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Inès Aglouni-Saurais, Cecile Condom, Morgane Commeau, Chloé Borau

Rapport d'étude comportant : un rapport plus général sur le diabète dans le monde précisant l'importance des facteurs génétiques

On cherche à déterminer un rapport entre le diabète dans le monde et les facteurs génétiques.

Sur la carte représentant le diabète dans le monde, on remarque qu'il touche en grande majorité tous les pays. Plus particulièrement en Arabie Saoudite où le pourcentage de diabétique est entre 14 et 20%. D'autres pays sont touchés par le diabète, notamment le Mexique et l'Egypte par exemple avec un taux de diabétique entre 10 et 14%. La France, elle, a un taux compris entre 4 et 6% de diabétique. On peut supposer que le taux de diabétique dans chaque pays est dû à des facteurs génétiques mais également à l'alimentation et à la façon de vivre.

Pour le diabète MODY :
Sur le tableau représentant les différents types de diabète MODY et leurs principales caractéristiques on remarque qu'il en existe 6 différents. Chaque type de diabète MODY a un gène muté différent. Le phénotype est à chaque fois une sorte d'hyperglycémie, chronique pour le MODY 1,3,4 et 5 ( avec complications pour le 1 et 3 et atteintes rénales pour le 5 ). Pour le 2 et 6 ce ne sont pas des cas chroniques. Le plus fréquent au niveau mondial est le MODY 3. ( Classement : 3 , 2, 1, 5, 4 et 6 ). Le traitement est commun à tous : Insuline. Sauf pour le MOBY 2 où il faut pratiquer de l'exercice et un régime car c'est une hyperglycémie modérée et tardive.
On peut donc traduire que l'insuline permet de réguler l'hyperglycémie.
Pour la comparaison des séquences des gènes impliqués, on s'intéresse au MOBY 2 dont le gène muté est le glucokinase et dont le phénotype est l'hyperglycémie modérée et tardive.
On remarque qu'il y a une mutation du nucléotide à guanine en nucléotide à thymine au 835 ème nucléotide.
Pour la séquence des acides aminés on remarque qu'il y en a moins dans le MOBY 2 mais ils paraissent identiques.
C'est peut-être le manque d'acides aminés qui explique l'hyperglycémie.

TABLEAU INDIQUANT LE RISQUE DE DIABÈTE SELON LE CONTEXTE GENETIQUE

Un tableau nous présente le risque de développer un diabète selon le contexte génétique.
Nous pouvons ainsi voir que pour un individu ayant un jumeau atteint de diabète,  le risque de développer un diabète avant 64ans est de 40%, contre 90% après 64ans. Pour un individu ayant un frère ou une sœur diabétique, le risque de développer un diabète avant 64ans est de 10% contre 64% après 64ans. Puis, une personne ayant un des parents diabétique à 3% de risque de développer un diabète avant 64ans contre 25% après 64ans. Enfin pour un individu n'ayant aucun cas de diabète dans sa famille, le risque de développer un diabète avant 64ans est de seulement 0.5%, contre 3% après 64ans.
Nous pouvons donc dire que le risque de développer un diabète est considérablement plus élevé après 64ans, il peut être multiplié par 8 au maximum par exemple. Évidemment plus les personnes de notre entourage atteinte de diabète nous sont éloignés en fonction des générations moins nous avons de risque d'être atteint. Pour un individu n'ayant personne de sa famille de diabétique le risque est donc très faible.

