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Los Principios que inspiran el accionar de la UPSJB SAC, son:
A.- Defender y ejercer la Autonomía Universitaria de acuerdo con la Constitución Política del Perú, las Leyes de la República y su Estatuto, adoptando su propio sistema de organización y gobierno tanto académico como administrativo.
B.- Buscar la verdad, la afirmación de los valores y el servicio a la comunidad estudiantil.
C.- Promover la libertad de pensamiento, de crítica, de expresión y de cátedra, con lealtad a los principios constitucionales y a los fines que le son propios.
D.- Formar profesionales dentro del proceso de enseñanza aprendizaje y de acuerdo con las necesidades que exige el desarrollo dentro del contexto de modernización, orientada a formar al hombre, al ciudadano, al profesional y al especialista, proporcionando una formación de calidad.
E.- Promover la investigación para proyectarlo a la comunidad a fin de contribuir al mejoramiento de la calidad de vida.
F.- Buscar constantemente la calidad educativa superior universitaria a través de acciones permanentes de evaluación y acreditación y con el apoyo de conferencias
G.- En la UPSJB SAC, el régimen de estudios a nivel de pregrado seguirá preferentemente el sistema semestral, por créditos y con currículo flexible en la modalidad presencial. A nivel de posgrado, el régimen de estudios será bajo créditos y con currículo flexible en la modalidad presencial.

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Misión:  La UPSJB tiene como misión ser una institución académica comprometida en formar profesionales con base ética y humanista, orientados al bienestar de la sociedad, aprobada mediante Resolución Nº 278-2019-CU-UPSJB de fecha 16/08/2019.

Visión: Ser una institución competitiva que es valorada por sus procesos formativos y por el impacto de sus profesionales en el bienestar de la sociedad.

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El primer Modelo Educativo de la Universidad Privada San Juan Bautista SAC elaborado en el año 2013 presenta una estructura que recoge las principales teorías de pedagogía considerado como Modelo ecléctico, holístico teniendo como punto de partida enfoques que permiten interpretar la direccionalidad de este, predominan las características de la flexibilidad y la multidisciplinariedad. En el año 2016 se revisa el Modelo Educativo tomando como punto de partida la integración a las normativas vigentes en referencia a la educación, Modelo de Licenciamiento Institucional de SUNEDU y el cumplimiento a las Condiciones Básicas de Calidad para la formación de nuestros egresados. sus valores y esquemas principales, la definición de las teorías en donde se respalda el modelo son actualizadas a los requerimientos de tecnología que hoy en día son necesarios para el desarrollo del proceso de enseñanza - aprendizaje. La adecuación recientemente realizada responde a cambios sustanciales para la articulación del sistema de enseñanza por competencias en la fase principalmente de medición de logros.

I.- Se señalan los niveles de medición de las competencias genéricas y específicas teniendo para la explicación de ello normas institucionales como la Directiva y Lineamientos de la Enseñanza por Competencias.
II.- A nivel de Investigación y responsabilidad social se define los niveles de medición de las Competencias en estos dos grandes aspectos, también del cuidado del medio ambiente, interculturalidad e identidad de género, entre otros.
III.- En referencia a los perfiles del estudiante, egresado y perfil docente se adecúan al componente tecnológico indispensable en este nuevo contexto de adaptación al formato remoto.
IV.- Finalmente en este Modelo Educativo se incorpora información general sobre los medios de implementación de este como herramientas e infraestructura tecnológica indispensable para el alcance de los logros propuestos en cada Plan de estudio.

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Desde sus inicios la UPSJB tiene como visión ser una Institución competitiva, formando profesionales en áreas claves para satisfacer parte de la demanda de formación superior universitaria a nivel nacional, adoptando esquemas de formación adecuados a las necesidades del país, aplicando en este proceso valores y principios éticos, aspirando a una educación de calidad, apoyada en infraestructura moderna y tecnología avanzada logrando así profesionales de éxito. Convencidos de que las universidades deben brindar un servicio educativo de calidad se establecieron vínculos con instituciones extranjeras expertas en Certificación de la Calidad, obteniendo la Certificación ISO 9001, para nuestros procesos de apoyo académico en: ❖ Gestión de recursos bibliográficos y servicios de biblioteca.
❖ Prestación del servicio de laboratorio de cómputo a la docencia, la investigación y la extensión.

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I.- LA DENOMINADA HACIENDA VILLA:

Perteneció a la familia de Don Jose Antonio Lavalle y posteriormente a la familia de los Pugas quienes fueron los últimos propietarios.

II.- 14 DE MARZO 1997:

El CONAFU aprueba el proyecto para la creación de la Universidad

III.- 8 DE ABRIL DE 1997:

Se da el inicio oficial de las actividades académicas: Medicina humana, Enfermería, Derecho, Cc Comunicación, Ing computación y sistemas, Administración de negocios.

IV.- 13 DE MAYO 1997:

Se inicia las clases con el primer grupo de alumnos pre universitarios.

V.- 7 DE ABRIL 1997:

Se realiza el primer examen de Admisión.

VI.- 15 DE SETIEMBRE 1997:

Inician finalmente las actividades académicas que congregaron a mas de 800 alumnos

VII.- Inicio del 2002:

Debido a la alta demanda de estudiantes se inaugura local en San Borja.

VIII.- 13 DE FEBRERO DEL 2006:

El CONAFU autoriza el funcionamiento de la filial chincha

IX.- 21 de AGOSTO DEL 2006:

El CONAFU autoriza el funcionamiento de la filial ICA

X.- INICIOS DEL 2014:

La Asociación Universidad privada San juan Bautista se convierte en Universidad Privada San Juan Bautista SAC.

XI.-06 DE NOVIEMBRE DEL 2019:

SUNEDU otorga el licenciamiento institucional motivo del esfuerzo logrado en los 22 años