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En general, la salida de un nervio craneal del tronco del encéfalo se utiliza aquí en referencia tanto a las fibras eferentes como aferentes del nervio se corresponde con la misma zona del tronco del encéfalo en la que se encuentran sus núcleos. Una excepción clara es el nervio trigémino, cuyos núcleos sensitivos forman una columna celular continua desde las regiones rostrales del mesencéfalo hasta la interfase bulbo-médula espinal.

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En etapas tempranas del desarrollo, los derivados de la placa basal que forman los núcleos motores de los nervios craneales del tronco del encéfalo tienden a formar columnas de células orientadas rostrocaudalmente. A medida que aumenta el tamaño del tronco del encéfalo estas columnas se hacen discontinuas.

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Los derivados de la placa alar que dan origen a los núcleos de los nervios sensitivos del tronco del encéfalo se localizan lateralmente al surcolimitante

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Los nervios craneales cuya salida se identifica habitualmente en el
bulbo incluyen desde el nervio hipogloso hasta el nervio abducens. En consecuencia, los nervios que generalmente se
asocian sólo al bulbo son los nervios hipogloso

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El núcleo del nervio hipogloso se localiza por dentro del trígono
hipogloso. Los axones de las motoneuronas del hipogloso se dirigen hacia adelante en el bulbo a lo largo de la cara lateral del lemnisco medial y de la pirámide para salir por el surco preolivar mediante una serie de raicillas que forman el nervio hipogloso.

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Este nervio craneal se ha descrito clásicamente formado por una
porción craneal en el bulbo y una porción espinal en la médula
cervical. No obstante, los estudios experimentales han demostrado que las neuronas que inervan los músculos esternocleidomastoideo y  trapecio sólo se localizan en la médula cervical; estos músculos no son inervados por motoneuronas localizadas en el bulbo

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Esquema de la parte superior de los nervios glosofaríngeo, vago y accesorio. Curso y distribución de los nervios glosofaríngeo, vago y accesorio espinal. El nervio vago o nervio neumogástrico es el décimo de los doce pares craneales nervios craneales.

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El nervio glosofaríngeo abandona el bulbo por el surco retrolivar inmediatamente rostral al nervio vago y sale del cráneo a través del foramen yugular junto a los nervios vago y accesorio. Al igual que el nervio vago, tiene dos ganglios: un ganglio inferior que contiene los somas AV y un ganglio superior que contiene los somas AS. Sus fibras motoras se originan en el núcleo salivar inferior y en el núcleo ambiguo .

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Los nervios craneales de la unión pontobulbar son el nervio vestíbulococlear , el nervio facial con una localización intermedia y de tipo mixto y el nervio abducens el más medial y exclusivamente motor. Existen tres razones por las que los nervios craneales  son considerados nervios de la unión pontobulbar.

1. En primer lugar, el núcleo motor del abducens y el núcleo motor del facial se encuentran en la unión pontobulbar

2.  En segundo lugar, en los seres humanos la salida de los tres nervios se localiza en el borde caudal del puente  De hecho, dos de los tres nervios facial y vestibulococlear abandonan el cráneo a través del mismo foramen.

3. En tercer lugar, desde una perspectiva de anatomía comparada, los nervios craneales VI, VII y VIII no emergen del bulbo.

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El octavo nervio craneal es el más lateral  de los nervios craneales del tronco del encéfalo y se relaciona centralmente con los núcleos cocleares posterior y anterior  y con los núcleos vestibulares medial, espinal "inferior", superior y lateral. Las dos porciones del VIII nervio craneal se originan a partir de receptores altamente especializados que se encuentran bien protegidos en la porción petrosa del hueso temporal

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Estas podrían llamarse con toda propiedad tumores del ángulo
pontocerebeloso porque la mayoría de las lesiones que se asientan en esta zona son schwannomas vestibulares alrededor del 85%,
meningiomas 5% al 10% o tumores epidermoides alrededor del 5%.

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El nervio facial es un nervio craneal mixto, es decir, contiene fibras sensitivas como motoras, presente en mamíferos incluyendo humanos en el cual forma el séptimo par craneal o VII par. Por ser un par craneal, emite dos fibras, una que corre por el lado derecho de la cara y el contralateral por la izquierda.

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El núcleo del nervio abducens se localiza profundamente al colículo facial . De hecho, esta estructura se encuentra en el suelo de la fosa romboidal inmediatamente lateral al surco medio y rostral a las estrías medulares del cuarto ventrículo. El núcleo del abducens contiene motoneuronas e interneuronas.

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El mayor de los nervios craneales del tronco del encéfalo, el nervio trigémino, sale por la cara lateral del puente . Consta de una gran raíz sensitiva porción mayor, unida al ganglio del trigémino, y de una pequeña raíz motora porción menor, que pasa de largo bajo el ganglio

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El nervio trigémino es un nervio mixto que posee componentes sensitivos y motores. Los tres núcleos sensitivos forman una columna celular continua que se extiende desde la unión bulboespinal hasta los niveles rostrales del mesencéfalo. El núcleo motor se localiza justo medial al núcleo sensitivo principal, aproximadamente a nivel mediopontino

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Los nervios craneales del mesencéfalo son el nervio troclear y el nervio oculomotor. Sus núcleos de origen se localizan adyacentes a la línea media
inmediatamente por delante de la sustancia gris periacueductal, ambos nervios son exclusivamente motores y, al igual que otros nervios también exclusivamente motores, salen del mesencéfalo próximos a
la línea media.

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El nervio troclear es el único nervio craneal constituido por axones que se han decusado en su totalidad antes de su salida. Así, por ejemplo, los axones que parten del núcleo del troclear del lado izquierdo se incurvan caudalmente a lo largo del borde lateral de la sustancia gris periacueductal para decusarse en la parte más anterior del velo medular superior y abandonar el mesencéfalo inmediatamente caudal al colículo inferior

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El núcleo del nervio oculomotor se localiza en la parte ventral de la sustancia gris periacueductal inmediatamente posterior al fascículo longitudinal medial y en la mitad rostral del mesencéfalo aproximadamente