LA PRÉVALENCE DU DIABÈTE SELON LES ANTÉCÉDENTS FAMILIAUX

Un graphique nous présente la prévalence du diabète selon les antécédents familiaux.
Nous voyons que la prévalence est très faible chez les individus de 5 à 14ans, elle est nul chez tous les individus sauf chez ceux ayant les deux parents atteint ici la prévalence est légèrement inférieure à 5%. Puis pour les individus entre 15 et 24ans, celle ci est légèrement plus élevée, environ 2,5% pour quelqu'un ayant son père atteint, environ 5% pour une personne ayant seulement sa maman atteinte et environ 13% si les deux parents sont atteint, mais si il n'y a aucun antécédent la prévalence est nul. Chez les individus ayant entre 25 et 34ans,  tous les risques sont présent, et vont de 30% si les deux parents sont atteint à 5% si il n'y a aucun antécédent. Enfin, chez les individus ayant entre 35 et 44ans, la prévalence est la plus forte 60% si les deux parents sont atteint et 10% si il n'y a pas d'antécédents.
La prévalence augmente en fonction de l'âge, elle est quasiment nul chez un enfant et très forte chez une personne ayant plus de 35ans. Nous voyons également que la prévalence est plus élevée si c'est la mère qui est atteinte que si c'est le père. Le risque de diabète si il n'y a as d'antécédent n'arrive qu'à 25ans.

TABLEAU PRÉSENTANT L'INFLUENCE GENETIQUE CHEZ UN INDIVIDU

Un tableau nous présente l'influence génétique chez un individu.
Il est ici comparé le fait d'avoir un parent plus ou moins éloigné atteint de diabète de type 1, et le fait de contracter soi-même cette maladie.
Nous pouvons constater que si notre jumeau est atteint de DT1, le risque d'être soi-même atteint est de 40 à 50%. Mais si une sœur ou un frère est atteint de DT1 le risque d'être atteint est de 5 à 10%. Si notre père est atteint le risque est de 4 à 5%, tandis que si c'est la mère qui est atteinte le risque d'être soi-même atteint de DT1 va te 2 à 3%. Enfin, si il n'y a aucun lien de parenté avec le sujet atteint de DT1, le risque d'être soi-même atteint est de 0.2%.
Encore une fois nous constatons que plus le lien de parenté est éloigné ou inexistant plus le risque d'être soi-même atteint est faible, en revanche plus le lien de parenté est proche, plus le risque d'être atteint de DT1 est fort.

Doc 2 : A la recherche des gènes de prédisposition au DT2

Un premier échantillonnage a été fait afin d’analyser le génome de personnes venant de différentes familles françaises touchées par le DT2 (143 familles au total). On peut voir sur le graphique que les marqueurs A, B et F présentent des liaisons génétiques inférieures à 2, on considère alors que ces gènes ne sont pas impliqués dans le déclenchement du DT2. En revanche, les marqueurs C, D et E ont des liaisons supérieures à 2, ces gènes sont donc impliqués dans le déclenchement du DT2.

Un deuxième échantillonnage a été réalisé afin de déterminer si la mutation des gènes KNG1 et EIF4A2 est impliquée dans l’apparition du DT2. On peut voir pour la mutation du gène KNG1, le taux de liaison génétique est de 0.37, alors que pour le gène EIF4A2 le taux de liaisons génétiques est de 3.36. On peut donc en déduire que la mutation du gène EIF4A2 est impliquée dans l’apparition du DT2.

Doc 2 : La recherche des gènes impliqués

Tout d’abord, on s’intéresse aux gènes situés sur le chromosome 6 nommés DP, DR et DQ, qui forment le complexe HLA II. Ce complexe intervient dans la reconnaissance des cellules de l’organisme par le système immunitaire. On voit que le codage de la protéine influe sur la reconnaissance de la cellule. En effet, une anomalie au niveau de la protéine entraine la destruction de la cellule par le système immunitaire car celle-ci n’aurait pas été reconnue. Donc, les gènes DP, DR, DQ sont impliquées dans l’apparition du DT1.

D’autre part, une comparaison entre des enfants atteints du DT1 et sains a été faite. On s’intéresse à la présence des différents allèles du gène DR. On peut voir qu’un grand nombre d’enfants atteints du DT1 possède les allèles 3, 4 et 7. Les enfants sains possèdent majoritairement l’allèle 15, contrairement aux enfants atteints qui ne possède pas cet allèle. Ainsi, on peut dire que le gène DR est le plus souvent impliqué dans l’apparition du DT1 que les gènes DP et DQ.

Une origine génétique non absolue pour le DT2.

