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Esta teoría está compuesta por cuatro partes. Para comenzar; asegura que toda la materia está hecha por átomos y, los mencionados antes son indivisibles. También dice que, los átomos de un elemento son idénticos en masa y propiedades.

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Thomson cuenta que, el átomo está compuesto por carga negativa en un átomo positivo, estando incrustados semejándose a un pudín. También habló sobre que los electrones se distribuían uniformemente en el interior del átomo.

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El átomo tiene un núcleo en el cual estaban concentradas las cargas positivas y toda la masa. Dijo que el átomo estaba vacío pero ocupado por electrones que orbitan alrededor del núcleo.

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Explicó que los electrones podían tener orbitas estables alrededor del núcleo y la razón de porqué los átomos presentaban espectros de emisión (siendo estos problemas ignorados en el modelo de Rutherford)

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Hasta el 1926 se consideraba que los electrones solo giraban en orbitas circulares alrededor del núcleo. También afirmó que los electrones podían girar en orbitas elípticas complejas.