre 2020 et mai 2021 et comporte plus de 3400 revues présumées non prédatrices et donc considérées comme acceptables pour y publier ses travaux, citer un travail en référence, y exercer une activité éditoriale, ou participer au processus d'évaluation par les pairs.

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Julien Bouix is compilating tools and advices for healthcare and nursing research.

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Julien Bouix is compilating tools and advices for healthcare and nursing research.

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Hey 👋 I just created a page here. You can now buy me a coffee!

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Diapason est une banque de contenus utiles pour améliorer ses connaissances sur les reférences, citations et styles.
L'outil bibliographique permet de comparer les styles et voir les différentes façon d'écrire les bibliograhie (APA et Vancouver).

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Boîte à outils : Intruments et méthodes de recherche-action

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IDoStatistics veut soutenir les chercheurs et les professionnels dans cette tâche ardue : comprendre quelles sont les meilleures techniques statistiques pour répondre aux questions de recherche, sans se perdre dans l'océan des inévitables difficultés. Un certain nombre de ressources sont mises à la disposition de tous les utilisateurs désireux d'accroître leur propre expertise.

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Statistics, systematic reviews, and meta-analysis are fascinating but also complex tools. Every day, researchers and professionals need to enhance their statistical expertise, both to conduct their own studies as well as to interpret correctly the available evidence. This is a necessary process in order to produce high quality scientific evidence and to make informed decisions in the daily practice.

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Permet une certification à la française

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Pix est un projet public de plateforme en ligne d' évaluation et de certification des compétences numériques.

Son objectif est d'accompagner l'élévation du niveau général de connaissances et de compétences numériques et ainsi de préparer la transformation digitale de l'ensemble de notre société et de notre économie.

Accès à la page Présentation du Pix.

Pix se décompose en 5 domaines subdivisés en 16 compétences.

Chaque compétence possède actuellement 5 niveaux (à terme 8).

Accès à la page Structure.

Si vous êtes en première année, vous irez aux Formations obligatoires de pré-rentrée.

Après vous être inscrit, vous suivrez la formation qui vous préparera à la certification.

Après celle-ci, vous obtiendrez un certificat et un score.

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Pix est un projet public de plateforme en ligne d' évaluation et de certification des compétences numériques. Son objectif est d'accompagner l'élévation du niveau général de connaissances et de compétences numériques et ainsi de préparer la transformation digitale de l'ensemble de notre société et de notre économie.

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Comment mieux appréhender les enjeux liés à la recherche scientifique ?

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Comment mieux appréhender les enjeux liés à la recherche scientifique ?

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À l'instar d'Indiana Jones, les chercheurs sont des stars de l'exploration, car analyser des phénomènes à partir d'observations constitue leur passion et est l'essence de leur métier. Examiner, décrire, modéliser, prévoir, identifier des causes et en expliquer les raisons... La recherche scientifique est consubstantielle des notions de progrès et d'innovation. C'est la raison pour laquelle, le métier de chercheur s'inscrit dans une volonté absolue de rigueur, d'exigence, de précision où il est important de se remettre sans cesse en question. Soumis à de fortes valeurs déontologiques et à une codification encadrée, l'activité de recherche nécessite l'adoption de lignes de conduites spécifiques.

Si vous êtes enseignant-chercheur, chercheur, doctorant ou post-doctorant, nous vous proposons six formations qui pourront vous être utiles dans votre activité professionnelle.

La formation " Intégrité scientifique dans les métiers de la recherche " adopte une démarche de sensibilisation aux différentes problématiques liées à l'intégrité scientifique. Produit par l' Université de Bordeaux, elle a pour objectif d'amener l'apprenant à s'interroger sur les comportements nécessaires à appliquer lors d'une recherche scientifique intègre et responsable. Dans un premier temps, la formation poussera l'apprenant à découvrir les principaux enjeux liés à l'intégrité scientifique, puis l'apprenant sera alerté sur les mécanismes conduisant aux manquements à l'intégrité scientifique. Pour finir, elle aura pour objectif d'inciter les chercheurs ou aspirants chercheurs à adopter une démarche exigeante et critique.
Ouverture des inscriptions jusqu'au 17 août 2022.