On peut voir les différents taux de risque d’être atteint par le DT2 selon les antécédents familiaux. On voit que les risques d’être atteint du DT2 sont très importants lorsqu’on a un vrai jumeau ou un frère (ou une sœur) atteint du DT2 : de 40% à 90%. Les risques sont beaucoup plus faibles lorsque ce sont nos parents qui sont atteints du DT2 : 12% pour le père et 14% pour la mère. Enfin, on n’a que 2% à 4% de risque d’être atteint si on ne possède aucun lien de parenté. Ainsi, on peut dire que le rôle de l’origine génétique est extrêmement important dans les risque d’apparition du DT2.

Ainsi on peut affirmer que la présence de certains gènes et/ou leur mutation influe sur le déclenchement du diabète.

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Groupe des statisticiens : Yannis Berkane , Baptiste Bost , Thomas Collin , Paul Bannwart

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Groupe des statisticiens : Yannis Berkane , Baptiste Bost , Thomas Collin , Paul Bannwart

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On cherche à effectuer un rapport d'étude afin d'apporter à l'aide de différentes statistiques des informations plus précises sur le diabète , on pourra alors émettre différentes hypothèses à partir de données.
Nous possédons ainsi un tableur retranscrivant les différentes personnes diabétiques en France en fonction de leur sexe et de leur localisation.
La population française est d'après ce fichier Excel composée d'environ 60 million de français qui vivent majoritairement dans des régions les plus urbaines (Ile de France , Rhône-Alpes , Nord Pas de Calais ) , on observe alors que ce sont dans ces régions qu'il y a le plus de diabétiques , ce qui parait logique car la population y est plus élevée , ainsi pour les personnes ayant entre 1 et 64 ans il y a environ une moyenne de 2800 diabétiques par département c'est à dire 0.23% de la population française étant atteinte par cette maladie et étant située dans cette tranche d'âge , pour les personnes ayant plus de 65 ans les chiffres sont plutôt les mêmes malgré une légère diminution ou augmentation , contrairement aux départements d'Outre-Mer qui eux affichent une diminution de leur population diabétique d'environ 3 fois.
Par rapport au sexe on observe que malgré que la population homme/femme soit égale , plus d'hommes que de femmes entre 1 et 64ans sont diabétiques : 0.08% contre 0,06% chez les femmes (par rapport à la totalité de la population française) , mais la tendance s'inverse une fois la barre des 65 ans dépassées , plus de femmes sont diabétiques : environ 3000 de plus tandis que 4000 hommes en moins sont diabétiques.
On peut donc supposer en premier temps que l'homme aurait un organisme combattant le diabète de manière différente par rapport à celui de la femme , ils seraient ainsi donc plus sujet à un diabète de type 1 ou 2 quand ils sont situés dans la première tranche d'âge (1à65ans) , car d'après certaines études , pour le diabète de type 2 par exemple , l'homme semble développer ce diabète à un IMC plus faible que celui de la femme.
De plus , on observe que indépendamment du sexe les personnes habitant en département d'Outre-Mer sont beaucoup moins sujet au diabète , on peut donc supposer que leur alimentation est plus saine que la notre , ou qu'ils ingèrent moins de produit provenant de grands entreprises qui circulent alors moins chez eux en raison d'une exportation plus faible , c'est pour cela notamment que après 65ans le nombre de femmes diabétiques augmente ( certes peu ) dans la France métropolitaine , mais diminue dans les départements d'Outre-Mer , il y a donc une véritable différence entre ces territoires qui affectent sur le nombre de personnes étant sujet au diabète , cela peut s'expliquer par des inégalités territoriales , en effet plus une population est pauvre et plus elle s'alimente mal ainsi cela entraine plus de diabétiques , ainsi les départements les plus aisés sont ceux les moins touchés.

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Groupe des responsable des campagnes de prévention de santé publique : 

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Groupe des responsable des campagnes de prévention de santé publique : 

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Emma Delamour, Carla Da Silva, Camou - Juncas Julie, Sandra Aledo

(interprétation de quelques documents, Je vous laisse modifier et compléter.)

Grace à la carte concernant l'ensemble de la population française, nous pouvons relever des disparités selon les régions concernant la prévalence de l'obésité. En effet, on constate un fort pourcentage de prévalence de l'obésité dans le Nord.

