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to store and query Media Wiki (known from wikipedia.org)

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Wikipedia software - well-known and tested

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About this site | About MediaWiki | Download | Help and support | Contribute

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International Plant Sentinel Network | Botanic Gardens Conservation International

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The increasing globalisation of trade in plants and plant material, together with the impacts of climate change, has led to an increase in the introduction and spread of new and damaging plant pests and pathogens. Past examples of the devastating impact these organisms can have on plant populations, such as Dutch elm disease on UK [...]

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Description of affected tree species

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* Media Wiki - YD
* I vote for Semantic MediaWiki cause it is an expended version of mediaWiki (Semantic MediaWiki  turns MediaWiki into a knowledge management platform with query and export capabilities) - FO
* Thanks! I search for options to easily integrate our work to Wikipedia like making a portal https://en.wikipedia.org/wiki/Template:Portal - YD

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This template produces a box with links to a portal or to multiple portals. It is most often used in the “See also” section of an article. If a portal does not exist, then it will not be displayed. As of December 11, 2021 (UTC), this portal template is now mobile-friendly, meaning that the portal li…

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Core I: Descriptions and knowledge about pathogens causing pests & diseases
Arthropodes DB available

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- in urban and/or rural areas
- locally (where?) or broadly - which countries or NUTS regions are affected

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Main padlet: https://padlet.com/johannawitzell/1ugq56jx1sof36gr

Website:
final public version: http://ub3guard.eu/

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Small, lightweight, handy, expandable, multilingual Wiki-engine. It's designed for speed and extensibility.

Includes a WYTIWYG editor, easy installer, many localizations, RSS autodiscovery, Links can be CamelCase or freely formed links using an intuitive two-character markup. Compatible with PHP 7.3 - 8.1 and MariaDB / MySQL.

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WackoWiki - Small, lightweight, handy, expandable, multilingual Wiki-engine. It's designed for speed and extensibility.

Includes a WYTIWYG editor, easy installer, many localizations, RSS autodiscovery, Links can be CamelCase or freely formed links using an intuitive two-character markup. Compatible with PHP 7.3 - 8.1 and MariaDB / MySQL.

News

2022-02-25: WackoWiki 6.1.7 released

2022-02-25: WackoWiki 6.0.29 released

Features

Easy installer

Full revision control

Powerful diff between revisions

Access control through per-page access control lists

What You Think Is What You Get editing

Integrated page commenting functionality

Page watching & email notification on changes/comments

Design themes (skins) support

Several cache levels

Uploads per page or global

Clusters & relative addressing

Automatic table of contents generation

On-the-fly correction of punctual typos & spec. characters

Completely multilingual

Full UTF-8 support

URI router

Template engine

Session handler

Manual

Community

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WackoWiki - Small, lightweight, handy, expandable, multilingual Wiki-engine. It's designed for speed and extensibility. Includes a WYTIWYG editor, easy installer, many localizations, RSS autodiscovery, Links can be CamelCase or freely formed links using an intuitive two-character markup. Compatible with PHP 7.3 - 8.1 and MariaDB / MySQL.

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Optimized for modern smartphone app programming and PC

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Make documentation a joy to write
using Wiki.js's beautiful and intuitive interface!

Easy Installation

You'll be ready to go within minutes! Step-by-step install guides available for all platforms.

Bundled with everything you need

Not all teams need the same set of features. That's why Wiki.js offers a wide range of modules that can be turned on/off on demand.

Open Source

It's not just about being free, it also means anyone can contribute new features and help squash bugs. Wiki.js is proudly licensed under AGPLv3.

Over 50+ integrations

Connect your wiki with an ever-expanding list of external integrations
for authentication, logging, rendering, search and storage.

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Get Started Install Anywhere!

Host it yourself or launch a pre-configured installation on a cloud provider.

Self-Hosted

Host it on your on-premise servers

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You'll be ready to go within minutes! Step-by-step install guides available for all platforms. It's not just about being free, it also means anyone can contribute new features and help squash bugs. Wiki.js is proudly licensed under AGPLv3. Git AWS Azure Google Cloud Facebook Algolia OpenID Host it yourself or launch a pre-configured installation on a cloud provider.

