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1. Unidad Nacional de Acopio de Indicios y Evidencias.
VISIÓN: mantener la intergridad y autenticidad de los indicios y evidencias.

MISIÓN: tener un buen almacenaje y conservacion, custodia y trazabilidad de los indicios y evidencias.

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2. Unidad Nacional de Protección a Víctimas y Testigos.
VISIÓN: a travéz de la protección busca la colaboración con la justicia.

MISIÓN: otorgar proteccion a Victimas y Testigos dentro de un proceso penal.

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3. Unidad Nacional de Interceptación y Análisis de Telecomunicaciones.
VISIÓN: realiar inteceptaciones de comunicación de grupos delictivos.

MISIÓN: otorgar la información vinculante y dentro de un proceso penal y ademas de prevenir delitos.

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4. Unidad Nacional de Ciberdelito.
VISIÓN: investigar las denuncias de los delitos informaticos.

MISIÓN: otorgar ayuda a la investigación de los informaticos con elementos de convicción dentro del proceso penal.

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5. Unidad Nacional de Lucha Contra el Crimen Organizado.
VISIÓN: Combatir a nuevos entes criminales que siguen tomando campo dentro del país.

MISIÓN: la planificación, búsqueda, procesamiento y utilización de la información para producir inteligencia policial a fin de identificar, investigar, neutralizar y desarticular organizaciones del crimen organizado nacional y transnacional.

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6. Unidad Nacional de Interpol.
VISIÓN: ayudar con investigación a otras unidades.

MISIÓN: salvaguardar la seguridad nacional y regional, del flujo de mercancías ilícitas a lo largo de las rutas de tráfico dentro y alrededor del país.

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7. Unidad Nacional de Recepción de Información de Delitos.
VISIÓN: ayudar con la recepción de información de delitos por medios electrónicos.

MISIÓN: Recibir información ciudadana del cometimiento de los diferentes tipos de delitos por vía telefónica, correos electrónicos y otros medios, mejorando la orientación del esfuerzo de búsqueda y las estrategias en las investigaciones de tipo penal.

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8. Unidad Nacional de Registro y Sistemas Especializados.
VISIÓN: Ingresar registros filiatorios y biométricos de personas privadas de libertad por delitos de acción pública.

MISIÓN: Obtener, registrar, analizar y cotejar los elementos balísticos, muestras biométricas y datos encontrados en el lugar de los hechos, permitiendo identificar a una persona involucrada en infracciones penales, a fin de establecer los elementos de convicción en apoyo a la administración de justicia; además del registro de servidores públicos y guardias de seguridad privada que porten armas de fuego, mediante los sistemas tecnológicos especializados.

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9. Unidad Nacional de Detención de Personas de Alta Peligrosidad Requeridas por la Ley.
VISIÓN: Ejecutar acciones investigativas en el territorio nacional para la captura de requeridos por la ley que hayan sido considerados de alta peligrosidad y/o que estén dentro del programa "Los Más Buscados".

MISIÓN: Identificar, localizar y detener a los ciudadanos requeridos por la autoridad competente, que han sido considerados de alta peligrosidad y/o que conforman el programa "Los Más Buscados", en el ámbito nacional e internacional, mediante técnicas de investigación, a fin de establecer los elementos de convicción, en apoyo a la administración de justicia.

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10. Unidad Nacional de Investigación Antidelincuencial.
VISIÓN: establecer los elementos de convicción, en apoyo a la administración de justicia.

MISIÓN: Investigar delitos de acción penal pública conforme lo dispone la autoridad competente, mediante técnicas de investigación.

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11. Unidad Nacional de la Comunidad de Policías de América.
VISIÓN: Generar atención y respuesta a los requerimientos y actividades que se derivan de los acuerdos y compromisos adquiridos como miembro de Ameripol.

MISIÓN: Asesorar, coordinar y promover con la comunidad de policías de América en materia de cooperación técnico-científica policial, intercambio de información y asistencia judicial en delitos transnacionales, a través de acuerdos y mecanismos de cooperación, en favor de la seguridad ciudadana y el orden público.