Sur la carte concernant les enfants buvant des boissons sucrées, on constate un fort pourcentage dans les régions du Nord et Nord-Est.

Le diagramme montrant la prévalence du diabète selon l'activité montre que plus les personnes sont sportives et moins la prévalence au diabète est forte. au contraire, moins l'activité physique est importante, plus la prévalence au diabète est forte. Cela montre bien que une bonne hygiène de vie est nécessaire pour limiter d'une certaine manière la prévalence au diabète.

Le diagramme sur la prévalence du diabète selon l'IMC montre que les personnes ayant un IMC supérieur à 35 (donc en obésité), sont sujet à un fort pourcentage de prévalence au diabète contrairement aux personnes en sous-poids, maigres ayant un IMC entre 20 et 25 qui ont un faible pourcentage de prévalence au diabète. On peut donc en conclure que les personnes ayant une mauvaise hygiène de vie alimentaire, en surpoids, sont fortement exposées au diabète.

L'alimentation est donc un facteur influant dans la prévalence du diabète.

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Prévalence de l'obésité en France en 2009

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Prévalence de l'obésité en France en 2009

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Prévalence du diabète selon les antécédents familiaux chez les indiens Pima

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Prévalence du diabète au sein des indiens Pimas

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prévalence du diabète selon l'IMC

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Contexte génétique et âge (le diabète de type 1 se déclare tôt, vers l'adolescence, le diabète de type 5 se déclare plus tardivement)

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Fichier Excel à utiliser par les statisticiens

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Fichier Excel à utiliser par les statisticiens

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TP5 Diabète données élèves épidémiologie

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Définition :

- Risque épidémiologique : en épidémiologie, un risque dépend d’un facteur à prendre en compte. Un risque relatif égal à 2 signifie que le développement de la maladie est deux fois plus probable chez une personne exposée au facteur étudié que chez une personne qui n’est pas exposée à ce facteur.

- Prévalence : En épidémiologie, la prévalence est une mesure de l'état de santé d'une population à un instant donné. Pour une affection donnée, elle est calculée en rapportant à la population totale, le nombre de cas de maladies présents à un moment donné dans une population.

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Le diabète MODY, comparaison des séquences des gènes impliqués.

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Le diabète est une pathologie qui se manifeste par une maladie chronique fréquente, invalidante et coûteuse, touchant la plupart des pays.L’OMS parle désormais d’épidémie, voire de pandémie non contagieuse. Le diabète constitue donc un champ remarquable de recherches épidémiologiques et cliniques. Il existe différents types de diabète : le diabète MODY, le diabète de type 1 (DT1) et le diabète de type 2 (DT2).

Voir la projection en 2030 du diabète dans le monde : http://www.idf.org/atlasmap/atlasmap

Chercheurs statisticiens à l’INSERM*, on vous demande un rapport d’étude comportant :

une étude statistique sur le diabète en France basé sur les données statistiques de l’INSEE dans lequel il faudra proposer des hypothèses pour expliquer les différences observées https://framacalc.org/TP6_TS4_groupe_1_statisticiens

un rapport plus général sur le diabète dans le monde précisant l'importance des facteurs génétiques. https://mensuel.framapad.org/p/TP6_TS4_groupe_1___groupe_g%C3%A9n%C3%A9ticiens

un rapport sur les facteurs environnementaux et des directives pour mettre en place une campagne de prévention en direction des populations  https://mensuel.framapad.org/p/TP6_TS4_groupe_1___groupe_pr%C3%A9vention_sant%C3%A9

*Institut national de la santé et de la recherche médicale

Cette équipe de l'INSERM est constituée de statisticiens, de généticiens et de spécialistes de la mise en place de programmes de santé publique. Répartissez-vous selon votre spécialité, utilisez les documents et coopérez dans votre framapad pour rédiger chaque partie du rapport. Chaque rapport fini doit être déposé dans votre groupe. (parfois des collègues d'un autre domaine peuvent vous apporter des précisions, vous pouvez utiliser la boite de dialogue à cet effet )

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blablabla......

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Le diabète MODY, un diabète au déterminisme génétique

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Lien entre infection virale et DT1