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Simple html/JavaScript based wiki, possible to carry on a USB stick, because it needs no database in the back
Download and try it out (only option to save is locally!): https://homepage.boku.ac.at/ydorfstetter/index.html

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It looks like this browser doesn't run JavaScript. You can use one of these static HTML versions to browse the same content:
Have you ever had the feeling that your head is not quite big enough to hold everything you need to remember?
Welcome to TiddlyWiki, a unique non-linear notebook for capturing, organising and sharing complex information.

Use it to keep your to-do list, to plan an essay or novel, or to organise your wedding. Record every thought that crosses your brain, or build a flexible and responsive website.

Unlike conventional online services, TiddlyWiki lets you choose where to keep your data, guaranteeing that in the decades to come you will still be able to use the notes you take today.

The TiddlyWiki is the best software I've ever found for organising my ideas.
It's well worth spending an hour or so playing with it to see how it can help you. This will be time well-spent and will change how you think and how you organise your ideas.
Joe Armstrong, Co-inventor of Erlang

TiddlyWiki gets a Gearhead rating of 6 out of 5 (it's that good).
Finding code that works flawlessly after just two or three years is magical enough but after seven years?!
Mark Gibbs, Network World

TiddlyWiki is a rich, interactive tool for manipulating complex data with structure that doesn't easily fit into conventional tools like spreadsheets or wordprocessors.

TiddlyWiki is designed to fit around your brain, helping you deal with the things that won't fit. The fundamental idea is that information is more useful and reusable if we cut it up into the smallest semantically meaningful chunks - tiddlers - and give them titles so that they can be structured with links, tags, lists and macros. Tiddlers use a WikiText notation that concisely represents a wide range of text formatting and hypertext features. TiddlyWiki aims to provide a fluid interface for working with tiddlers, allowing them to be aggregated and composed into longer narratives.

People love using TiddlyWiki. Because it can be used without any complicated server infrastructure, and because it is open source, it has brought unprecedented freedom to everyone to keep their precious information under their own control.

TiddlyWiki was originally created by JeremyRuston and is now a thriving open source project with a busy Community of independent developers.

Further information about specific TiddlyWiki features:

Last but not least, TiddlyWiki is a rare example of a practical quine

Once all the relevant links have been transferred over these entries will be removed from the main tiddlywiki.com site.

If you find TiddlyWiki useful, there are lots of ways you can help assure its future and make it better.

OpenSource projects like TiddlyWiki thrive on the feedback and engagement of users. TiddlyWiki becomes more useful to everyone as more and more people use it. So, if you find TiddlyWiki useful, spread the word. The best possible way to assure its future is for it to become a hundred times more popular than before.

There are many ways you can contribute to TiddlyWiki:

Writing tutorials

Contributing to the documentation on tiddlywiki.com

Making video screencasts

Curating relevant links, hints and tips on a wiki

The main TiddlyWiki documentation and code lives on GitHub, and welcomes contributions:

# data[].attributes.attachment_link.title
TiddlyWiki - a non-linear personal web notebook

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It looks like this browser doesn't run JavaScript. You can use one of these static HTML versions to browse the same content: Have you ever had the feeling that your head is not quite big enough to hold everything you need to remember? Welcome to TiddlyWiki, a unique non-linear notebook for capturing, organising and sharing complex information.

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Canadian application with similar scope like UB3Guard

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Invasive Species Centre – Preventing the Spread of Invasive Species

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The Invasive Species Centre aims to prevent the spread of invasive species within Canada’s land and waterways. Providing up-to-date species profiles.

