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https://docs.google.com/presentation/d/1DTFCtL1YOdt4C4snE5-kSy8PmdFoWxLM_GdGY1e0HFw/edit#slide=id.p9

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El espectro electromagnético es la representación de las ondas propagadas en el vacío, determinadas por ciertas longitudes de onda, del conjunto total de ondas del espectro; Sobre este espectro se basa la espectrofotometría, la cuál es útil para medir la concentración de ácidos nucleicos. Esto se puede hacer comparando la turbidez de la muestra contra un blanco transparente, se incide un haz de luz en la muestra y posteriormente, se determina a cierta longitud de onda su concentración empleando diversos algoritmos.

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--TAE: tiene una menor capacidad de amortiguación que el TBE, y puede resultar en una acidificación del medio si la electroforesis se desarrolla durante un periodo muy prolongado.
--Bromuro de Etidio: es un agente intercalarte (se intercala entre las bases nitrogenadas) que se usa como colorante fluorescente para la visualización de ácidos nucleicos en geles de agarosa, pero ya no es usado por los riesgos mutagénicos.

--Buffer: Debe tener una alta densidad que permita que la muestra se introduzca en el pocillo del gel, además de colorantes que nos indiquen cuando debe detenerse la electroforesis.

--SYBR GOLD/Safe/Green: Colorante muy sensible con una elevada afinidad por el ADN, que puede detectar cantidades de tan sólo 20 pg de ADN. SYBR Green, también de alta sensibilidad, y el SYBR Safe, con una sensibilidad similar al BrEt pero menor capacidad mutagénica.

--Diamond stain: colorante súper sensible que se une al ADN monocatenario, bicatenario y al ARN, es estable en temperatura ambiente hasta por 90 días y no mutagénico.
--Red gel stain: colorante ambientalmente seguro, no mutagénico y muy sensible, es estable a temperatura ambiente y además apto para microndas.

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Se pueden usar instrumentos cómo:
--Transiluminador UV: funciona con rayos ultravioleta, lo que hace que el colorante fluorescente en la muestra ayude a apreciar los resultados.
--Fotodocumentador: combina la tecnología de la documentación de geles con la capacidad de detectar una señal quimioluminiscente mediante una cámara CCD super-enfriada, el ChemiDoc XRS+ le permite documentar geles de proteínas teñidos con colorantes fluorescentes.

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Se clasifican en función de la temperatura a la que se disuelven y solidifican.
--Las agarosas estándar se disuelven en el buffer a una temperatura de 90-95°C y solidifican a 35-45°C.
--Las agarosas de bajo punto de fusión se disuelven a unos 65°C y solidifican a 30-35°C.
-- Las agarosas de alta fuerza de gel o las de baja viscosidad, que permiten respectivamente una mejor separación y un rango inferior del tamaño de las moléculas a separar.

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era que una combinación de fuerzas eléctricas y de fricción permitiría el desplazamiento y separación en función del tamaño o topología de diferentes moléculas de ADN. Éste es exactamente el principio en que se basa la electroforesis de ácidos nucleicos. Sometidos a un campo eléctrico, la carga neta negativa del ADN y el ARN hará que estos se muevan en dirección al ánodo. 

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La idea de utilizar la técnica de electroforesis a través de una matriz para analizar muestras de ADN corresponde a él, era un bioquímico del Instituto de Virología de Glasgow.

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1.-Para preparar las muestras para la electroforesis, éstas se mezclan con componentes que les agregan densidad, como el glicerol o la sacarosa. Estos proporcionan a las muestras más densidad que la del tampón de electroforesis.
2.- Las muestras pueden entonces colocarse por medio de una micropipeta o pipeta de transferencia en las rendijas visibles en el gel con la ayuda de una plantilla.
3.- . El equipo de electroforesis se conecta a una fuente de corriente continua directa y se somete a tensión.
4.-Las moléculas de carga neta negativa migran hacia el electrodo positivo del aparato de electroforesis (ánodo), mientras que las moléculas de carga neta positiva migran hacia el electrodo negativo (cátodo).

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El gel se fabrica disolviendo polvo de agarosa en una solución tampón hirviente. A continuación, se deja enfriar la solución a 55°C y se vierte en un soporte, donde se solidifica. Se sumerge después el soporte en un equipo de electroforesis de electrodos que contiene solución tampón.

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Se utiliza comúnmente para separar moléculas en función de su carga, tamaño y forma. Se trata de un medio de separación especialmente eficaz para las biomoléculas cargadas como el ADN, el ARN y las proteínas.