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Para la contienda electoral de 1898, Sanclemente recibió el apoyo del presidente conservador Miguel Antonio Caro, al que había servido muy brevemente como ministro de Gobierno.

Ordeno la libertad de prensa en épocas de paz con la ley 51 en 1898

Inauguró el puente navarro de Honda, en Tolima, el 16 de enero de 1899

En 1900, a menos de dos meses de la deposición de Sanclemente, se dio la Batalla de palonegro, de mayo, con un saldo de 4.000 muertos, y que determinó el paso de los liberales a la guerra de guerrillas.

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En su gobierno tuvo que hacer frente tanto a la Guerra civil de los Mil Días (1899-1902), como a la separación de Panamá debido al tratado Herrán-Hay (1903).

Aprobó la reforma de la educación colombiana, mediante la ley 39 del 26 de octubre de 1903. Se organizó la educación estableciendo un sistema escolar y universitario, y dividiendo la enseñanza oficial en primaria, secundaria, profesional, industrial y artística.

Es considerado el gobierno mas nefasto ya que la economía alcanzó altos niveles de inflación y su administración fue corrupta. Su único logro fue la reforma a la educación.

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Reyes profesionalizó y modernizó a las fuerzas armadas.

En 1907 fundó la Escuela Militar de Cadetes de Bogotá y la Escuela Naval de Cartagena.

En 1909 fundó la Escuela Superior de Guerra.

En 1908 dividió al país en 34 departamentos y erigió a Bogotá como distrito capital.

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Creó varias instituciones importantes como la Cruz Roja Colombiana.

Enfrentó la crisis política que inició con la Primera Guerra Mundial, mantendiendo al país neutral.

Apoyó la exportación del café y luchó contra enfermedades tropicales.

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Suprimió los gastos que no obedecían a urgentes necesidades, o aplazó los que no fueran del servicio ordinario y la deuda nacional, la que observó con responsable interés.

También estableció gravámenes a distintas operaciones y varios productos, tendientes a incrementar la capacidad económica del gobierno para enfrentar la delicada perspectiva.

Se adelantaron algunas de las obras públicas iniciadas en anteriores administraciones, como varios ferrocarriles, el Capitolio Nacional, la línea telegráfica con Caquetá y la que unía a Bogotá con Arauca.

En el campo limítrofe, se firmó el tratado Suárez-Muñoz Vernaza, en julio de 1916, que fijó la línea fronteriza con Ecuador.

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Se efectuaron importantes reformas en materia de ordenamiento: el 27 de noviembre de 1918 se creó el impuesto sobre la renta.

El 5 de diciembre de 1919 se fundó en Barranquilla la empresa de aviación Sociedad Colombo Alemana de Transporte Aéreo (SCADTA), antecesora de la actual Avianca, que se inauguró en Julio de 1920 y que fue pionera en el transporte aéreo en America Latina.

Durante el mandato de Suárez se conmemoró el centenario de la batalla de Boyaca y se creó la Cruz de Boyacá, condecoración para oficiales del ejército que después se hizo extensiva a los civiles.

La difícil situación económica, unida a algún negocio personal muy criticado y a la permanente presión de la Cámara de Representantes, especialmente de Laureano Gómez, provocaron la renuncia de Suárez el 11 de noviembre de 1921.

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En su gobierno se dio la primera bonanza cafetera del siglo.

El ingreso de la indemnización por la pérdida de Panamá en 1903 por parte del gobierno de los Estados Unidos.

La consecuente reestructuración de la economía colombiana con ayuda de un comité experto que llegó a Colombia en 1923.

En el gobierno de Ospina se le dio el uso oficial al avión presidencial para realizar labores diplomáticas en distintos departamentos de Colombia.

Ospina fundó el llamado Banco Agrícola Hipotecario.

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Lo más notable de su administración fue la definición de los límites con Brasil en noviembre de 1928, Peru (mediante el tratado Lozano-Salomón, firmado en 1922 pero ratificado en marzo de 1928)

la soberanía de Colombia sobre el archipiélago de San Andres, Providencia y Santa Catalina por medio del tratado Esguerra-Bárcenas de marzo de 1928, donde también se indica que Colombia reconoce la soberanía de Nicaragua sobre la costa de Mosquitos.

En 1929 le correspondió enfrentar la crisis económica mundial y se fundó la Federación Nacional de Cafeteros.