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La extracción maderera afectó históricamente la región. El quebracho, un árbol emblemático y Especie Forestal Nacional, fue fuertemente explotado entre los s. XIX y XX. Hoy, debido a la expansión de la frontera agropecuaria: el Gran Chaco ya perdió más de medio millón de hectáreas, y el desmonte continúa. Por ello, debemos estar atentos a la desforestación que esta región enfrenta y promover la creación de más áreas protegidas.

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Muchas especies encuentran su distribución austral en la porción Argentina del Gran Chaco. Entre ellos, grandes animales emblemáticos como el yaguareté y el tatú carreta, se encuentran en peligro crítico de extinción para nuestro país. El oso hormiguero y el tapir también están entre la fauna típica de la ecorregión, junto a monos, coatíes, zorros y comadrejas.

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El Gran Chaco Americano es la ecorregión de bosques más extensa del continente después del Amazonas y la más grande de América del Sur. Allí se encuentran más de 3400 especies de plantas; 500 especies de aves; 150 de mamíferos, como el oso hormiguero, y más de 200 reptiles y anfibios.

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Los glaciares presentan un gran reservorio de agua dulce. Los efectos del cambio climático afectan gravemente sus condiciones naturales y las reservas de agua que existen en esta región.

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La fauna altoandina está igualmente adaptada a las duras condiciones ambientales de la montaña. Entre los vertebrados más típicos se pueden mencionar aves como el cóndor andino, varias especies de camineras, bandurritas, gauchos, dormilones, yales, comesebos, y cabecitas negras; anfibios como el sapo andino y varios saurios endémicos y mamíferos como el chinchillón, chinchillas y zorro colorado. Numerosos componentes altoandinos también son comunes a las regiones de la Puna y la Estepa Patagónica.

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Debido a las condiciones extremas del clima imperante en esta ecorregión, con muy bajas precipitaciones, vientos muy fuertes, baja temperatura, precipitaciones en forma de nieve y granizo en todo el año, la vegetación presenta una alta adaptación.