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Aristóteles contribuyó en el desarrollo de la biología. Particularmente importantes con la "Historia de los animales", que es un texto de zoología escrito alrededor del año 343 a. C. por Aristóteles. Aristóteles clasificó 540 especies de animales y diseccionó al menos 50.

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El sucesor de Aristóteles en el Liceo, Teofrasto, escribió una serie de libros sobre la botánica, "la historia de las plantas" es una de las obras más importantes escritas por Teofrasto en donde enumeró unas 500 plantas.

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Al-Jahiz fue un erudito que describió una de las primeras ideas evolutivas, como la lucha por la existencia. También introdujo la idea de una cadena alimenticia.

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El biólogo Kurdo Al-Dinawari considerado el fundador de la botánica árabe por su libro de las plantas, en el que describió al menos 637 especies y trató sobre el desarrollo de las plantas desde la germinación hasta la muerte, describiendo las fases de crecimiento y producción de flores y frutos.

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El médico persa Avicena, introdujo los ensayos clínicos y la farmacología clínica en su enciclopedia "El canon de medicina", que se utilizó como texto de referencia para la enseñanza media europea hasta el siglo XVII.

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El médico andalusí Avenzoar fue un aficionado de la disección experimental y la autopsia, que utilizó para demostrar que la enfermedad de la piel conocida como sarna era causada por un parásito. También introdujo la cirugía experimental, y utilizó la experimentación con animales para probar técnicas quirúrgicas antes de su utilización con humanos.

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Durante una hambruna en Egipto en 1200, Abd al-Latif al-Baghdadi observó y examinó un gran número de esqueletos, y descubrió que Galeno había hecho una descripción incorrecta de la formación de los huesos de la mandíbula y el sacro.

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A principios del siglo XIII el biólogo andalusí Abu al-Abbas al-Nabati fue uno de los primeros en utilizar el método científico en la botánica, introduciendo técnicas experimentales en las pruebas, descripción e identificación de elementos de farmacopea, y separación de informes.

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Ibn al-Baitar alumno de Abu al-Abbas al-Nabati escribió una enciclopedia farmacéutica que describía 1400 plantas, alimentos y medicinas, 300 de las cuales eran descubrimientos realizados por él mismo.

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Ibn Nafis fue un médico árabe quien en 1242 descubrió la circulación pulmonar y la circulación coronaria, que forman la base del sistema circulatorio; también describió el concepto de metabolismo, ​ pulso, ​ huesos, músculos, intestinos, órganos sensoriales, bilis, esófago y estómago.​

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En 1543 Andrés Vesalio iniciaba una nueva era en la medicina occidental con la publicación de anatomía humana "De humani corporis fábrica", que estaba basado en la disección de cadáveres. Vesalio fue el primero de una serie de anatomistas que gradualmente reemplazó la escolástica por el empirismo en la fisiología y la medicina, basándose en la experiencia propia.

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Robert Hooke publicó el seminal "Micrographia" basado en observaciones realizadas con su propio microscopio realizado en 1665. En "Micrographia", Robert Hooke había aplicado el término «célula» a estructuras biológicas como el fragmento de felógeno.

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Niels Stensen en 1669 publicó un ensayo sobre como los restos de organismos vivos podrían quedar atrapados en capas de sedimento y mineralizarse para producir fósiles. Aunque las ideas de Stensen fueran conocidas no fue hasta finales del siglo XVIII que sería aceptado por todo los naturalistas.

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Gracias a espectacular mejora del microscopio de Anton van Leeuwenhoek a finales de los años 1670 la biología comenzó a desarrollarse y crecer rápidamente. Fue entonces cuando los investigadores descubrieron los espermatozoides, las bacterias, los infusorios y la diversidad de la vida microscópica, todo un mundo antes desconocido.

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Carlos Linneo un botánico, zoólogo y médico sueco, publicó una taxonomía básica para el mundo natural en 1736, Linneo en los años 1750 introdujo la nomenclatura binominal para todas sus especies.

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Un gran naturalista del siglo XVIII, Georges-Louis Leclerc, conde de Buffon, trató a las especies como categorías artificiales y a las formas vivas como moldeables. Aunque estaba en contra de la evolución, Buffon fue una figura clave en la historia del pensamiento evolutivo; su trabajo intervino en las teorías evolutivas tanto de Lamarck como de Darwin.