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En México, las principales instituciones de educación media y media superior, estaban en manos del Clero, en el cual prevalecía una instrucción de tipo dogmática.

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El Presidente Juárez expidió la "Ley Orgánica de Instrucción Pública en el Distrito Federal", en el cual se establecía la fundación de la Escuela Nacional Preparatoria; los estudios que se impartirían serían los correspondientes para poder ingresar a las Escuelas de Altos Estudios.

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Se inauguró el primer ciclo escolar de la Escuela Nacional Preparatoria con una matrícula de novecientos alumnos, misma que se ocupo cómo escuela hasta 1982. La aprobación del decreto y el inicio del ciclo escolar, desataron fuertes controversias entre positivistas, católicos y metafísicos, mismas que continuaron hasta finales de 1868.

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Se presentaron los primeros resultados en el ámbito nacional de la labor educativa de la Preparatoria.

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Se inician los cursos libres dominicales de física, química e historia natural, encaminados a la clase obrera.

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La Comisión Astronómica Mexicana en la cual participaron cuatro profesores distinguidos de la ENP, parte hacia Japón.

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Un maestro de la ENP Ignacio Ramírez, es nombrado por el Presidente Díaz, Secretario de Justicia e Instrucción Pública.

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Se inscribe e ingresa la primera mujer a la Escuela Nacional Preparatoria: Matilde Montoya.

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El Director Alfonso Herrera solicita licencia por dos meses, y lo releva el maestro Justo Sierra quien deberá impartir su cátedra de "Historia General" sin goce de sueldo, y continuar su labor como diputado federal.

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Se hace oficial el cese del Director de la Escuela Nacional Preparatoria Alfonso Herrera, y lo sustituye el militar Vidal Castañeda y Nájera. Aparecen en el diario oficial las reformas a los programas de la Escuela donde por primera vez en el país, se crea la asignatura de Historia de México, que se imparte separada de la de Historia General.

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El presidente Porfirio Díaz inauguró la primera exposición nacional en las instalaciones y con la participación de la Escuela Nacional Preparatoria.

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Fallece Sebastián Lerdo de Tejada, maestro insigne de la Escuela Nacional Preparatoria.

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Se clausuran las sesiones del "Primer Congreso Nacional de Instrucción Pública", convocado por el Presidente Díaz, en el cual se trataron asuntos relacionados con la enseñanza primaria y preparatoria.

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Al acercarse a las reelecciones del Presidente Porfirio Díaz, Justo Sierra y Vidal Castañeda y Nájera intervinieron ante los diversos grupos de la Escuela Nacional Preparatoria denominados "Comités de Estudiantes Antirreeleccionistas", para conservar la calma en la Escuela.

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Muere en Italia el destacado maestro de la Escuela Nacional Preparatoria, Ignacio Manuel Altamirano.

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Díaz expide una nueva ley para la instrucción pública, obra realizada por el profesor de la ENP Ezequiel A. Chávez, en el cual se implantó una reforma profunda a los planes y programas de estudios de la ENP. Esta reforma establece cursos semestrales en la Escuela Nacional Preparatoria y reduce a cuatro años el plan de estudios. Además se realizan modificaciones de varias materias y diversos cambios en la organización interna del plantel, lo que causa irritación entre los estudiantes.
Las controversias continúan contra Ezequiel A. Chávez y su plan de estudios. Desde su fundación y hasta el inicio del siglo XX, la Escuela Nacional Preparatoria albergó en su personal académico a los más distinguidos humanistas, científicos y artistas de México, asimismo muchos de sus egresados empezaban a figurar en el devenir histórico del país.

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Ezequiel A. Chávez, conservando la titularidad como Director de la Preparatoria, se le concede licencia para separarse de su cargo al Lic. Vidal Castañeda y Nájera, sustituyéndolo el Dr. Manuel Flores. En ese mismo año, se deroga el plan Chávez, regresando al ciclo anual y alargándose a seis años, enfatizando la educación de las ciencias, las humanidades, la educación física y la moral.

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Por licencia del Dr. Flores, se nombra Director Interino de la Preparatoria al maestro de geografía Miguel E. Schulz. El 20 de enero de 1905, el profesor Schulz elabora un informe de su gestión como Director Interino al titular Dr. Flores, en el que cabe señalar los avances en la construcción del Anfiteatro Simón Bolívar.

