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En 1674 el biólogo holandés Antón van Leeuwenhoek examinó con sus lentes de microscopio una gota de agua, descubriendo un mundo formado por diminutos animálculos. 100 años después el biólogo danés Otto Müller amplió los estudios de van Leeuwenhoek clasificando las bacterias en género y especie con los métodos de Carlos Linneo.

En 1840 el anatomopatólogo alemán Friedrich Henle quiso demostrar que los microorganismos eran causantes de enfermedades dando inicio a la “teoría de los gérmenes” que en los años setenta y ochenta sería confirmada por Robert Koch y Luis Pasteur.

La quimioterapia comenzó en 1910 con el químico alemán Paul Ehrlich quién descubrió el primer compuesto antibacteriano efectivo contra la sífilis, en 1928 se descubrió la penicilina por Alexander Fleming, en 1935 la sulfanilamida por Gerhard Domagk y en 1943 la estreptomicina por Selman Waksmanen.

En 1946 el microbiólogo estadounidense John Enders fue el primero en cultivar virus para el desarrollo de vacunas.

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Los microorganismos pueden subdividirse en: virus, bacterias, hongos y parásitos.

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Son las partículas infecciosas de menor tamaño, con un diámetro de 18 hasta casi los 300 nm

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Los virus están formados por ácido desoxirribonucleico (ADN) o ácido ribonucleico (ARN), no por ambos a la vez, así como proteínas necesarias para su replicación y patogenia. Se encuentran rodeados por una capa de proteína asociada o no a la envoltura membranosa lipídica.

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Son parásitos cuya replicación exige la existencia de una célula anfitriona, los virus causan una infección que puede ocasionar la replicación rápida y la destrucción celular o llegar a una relación crónica latente en la que el virus se integra en el genoma del organismo anfitrión.
Las enfermedades causadas por virus pueden variar desde algo común hasta cuadros clínicos mortales.

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Son microorganismos procariotas unicelulares sencillos.
La pared celular que rodea a las bacterias es compleja y existen 2 formas básicas:

Pared celular grampositiva:  gruesa capa de peptidoglicano.

Pared celular gramnegativa: delgada capa de peptidoglicano así como una membrana externa

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Algunas bacterias carecen de pared celular y compensan su ausencia sobreviviendo peor de las células del organismo anfitrión en un ambiente hipertónico.

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de 1 a 20 Jim o más, se tienen en el agua, el aire, los alimentos y algunos pueden ser avirulentos o potencialmente mortales.

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Mientras algunas relaciones parasitarias son temporales, otras habitan permanentemente el organismo humano.
La enfermedad puede deberse a los efectos tóxicos de los productos bacterianos (toxinas) o la invasión de regiones corporales que acostumbran a ser estériles.

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Son células eucariotas más complejas pues poseen un núcleo, mitocondrias, aparato de golgi y retículo endoplásmico.
Pueden existir en forma :

Unicelular (levadura):  se replica de manera asexual.

Filamentos (moho): se replica de forma asexual y sexual.

Dimorficos: tienen ambas morfologias, levadura y moho.

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De 1-2 nm de diámetro que es el tamaño de muchas bacterias, hasta los artrópodos y cestodos que llegan a medir hasta 10m de largo.

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Son de mayor grado de complejidad pues se trata de eucariotas, algunos unicelulares y otros pluricelulares con un ciclo de vida complejo, pues algunos establecen una relación permanente con el ser humano y otros atraviesan etapas de desarrollo en una serie de anfitriones animales.

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La importancia del estudio de los microorganismos es conocer las enfermedades que provocan y el modo de controlarlas, pues aunque los microorganismos rara vez provocan una enfermedad bien definida, existen algunos que lo hacen o varios microorganismos pueden producir una misma enfermedad; la mayoría de los microorganismos sólo provoca enfermedad en unas condiciones bien definidas.

Infecciones exógenas: Algunas enfermedades aparecen cuando un individuo se expone a los microorganismos a través de de fuentes externas.

Infecciones endógenas: La mayor parte de enfermedades del ser humano son por infección de microorganismos presentes en su microflora que se diseminan a localizaciones de organismos donde pueden producir enfermedades.

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El resultado final de la interacción del microorganismo con el cuerpo humano, se encuentra determinado por la virulencia del microorganismo, el lugar de exposición y la capacidad de respuesta del organismo anfitrión. Es por eso que los síntomas pueden ser leves o llegar hasta la muerte del individuo.
El organismo humano cuenta con distintas barreras que impiden la invasión de los microorganismos, las respuestas innatas reconocen patrones moleculares característicos de los componente microbianos y activan los mecanismos de defensa local y las respuestas inmunitarias especificas que actúan contra el microorganismo con el propósito de eliminarlo.
se puede mejorar la prevención de la infección con potenciar el sistema inmunológico con la transferencia pasiva de anticuerpos incluidos en preparaciones de inmunoglobulinas o mediante la vacunación con componentes microbianos (antígenos)

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Los microorganismos pueden modificar su estructura antigénica (variación genética) o desarrollar resistencias frente a los antibióticos.

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El laboratorio de microbiología clínica desempeña el diagnostico y control de las enfermedades infecciosas a base de muestras recogidas de los pacientes. solo estudia los microorganismos capaces de producir enfermedades y los fármacos antimicrobianos medicamente mas significativos.