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Forestry Images: Forest Health, Natural Resources, Fire, Trees, Wildlife, Silviculture Photos

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Forestry Images is a joint project of The University of Georgia - Warnell School of Forestry and Natural Resources and College of Agricultural and Environmental Sciences, Center for Invasive Species and Ecosystem Health, US Forest Service, International Society of Arboriculture, USDA Identification Technology Program

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Remember it can have different "faces" e.g. http://izla.at/klimaampel/

# data[].attributes.attachment_link.description
DokuWiki is a simple to use and highly versatile Open Source wiki software that doesn’t require a database. It is loved by users for its clean and readable syntax. The ease of maintenance, backup and integration makes it an administrator’s favorite. Built in access controls and authentication connec…

# data[].attributes.body
I like transportable Wikis like TiddlyWiki or DokuWiki both of which a have experiences with.
The classical Wikipedia system works with MediaWiki and the SemanticWiki for organising content, pictures, sounds, maps...
WackoWiki I chose because of its stated user-friendlyness and Wiki.js is one of the state of the art for smartphone apps (node.js).

All I chose have secured licenses, run on different platforms and are open source: https://de.wikipedia.org/wiki/Liste_von_Wiki-Software

# data[].attributes.body
What should our Wiki be able to do? Does it have to be comparable to integrate it in Wikipedia? Which depth of articles do we want? How to structure it? What is the right pathway: formulate an article about a tree species and come to its pathogens or describe a pathogene with its properties and list the affectable trees? Or both: one group starting with pathogenes (who?) and one starting from tree species (Yasmin D., ...). What hierarchies do we need for pathogenes of urban trees - are there categorizations available? Do we start from infectors (fungi, beetles, bacteria...) or from appearance (scattered dots, loss and browning of needles...)?

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http://www.stadtbaum.at/index.php/baumschaeden

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Der Stadtbaum ist einer ganzen Reihe schädigender Einflüsse ausgesetzt. Zu den häufigsten Schäden zählen Verletzungen von Wurzeln durch Grabungsarbeiten, Rindenschäden durch Baumaßnahmen im Nahbereich der Bäume, Anfahrschäden bei Verkehrsunfällen oder die Bildung von Totästen in der Baumkrone infolge mangelnder Wasser- und Nährstoffversorgung.

Auch Schadstoffe in Boden und Luft, sowie verschiedene Krankheiten und Schädlinge beeinträchtigen die Baumvitalität.

Ebenso kann es durch Schnee, Eis oder Starkwinden zu Astbrüchen kommen, die einerseits eine Gefahr für Mensch und Sachgüter darstellen, andererseits ohne entsprechende Wundversorgung zum Eindringen einer Wundfäule führen. Solche durch Stammwunden oder Wurzeln eindringende Fäulepilze können bei entsprechender Ausdehnung die Bruch- und Wurffestigkeit des Baumes massiv reduzieren.

Der Behebung des Schadens muß eine eingehende Diagnose durch einen Baumfachmann vorausgehen, um das Schadensausmaß feststellen zu können und den Sanierungsplan zu erarbeiten. Die erfolgte Diagnose bildet auch die Grundlage für eine eventuell geforderte Bewertung des Schadens (Schadenshöhe).

# data[].attributes.attachment_link.title
stadtbaum.at - Baumkrankheiten, Schäden an Bäumen, Baumpflege - Baumschäden

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Der Stadtbaum ist einer ganzen Reihe schädigender Einflüsse ausgesetzt. Zu den häufigsten Schäden zählen Verletzungen von Wurzeln durch Grabungsarbeiten, Rindenschäden durch Baumaßnahmen im Nahbereich der Bäume, Anfahrschäden bei Verkehrsunfällen oder die Bildung von Totästen in der Baumkrone infolge mangelnder Wasser- und Nährstoffversorgung. Auch Schadstoffe in Boden und Luft, sowie verschiedene Krankheiten und Schädlinge beeinträchtigen die Baumvitalität.

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https://www.galk.de/arbeitskreise/stadtbaeume/themenuebersicht/schaderreger-und-krankheiten-an-baeumen

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https://de.wikipedia.org/wiki/Ceratocystis_platani

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Ceratocystis platani ist ein krankheitserregender Pilz auf Platanen der Gattung .

