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Titulada en Zoología y Genética por la Universidad de Wisconsin y Doctora en Genética por la Universidad de California-Berkeley.

Catedrática de biología de la Universidad de Massachusetts y codirectora del departamento de biología planetaria de la NASA.

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A últimos de los años 60, el físico británico James Lovelock, con el respaldo científico de Lynn Margulis, lanzó la polémica y célebre hipótesis de que la Tierra y todos sus seres vivos constituyen una entidad compleja autorregulada, al que llamaron Gaia

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Fue la mayor de las cuatro hijas de Morris Alexander y Leone Wise Alexander. Se crio en el seno de una familia judía, sionista.

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Margulis fue autora de la teoría de la simbiogénesis, que explicaría el origen de las primeras células con núcleo a partir de la fusión de bacterias primitivas hace miles de millones de años.

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Propone que las Células Eucariotas (células de animales, plantas, hongos y protoctistas) se habrían originado a partir de diferentes células procariotas (sin núcleo) mediante una relación simbiótica que llegó a ser permanente.

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Propusieron una clasificación de los seres vivos en cinco reinos a partir de la simbiogénesis:

Monera.

Protoctistas.

Plantas.

Animales.

Hongos.

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Autora de casi 200 artículos de todo tipo.

Miembro de la Academia nacional de las Ciencias de Estados Unidos desde 1983, de la Academia Rusa de Ciencias Naturales desde 1997 .

En 1999 recibió la Medalla Nacional de Ciencia.

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Cinco reinos (1985)

El origen de la célula (1988)

Microcosmos (1995)

Biosferas: metamorfosis del planeta tierra (1995)

Qué es la vida? (1996)

Evolución ambiental: efectos del origen y evolución de la vida sobre el planeta Tierra (1996)

¿Qué es el sexo? (1999)

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Casada desde 1957 a 1965 con el astrónomo Carl Sagan. Tuvieron dos hijos, Dorion Sagan y Jeremy Sagan.

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Lynn Margulis falleció en Amherst el 22 de noviembre de 2011, cinco días después de sufrir un derrame cerebral.