La formation de l' Université Paris-Saclay " Introduction à la statistique avec R " s'adresse aux étudiants et praticiens de toutes disciplines qui recherchent une formation pratique afin d'apprendre la statistique à l'aide du logiciel libre R. Le recours aux mathématiques est minimal. L'objectif est de savoir analyser des données, de comprendre ce que l'on fait, et de pouvoir communiquer ses résultats. Il sera utile à toute personne ayant le besoin d'analyser un jeu de données réel dans le cadre d'un enseignement, de son activité professionnelle ou de recherche, ou par simple curiosité d'analyser un jeu de données par soi-même (données du web, données publiques...). Les méthodes abordées sont les techniques descriptives, les tests, l'analyse de variance, les modèles de régression linéaire et logistique, les données censurées (de survie).
Ouverture des inscriptions jusqu'au 21 mars 2022

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Doctorants : quels outils pour vous aider dans votre recherche ?

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À l'instar d'Indiana Jones, les chercheurs sont des stars de l'exploration, car analyser des phénomènes à partir d'observations constitue leur passion et est l'essence de leur métier. Examiner, décrire, modéliser, prévoir, identifier des causes et en expliquer les raisons... La recherche scientifique est consubstantielle des notions de progrès et d'innovation.

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Colandr est une plateforme en ligne en libre accès, assistée par l'apprentissage automatique, qui permet de réaliser des examens et des synthèses de preuves textuelles (articles, documents, etc.).
Plus d'informations : ici

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App gratuite, open-source et basée sur le web pour faciliter le filtrage des citations pour les revues systématiques. Le programme comprend deux composantes : un outil d'annotation basé sur le Web qui permet aux participants à une revue de filtrer les citations de manière collaborative pour en vérifier la pertinence, et des technologies d'apprentissage automatique qui semi-automatisent ce processus.

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Grey literature and their sources - Students 4 Best Evidence

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What is grey literature, what are the advantages and disadvantages of using it, and how can you find it? Learn more in this blog.

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Outil d'aide à la décision permettant d'estimer le temps nécessaire à une revue systématique ou à une carte systématique. (utile pour decrire le temps requis dans un protocole ou une demande de subvention).

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(gratuite et avancée payante)

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Revues en Sciences humaines et sociales ouvertes

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OpenEdition gathers OpenEdition Books, OpenEdition Journals, Hypotheses.org and Calenda, four platforms dedicated to electronic resources in the humanities and social sciences. OpenEdition est un portail de ressources électroniques en sciences humaines et sociales (OpenEdition Books, OpenEdition Journals, Hypothèses, Calenda).

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Retrouvez ici les avis et décisions officielles rendus par la Haute Autorité de santé ou l’une de ses commissions.

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Tous les appels à projet en un seul site !

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Le service d'alerte mail permet d'être informé des nouvelles offres de financement en lien avec vos thématiques de recherche. La mise à jour est hebdomadaire.
Pour cela, il suffit de renseigner le formulaire ci-dessous avec votre adresse e-mail et de choisir vos thématiques d'intérêt.
Pour tout complément d'information, vous pouvez consulter la FAQ, ou bien nous contacter par e-mail thesaurus@girci-est.fr

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Le Thésaurus des Appels à projets est un annuaire dynamique recensant différentes offre de financement. Il s'adresse à tous les professionnels de la recherche en santé. Il permet également de s'incrire à un système d'alerte mail afin de recevoir directement les offres dans les thématiques de recherche d'intérêt

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Ensemble de mesures centrées sur la personne pour évaluer comment les gens se sentent et fonctionnent.
--> Liste des questionnaires traduits en français (des frais sont appliqués pour les utiliser).

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The Patient Reported Outcomes Measurement Information System (PROMIS®) is a set of person-centered measures to assess how people feel and function. PROMIS uses advances in information technology, psychometrics, and qualitative, cognitive, and health survey research to measure patient reported outcomes such as pain, fatigue, physical function, emotional distress, and participation that have a major impact on quality-of-life across chronic diseases. Self reported and parent-reported measures in adults and children are available.