Ceratocystis platani stammt vermutlich aus dem Südosten der USA. Der Pilz wurde früher zu den Arten des Ceratocystis fimbriata Komplexes gezählt wie Ceratocystis fimbriata f. platani. Er wurde 2005 zu einer eigenen Art erhoben.

Ceratocystis platani verursacht eine Krankheit an Platanen, die bekannt ist „Platanenkrebs".

Das Platanensterben wird von dem Phytotoxin Ceratoplatanin verursacht, welches in der Zellwand von C. platani vorkommt, aber auch von anderen Dikarya, und tritt gemeinsam mit anderen molekularen Pilz-Wirt Interaktionen auf.

Die Orientalische Platane (Platanus orientalis) wird als hochanfällig für den Pilz betrachtet; die Abendländische Platane (Platanus occidentalis) entwickelte sich vermutlich gemeinsam mit dem Pilz und ist relativ resistent, während die Ahornblättrige Platane (Platanus × acerifolia) in der Regel zwischen ihren Elternteilen anzusiedeln ist, was die Widerstandskraft betrifft. Der Pilz ist ein Wundparasit, der die Platanen schnell infiziert, den Saftfluss unterbricht, zu Krebs und schließlich zum Tod führt. Geschwüre am Baumstamm sind charakteristische Nekrosen auf der inneren Rinde und blau-schwarze bis rot-braune Flecken im Splintholz. Die Krankheit kann zum plötzlichen Absterben von Teilen der Krone führen und Bäume von 30-40 cm können 2-3 Jahre nach der Infektion ganz eingehen.

1. C. J. B. Engelbrecht, T. C. Harrington: Intersterility, morphology and taxonomy of Ceratocystis fimbriata on sweet potato, cacao and sycamore. In: Mycologia. 97, Nr. 1, 2005, S. 57-69. doi:10.3852/mycologia.97.1.57. PMID 16389957.

2. Rapid Pest Risk Analysis for Ceratocystis platani ( vom 13. Mai 2013 im Internet Archive), Food and Environment Research Agency

3. Platanensterben durch zunehmende Pilzausbreitung abgerufen am 28. März 2022

4. Hongxin Chen, Andriy Kovalchuk, Susanna Keriö, Fred O. Asiegbu: Distribution and bioinformatic analysis of the cerato-platanin protein family in Dikarya. In: Mycologia. 105, Nr. 2013, 20. Januar 2017, S. 1479-1488. doi:10.3852/13-115.

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Ceratocystis platani ist ein krankheitserregender Pilz auf Platanen der Gattung . Ceratocystis platani stammt vermutlich aus dem Südosten der USA. Der Pilz wurde früher zu den Arten des Ceratocystis fimbriata Komplexes gezählt wie Ceratocystis fimbriata f. platani. Er wurde 2005 zu einer eigenen Art erhoben.

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Where to find the diseases?

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* General chapters about avoiding pests and harmful contaminations incl. "citizen measures"
* Tools for early detection
* Management procedures

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published, ongoing and open research questions
* Literature listing: books, articles, videos etc.
* Country information
* Development and models under climate change scenarios

# data[].attributes.body
* to other platforms
* to diagnosis / management tools
* teaching materials
* kids information / simple language / foreign languages [EN, DE, ES, SE, ...?]

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Picture Database of self-made photos, graphs, charts etc.
Prefereably open source "copyrighted" in CC (CC-BY-SA or CC-0)

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...for trees and list the pathogenes and diseases
...for pathogenes and list affected trees
...for diseases and list pathogenes and affected trees

Combine pathogenes and diseases in one article or splitted in two?