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12. Unidad Nacional de Investigación de Delitos Transnacionales.
VISIÓN: Investigar a los integrantes de las organizaciones delincuenciales que hayan participado en el cometimiento de los delitos transnacionales declarados en el acuerdo de cooperación que rige para esta unidad.

MISIÓN: Investigar los delitos transnacionales en coordinación con el Departamento de Seguridad Nacional de los Estados Unidos, de acuerdo a los compromisos aceptados por el Estado ecuatoriano, conforme lo dispone la autoridad competente, mediante técnicas de investigación, a fin de establecer los elementos de convicción, en apoyo a la administración de justicia.

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1. Dirección Nacional de Investigación de Policía Judicial.
VISIÓN: Coordinar y gestionar con las autoridades competentes sobre el cumplimiento de las diligencias y procedimientos investigativos.

MISIÓN: Investigar delitos de ejercicio de la acción penal pública conforme lo dispone la autoridad competente, mediante técnicas especializadas de investigación, a fin de establecer los elementos de convicción para evitar la impunidad, en apoyo a la administración de justicia.

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2. Dirección Nacional de Investigación Antidrogas.
VISIÓN: Conocer las denuncias o informaciones que llegaren a su conocimiento, a través de las Unidades Operativas a nivel país, sobre la presunta perpetración de los delitos relacionados con la producción o tráfico ilícito de sustancias catalogadas sujetas a fiscalización, delincuencia organizada y delitos conexos.

MISIÓN: Investigar los delitos relacionados a la producción o tráfico ilícito de sustancias catalogadas sujetas a fiscalización y delitos conexos, conforme lo dispone la autoridad competente y la normativa legal vigente.

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3. Dirección Nacional de Investigación de Delitos Contra la Vida, Muertes Violentas, Desaparecidos, Secuestros y Extorsión.

VISIÓN: Conocer las denuncias o informaciones que llegaren a su conocimiento, a través de las Unidades Operativas a nivel país, sobre la presunta perpetración de los delitos relacionados a su misión y delitos conexos.

MISIÓN: Investigar los delitos y/o tentativas contra la vida, secuestro, extorsión y la desaparición de personas, conforme lo dispone la autoridad competente y la normativa legal vigente.

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4. Dirección Nacional de Investigación Contra la Violencia de Genero, Mujer, Familia, Niñez y Adolescencia.

VISIÓN: Investigar casos de infracciones cometidas por adolescentes, en casos de inviolabilidad de la vida, contra la propiedad, contra las personas, contra el derecho a la identidad, contra el derecho a la salud, contravenciones en general y otras infracciones cuando fuere necesario.

MISIÓN: Adoptar y ejecutar medidas preventivas y de investigación especializada en infracciones relacionadas con niños, niñas y adolescentes.

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5. Dirección Nacional de Investigación de Delitos Contra la Corrupción.

VISIÓN: Coordinar con la Fiscalía General del Estado y autoridades competentes, el manejo de la noticia criminal relacionada el cometimiento de un delito de ejercicio público de la acción penal.

MISIÓN: Investigar los delitos relacionados con el sistema financiero y económico, contra la administración aduanera, régimen de desarrollo y contra la eficiencia de la administración pública en coordinación de la Fiscalía General del Estado y la autoridad competente.

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6. Dirección Nacional de Investigación Técnico Científica Policial.

VISIÓN: Proporcionar a la administración de justicia informes técnicos científicos de carácter pericial y administrativo, en el ámbito de criminalística, accidentología vial y medicina legal, por medio del empleo de métodos técnicos y científicos.

MISIÓN: Coordinar y ejecutar la investigación técnico-científica operativa policial de la infracción en el ámbito de criminalística, accidentología vial y de medicina legal, bajo lineamientos, directrices que emita la máxima autoridad de la gestión operativa, técnica y científica, proporcionando los elementos de convicción que aseguren una certeza científica, bajo la dirección de la autoridad competente.