To learn more about PROMIS and why to use it, visit HealthMeasures. Try a PROMIS Computer Adaptive Test (CAT) here.

PROMIS tools measure how adults and children feel and function. Try a PROMIS Computer Adaptive Test here.

To Obtain and Administer PROMIS Measures in Canada

English versions are available here.

French versions of many measures are available by contacting us directly. To request any other language, please contact translations [at] HealthMeasures.net . Note that French and other available languages are subject to a distribution fee.

Please note that PROMIS measures cannot be translated without permission. Be sure read the Terms and Conditions of Use here for more information.

Interested in contributing to PROMIS? We are looking for researchers who want to participate in:

translation, validation and adaptation of PROMIS into French for use in Canada

validation in different patient groups

implementation of PROMIS across care settings

development of additional item banks

For information on availability and use of French translations of PROMIS, please contact susan.bartlett [at] mcgill.ca or .
PROMIS International includes activities conducted by US PROMIS researchers and international partners. Drs. Susan Bartlett and Sara Ahmed at McGill University are leaders of the PROMIS Canada initiative and are members of the PROMIS International Steering Committee and PROMIS Health Organization Board of Directors.
PROMIS Resources

Information about the PROMIS family of measures(PROMIS, Neuro-QOL, ASCQ-ME, NIH Toolbox) can be found here.

Information about scoring and interpreting PROMIS is available here.

The PROsetta Stone initiative has established links between PROMIS scores and legacy measures for depression, anxiety, physical function, pain, fatigue, global here and others. Linking tables are available here.

Learn more about PROMIS measurement science and PROMIS validation - can be found here and here.

Programs and sessions from past PROMIS Health Organization scientific meetings, workshops, and upcoming events can be found here.

Learn more about how to select patient reported outcomes (PRO) here and here.

For more on data collection tools you can use with PROMIS, click here.

For a list of PROMIS publications, click here.

Read The User's Guide to Implementing Patient-Reported Outcomes in Clinical Practice developed by the International Society of Quality of Life (ISOQOL) here.

Read about Patient-Reported Outcomes in Performance Measurement here.

Contact Us
*HealthMeasures is the official information and distribution center for PROMIS, Neuro-QoL™, NIH Toolbox®, and ASCQ-Me®, which were developed and evaluated with National Institutes of Health (NIH) funding. PROMIS, Patient-Reported Outcomes Measurement Information System, and the PROMIS logo are marks owned by the U. S. Department of Health and Human Services.
Canada PRO Initiative
McGill University
Division of Clinical Epidemiology
Centre for Outcomes Research and Evaluation
5252 de Maisonneuve, #3D.57
Montreal, Quebec H4A 3S5

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What is PROMIS? The Patient Reported Outcomes Measurement Information System (PROMIS®) is a set of person-centered measures to assess how people feel and function. PROMIS uses advances in information technology, psychometrics, and qualitative, cognitive, and health survey research to measure patient reported outcomes such as pain, fatigue, physical function, emotional distress, and participation that have a major impact on quality-of-life across chronic diseases.

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Pour résumer automatiquement ou extraire des données d’articles

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Summarize anything, understand complex research, and organise your knowledge with Scholarcy.

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Centrée sur les sciences humaines et sociales

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ISIDORE est un moteur de recherche permettant l'accès aux données numériques des sciences humaines et sociales (SHS).

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Accedez à leurs ressources !

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The Oxford Centre for Evidence-Based Medicine (CEBM) develops, teaches, promotes and disseminates better evidence for health care.

With a global reputation for evidence-based medicine research and learning, our international programmes support clinicians, students and professionals across all areas of health care, as well as policy makers, patients and the public.

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With a global reputation for evidence-based medicine research and learning, our international programmes support clinicians, students and professionals across all areas of health care, as well as policy makers, patients and the public.

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Guide d'extraction et analyse de données en vue d'une méta-analyse

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Guide d'extraction et analyse de données en vue d'une méta-analyse

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Extracting data for meta-analysis can be very frustrating because authors often don't report the summary data that you want, that is, the same statistics and the right statistics for the meta-analysis software e.g. mean and standard deviation. There are some great resources for data extraction to help you convert data from what's reported into what you want, but perhaps randomised trials are better served (for example, by the excellent Cochrane Handbook) than other study designs. There are other resources but they're scattered around and are sometimes not accessible to all those who may want to carry out meta-analysis, as some methods involve complicated equations.