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List of terminology in different languages

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Das dieser Arbeit zugrunde liegende Ziel war es, eine Datenbank der Bäume, welche in den Gruppen 1 bis 18 des Botanischen Gartens der Universität Wien (HBV) zu finden sind, anzulegen. Die so entstandenen Profile existieren nicht nur in schriftlicher Form, sondern sie werden durch Bildtafeln ergänzt, wodurch jedes einzelne Pflanzenprofil die Zielgruppe, nämlich die Besucher des Botanischen Gartens, auf zweierlei Arten ansprechen soll. Die Fotographien, aus denen die Bildtafeln zusammengestellt sind, wurden im Botanischen Garten aufgenommen. Die Informationen, aus welchen sich die schriftlichen Beschreibungen zusammensetzen umfassen Daten zur Herkunft des jeweiligen Baumes, zur maximalen Höhe und Alter, charakteristische physische Eigenschaften und medizinischen Anwendungsgebiete sowie wirtschaftliche Bedeutung. Zusätzlich wurden Bilder der jeweiligen Bäume erstellt. Aus diesen Bildern sind Bildtafeln entstanden, welche die wichtigsten Merkmale darstellen. So umfasst eine gewöhnliche Bildtafel Abbildungen von jungen Trieben, der Rinde, der Blätter, der Blüten sowie der Frucht (bzw. des Samens) des jeweiligen Baumes. Auf diese Art und Weise sollen den Besuchern die wesentlichen Merkmale der Bäume auch außerhalb der jeweiligen Blüte-zeiten und dergleichen nähergebracht werden. Man verspricht sich durch die bildliche Darstellung den Effekt, dass dieses Wissen bei der Zielgruppe besser ankommt und den Besuchern länger im Gedächtnis bleibt. Es ist geplant, die Pflanzenprofile in einer interaktiven, online abrufbaren Karte des Gartens zu verlinken als auch die gedruckten Infoblätter selbst bei den jeweiligen Bäumen zu positionieren. Diese Steckbriefe entstanden mit der Hoffnung, dass die Besucher des Botanischen Gar-tens einen etwas besseren Einblick in die Komplexität der Bäume gewinnen. Zusätzlich soll der Wissensdurst nach mehr Informationen zu dieser Materie oder nach botanischem Wissen im Allgemeinen geweckt werden.

Botanische Charakterisierung und Dokumentation der Baumarten des Botanischen Gartens der Universität Wien

42 Biologie > 42.38 Botanik: Allgemeines ,

42 Biologie > 42.45 Botanische Gärten, Herbarien

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Botanische Charakterisierung und Dokumentation der Baumarten des Botanischen Gartens der Universität Wien

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Das dieser Arbeit zugrunde liegende Ziel war es, eine Datenbank der Bäume, welche in den Gruppen 1 bis 18 des Botanischen Gartens der Universität Wien (HBV) zu finden sind, anzulegen. Die so entstandenen Profile existieren nicht nur in schriftlicher Form, sondern sie werden durch Bildtafeln ergänzt, wodurch jedes einzelne Pflanzenprofil die Zielgruppe, nämlich die Besucher des Botanischen Gartens, auf zweierlei Arten ansprechen soll.

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Implementierung des International Plant Sentinel Network (IPSN) im Botanischen Garten der Universität Wien

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
Plants and fungi are vital to the future of food, clean air and medicine. We're fighting against biodiversity loss to save life on Earth.

Visit the world-famous Kew Gardens

Experience our beautiful botanic gardens and the most biodiverse place on Earth.

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Discover a world of science hiding behind our beautiful botanical collections filled with over 40,000 living plants

# data[].attributes.attachment_link.readable_text
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Explore 150 years of the Arnold Arboretum-and our vision for the future.

Virtual Livestream | Director's Series | Birth: The Early History and Meaning of the Arnold Arboretum

Join the Arnold Arboretum's Director William (Ned) Friedman for the annual Director's Series! To celebrate the Arboretum's sesquicentennial, this year's series will explore the Magic and Meaning of a Garden of Trees. Over the course of four sessions, we will trace the Arnold's significance in the landscape architecture movement, value for the people of Boston, and leadership in creating global connections between plants and people. This session will include brief presentations and a moderated panel. The program is free and is offered both in person and livestreamed.

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The Arnold Arboretum of Harvard University

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The Arnold Arboretum of Harvard University is a museum of trees teaching the world about plants. A 281-acre preserve laid out by pioneering American landscape architect Frederick Law Olmsted, the Arboretum stewards one of the world's most comprehensive and best documented collections of temperate woody plants.

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