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El mieloma múltiple es un cáncer hematológico que afecta a las células plasmáticas de la médula ósea, provocando la producción descontrolada de anticuerpos anómalos. Puede causar anemia, dolor óseo, insuficiencia renal e infecciones frecuentes.

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Hiperdiploide: con ganancias de cromosomas impares.

No hiperdiploide: con translocaciones del gen IGH (14q32) que activan oncogenes como MMSET, MAF o CCND1, mediante un mecanismo llamado superenhancer hijacking.

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Se incluyeron 20 muestras: 18 pacientes cumplieron los criterios clínicos y 2 fueron añadidos desde un biobanco.

Criterios: ≥10% células plasmáticas y ≥2.5 millones de células CD138+ purificadas.

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Recolección de AMO en RPMI + heparina.

Purificación con kit EasySep™ (selección inmunomagnética automatizada).

Confirmación de pureza >70% (tinción de Wright-Giemsa).

Conservación a −80 °C tras mezcla con estabilizador de ADN.

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El análisis mediante Optical Genome Mapping (OGM) fue exitoso en detectar todas las alteraciones genéticas relevantes en los 20 pacientes con mieloma múltiple (MM), incluyendo:

Variaciones estructurales (SVs)

Variaciones en el número de copias (CNVs) como deleciones y ganancias.

Aneuploidías.

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El OGM genera un mapa de todo el genoma. Puede identificar cualquier variación estructural o CNV significativa en cualquier parte de los cromosomas.

Incluso detectó alteraciones que aun no se saben si tienen alguna importancia clínica.

Por otro lado, FISH es una técnica dirigida a un objetivo específico. Cualquier anomalía genética que no esté cubierta por estas sondas simplemente no será detectada por FISH, aunque esté presente en el genoma de la célula tumoral.

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Se identificaron 2 casos de t(4;14) (muestras 07 y 45; 10%), y un caso individual de t(6;14) (muestra 12), t(14;16) (muestra 02) y t(14;20) (muestra 44).

Un caso (muestra 37) exhibió un reordenamiento de tres vías que involucraba un tercer cromosoma, lo que demuestra la capacidad del OGM para detectar estructuras más complejas.

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Hallazgos en Genomas Hiperdiploides (HDM)

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Hallazgos en Genomas Hiperdiploides (HDM)

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OGM pudo detectar variaciones en cromosomas hiperdiploides, mientras que FISH no pudo hacerlo.

Los casos hiperdiploides mostraron una clara tendencia a la ganancia de cromosomas impares.

La ganancia del cromosoma 15 fue la más prevalente (90% de los casos HDM), seguida de las ganancias del cromosoma 9 (90%) y del cromosoma 5 (80%).

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Choque hipotónico + fijación con solución de Carnoy.

Sondas FISH principales:

TP53/CEN17, IGH/FGFR3, IGH/MAF, IGH/MAFB, CKS1B/CDKN2C.

Confirmación de translocaciones con sondas adicionales.

Clasificación HDM por ganancia de cromosomas impares.

Evaluación de ploidía: ≥3 señales/locus.

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Extracción de ADN de 1.5–2 millones de células (kits Gen 1 y 2).

Problemas iniciales con microesferas → paso de eliminación magnética.

ADN concentrado, homogenizado 72 h.

Plataforma: Saphyr® con chips G2.3 y G3.3.

Meta: 1500 Gbp de datos por muestra.

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Software: Bionano Access v1.7.2 con pipeline RVA.

Criterios de calidad: ≥70% mapeo, cobertura 300–400×.

Ajustes de filtros para:

Eliminar variantes normales.

Detectar translocaciones teloméricas (ej. t(4;14)).

Visualizar deleciones/ganancias pequeñas.

Confirmación: ruptura IGH cerca de oncogenes (NSD2, CCND1, etc.).

fCN >3 = amplificación 1q.

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Estimación de SVs desbalanceadas, con muchos más detalles

Detección de grandes deleciones y translocasiones complejas

4 muestras fueron detectadas positivas de forma automatica mientras que 2 tuvieron que ser analizadas de forma manual

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Deleciones del 1p

Detecctadas por CDKN2C de la banda 1p32

Varia de tamaño (entre 1p32.3 a 1p31.3

algunas deleciones fueron focalizadas , detectables con FISH , pero otras , muchas más grandes no

Ganacia de 1q

detectada por CKS1B

tamaños similares y consistentes

son consecuencia de translocasiones intercromosomicas.

las ganancias y perdidas suelen ocurrir en las regiones cercanas a los puntos de quiebre

Casos con más de 3 copias

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MYC como un oncogen importante, puesto que su sobreexpresión aumenta la progresión tumoral , relacionado a estados más agresivos de la enfermedad

mayormente reordenamientos complejos

OGM detecta los pequeños rearreglos que FISH no puede detectar

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la mayor parte fue en la región IGH

No se encontraron rearreglos dentro del gen MYC pero si en regiones cercanas , relacionado a su sobreexpresión

La región PVT1, cercana a MYC, fue la que más rearreglos sufrio en el cromosoma 8

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El diagnóstico incluye estudios clínicos, bioquímicos y genéticos como FISH, una técnica que detecta alteraciones cromosómicas específicas. Sin embargo, FISH tiene limitaciones:

Solo analiza regiones seleccionadas

Puede pasar por alto reordenamientos complejos

No ofrece una visión global del genoma.

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Una alternativa moderna es el OGM (Optical Genome Mapping), una técnica que analiza moléculas de ADN largas con marcas fluorescentes y permite detectar reordenamientos estructurales complejos en todo el genoma con alta resolución y sin necesidad de cultivo celular. OGM puede identificar translocaciones, duplicaciones, deleciones e inversiones que FISH no detecta, y por ello tiene el potencial de reemplazar o complementar a FISH en el análisis genético del mieloma múltiple.