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El Pasochoa es una caldera volcánica extinta, el cual a su forma del cráter y que ademas se encuentra parcialmente aislado, por años se ha formado un bosque andino muy bien conservado y sin intervención humana.  Hoy ese bosque es un santuario de la vida silvestre, que forma parte del Sistema Nacional de Áreas Protegidas y es el hogar de varias especies de flora y fauna pertenecientes al bosque andino, muchas de las cuales no se encuentran ya en ningún otra zona de los Andes.

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El refugio protege un parche de bosque único en el callejón interandino, que, gracias a su difícil acceso (dentro de la caldera) se ha salvado de ser destruido.
Toda el área que comprende el refugio, está destinada a la conservación, educación ambiental y turismo de naturaleza,
Ademas se encuentra rodeado de extensos campos agrícolas y ganaderos.

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El área se encuentra formada por cuatro zonas de vida de acuerdo a la reciente clasificación de la vegetación en Ecuador, siendo éstas:

Bosques húmedos montano alto.

Bosques húmedos montano bajo.

Páramos de pajonal.

Páramos de almohadillas.

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En el refugio de Pasochoa cohabitan más de 60 especies de árboles nativos, 232 especies de plantas, 128 especies de aves registradas, entre las que se destacan como el gallinazo y el cóndor; junto a 15 colibríes de las variadas formas, como el quinde tijereta de cola negra; o el quinde gigante el colibrí más grande del mundo.

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De entre las 232 especies de plantas se destacan las heliconias, bromelias, helechos y 23 especies de orquídeas. Entre las principales especies vegetales tenemos la cola de caballo, la hierba mora, la ortiga y el llantén.

El Refugio alberga 128 especies de aves, de las cuales 12 se encuentran únicamente en el bioma Andes del Norte. Una de las características más representativas es que en esta área se protege una población importante del mielero gigante.

Entre los mamíferos que se han registrado en Pasochoa se incluyen a el ratón marsupial,la musaraña ecuatoriana, el conejo andino,la zarigüeya común,el zorro de páramo, el zorrillo apestoso,la comadreja andina,el venado de cola blanca,el venado de páramo y el coatí andino, etc.