The aim of this resource is to provide a series of useful tips on data extraction, to shed light on, and raise awareness of the different methods and equations that are available to convert data into what you need for meta-analysis. I'll also try to demystify the maths by giving worked examples and only offering the derivation of the equations as an optional extra.

The data that you will be looking to extract, to input into meta-analysis software, will depend on the outcome and these data will typically be:

Diagnostic accuracy

Numbers of true positives, true negatives, false positives and false negatives of the diagnostic test

Dichotomous

Number and number with the outcome in each group

OR

ln(x) and its standard error, where ln is the natural log and x is odds ratio, relative risk or hazard ratio

Continuous

Number, mean and standard deviation of the outcome for each group

This resource is a directory of tips arranged into four groups. Many of these tips have been summarised in a 4-part series of articles about extracting diagnostic accuracy data, extracting categorical risk data, combining and converting groups (relating to continuous data) and summarising good practice guidelines for meta-analysis.

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A series of tips for data extraction in meta-analysis, compiled by Dr Kathy Taylor

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Start up française

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CleanWeb

Open Clinica

Ennov clinical

Easy-CRF

RedCap :  résumé vidéo (4 min) et Ressources de formation .

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Article explicatif

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Ecrire une thèse, répondre à un appel à projet, etc...

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Are you doing Honours, MPhil or a PhD? Writing a thesis, exegesis or a publication? Learn how you can manage a research project from start to finish and communicate its significance with authority.

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Are you doing Honours, MPhil or a PhD? Writing a thesis, exegesis or a publication? Learn how you can manage a research project from start to finish and communicate its significance with authority.

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Recense tous les articles en accès libre.

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(Pluggin payant de Nvivo)

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Put NVivo Transcription to the test, with 15 minutes free

Upload 15 minutes of audio to NVivo Transcription to get started.

We employ powerful automated transcription technology to deliver accurate transcripts that
can easily be annotated and used in your data analysis.

Don't hesitate to get started: your trial minutes expire 90 days from sign up.

Start your trial

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Put NVivo Transcription to the test, with 15 minutes free Upload 15 minutes of audio to NVivo Transcription to get started. We employ powerful automated transcription technology to deliver accurate transcripts that can easily be annotated and used in your data analysis. Don't hesitate to get started: your trial minutes expire 90 days from sign up.

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Une version d'iramuteq compatible avec R 4 et Mac OS X Catalina est en ligne - IRaMuTeQ 0.7 alpha 2 2020 - 05/11/2020

Présentation

Iramuteq est un logiciel libre distribué sous les termes de la licence GNU GPL (v2).

Il permet de faire des analyses statistiques sur des corpus texte et sur des tableaux individus/caractères.

Il repose sur le logiciel R (www.r-project.org) et le langage python (www.python.org)

Analyses sur des corpus texte

Iramuteq reproduit la méthode de classification décrite par Reinert (1983, 1991) (Classification Hiérarchique Descendante sur un tableau croisant les formes pleines et des segments de texte);

Recherche de spécificité à partir de segmentation définie;

Statistiques textuelles classiques;

Analyse de similitude sur les formes pleines d'un corpus découpé en segments de texte;

Consultez la documentation pour connaître toutes les analyses disponibles dans Iramuteq.

Analyses sur des tableaux individus / caractères

Classification Hiérarchique Descendante avec l'algorithme décrit par Reinert (1983) ;

Classification Hiérarchique Descendante par matrice des distances;

Analyse de similitude;

Description et chi2;

IRaMuTeQ est développé au sein du LERASS

IRaMuTeQ est soutenu par le labex SMS

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Une version d'iramuteq compatible avec R 4 et Mac OS X Catalina est en ligne - IRaMuTeQ 0.7 alpha 2 2020 - 05/11/2020 Iramuteq est un logiciel libre distribué sous les termes de la licence GNU GPL (v2). Il permet de faire des analyses statistiques sur des corpus texte et sur des tableaux individus/caractères.