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Ya como Director José Terres, se constituye la Sociedad de Alumnos presidida por Alfonso Reyes. En diciembre del mismo, es nombrado Director el Dr. Porfirio Parra,quien reafirma su convicción hacia el credo positivista y la fidelidad a la doctrina barredista.

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Se reforma el plan de estudios regresando al ciclo de cinco años establecido por Barrera y el Presidente Díaz decreta su enseñanza gratuita y laica.

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Se imparte en la Preparatoria un ciclo de conferencias sobre el positivismo, por el joven Antonio Caso. En ese año, el grupo de preparatorianos denominado "Ateneo de la Juventud", conformado por destacados académicos y estudiantes, es reconocido como un grupo de mexicanos que abriría nuevos rumbos en el mundo intelectual del país; éste grupo estaba formado por Antonio Caso, Alfonso Reyes, José Vasconcelos, Diego Rivera, entre otros.

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Tomando como cimiento a la Escuela Nacional Preparatoria y a la Escuela de Altos Estudios, la cual sería dirigida por Porfirio Parra y, para sustituirlo como Director de la Preparatoria, se nombró al Dr. Manuel Flores.

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El Maestro Justo Sierra fue designado ministro plenipotenciario por el Presidente Madero.

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El Maestro muere en Madrid, en 1912, sus restos llegan a la capital el 7 de junio y son velados en el Anfiteatro de la Preparatoria. En su último homenaje, en el que estuvo el Presidente Madero, conmovió tanto al grado que el Presidente secó sus lágrimas.

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El reconocido literato Don Erasmo Castellanos Quinto es nombrado Director Interino, quien fue subdirector de la escuela y denominado como el mejor cervantista de México. Durante el período de la Revolución Mexicana, la Escuela Nacional Preparatoria sufrió innumerables vicisitudes.

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Toma posesión de la rectoría el Lic. José Vasconcelos y como director a Ezequiel A. Chávez., reincorporando la Preparatoria a la Universidad, restableciendo la doctrina de Barreda, y un plan de cinco años.

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El Lic. Vicente Lombardo es nombrado Director de la Escuela Nacional Preparatoria, quien realiza el "Primer Congreso de Escuela Preparatorias", que pretende establecer un plan de estudios para las Preparatorias que unificara la enseñanza. Con la salida del Lic. Vasconcelos de la secretaría de Instrucción Pública, se crea la Secretaría de Educación Pública, reformando el sistema educativo mexicano.

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Se inicia en la Escuela Nacional Preparatoria la lucha por la autonomía universitaria

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Se obtiene la lucha por la autonomía universitaria en la Escuela Nacional Preparatoria. Y fue designado Director de la Escuela Nacional Preparatoria el Dr. Pedro de Alba, cargo que ocupó hasta 1933.

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En la rectoría del Dr. Fernando Ocaranza, el Consejo Universitario decide volver a tomar el ciclo escolar de cinco años.

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Se inician los nuevos cursos de la Escuela. Los alumnos del primer año comparten las instalaciones con la escuela de Jurisprudencia. La SEP presenta una demanda ante la Suprema Corte de Justicia por violación a los ciclos escolares, obliga ala UNAM a crear un ciclo denominado "Extensión Universitaria", conformado por los primeros tres ciclos de los estudios de preparatoria. Este ciclo se denomina "Iniciación Universitaria".

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Se publica en el Diario Oficial la "Ley Orgánica de la Universidad Nacional Autónoma de México". Por los años 50 se crearon nuevos planteles, distribuidos en el área metropolitana. Los cuales recibieron nombres de maestros de la preparatoria como:
-Plantel 1 "Gabino Barreda"
-Plantel 2 "Erasmo Castellanos Quinto"
-Plantel 3 "Justo Sierra"
-Plantel 4 "Vidal Castañeda y Nájera" * Plantel 5 "José Vasconcelos"
-Plantel 6 "Antonio Caso"

-Plantel 7 "Ezequiel A. Chávez"
-Plantel 8 "Miguel E. Shulz"
-Plantel 9 "Pedro de Alba"

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Jorge carpizo suprime la figura de profesor de educación media superior y establece el programa "superación académica del bachillerato

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Designan a José sarukhan como rector y establece los cambios actuales

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Se aprueban los nuevos planes de estudio vigentes tras uno no aceptado.