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Nació en Madrid un 24 de Septiembre del año 1905.

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Nació en la Villa de Luarca. Su bisabuela, por razones de salud, pasaba los inviernos en Málaga, por lo que la infancia de Severo transcurre entre Málaga y Villar-Luarca.

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Tras la muerte de su padre en 1912, su madre y él se trasladaron a vivir a Málaga, donde Ochoa terminó sus estudios de primaria y realizó el bachillerato

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Pronto desarrolló interés por la biología, y se centró en el estudio del metabolismo energético, con especial atención a las moléculas fosforiladas.

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Terminó su licenciatura en medicina en 1928 y decidió seguir dedicándose a la investigación. Gracias a su publicación acerca de la creatinina, en 1929 consiguió una invitación para unirse al laboratorio de Otto Meyerhof en el instituto de biología Kaiser Wilhelm (hoy Instituto Max Planck) en Berlín.

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En septiembre de 1936, el matrimonio Ochoa salió de una España en guerra camino de Alemania, luego al Reino Unido y finalmente, en 1940 pasó a afincarse en los Estados Unidos.

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Aunque Severo estaba convencido de los beneficios que les reportaría la nacionalidad americana, dejó que fuera su mujer la que tomara, más tarde, la decisión de pedir la ciudadanía americana, que les fue concedida en 1956; pero según sus propias palabras él siempre se consideró "un exiliado científico, no político".

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En 1954, prosiguiendo con sus trabajos sobre la fosforilación oxidativa, descubrió una enzima, la polinucleótido fosforilasa, capaz de sintetizar ARN in vitro a partir de ribonucleosidodifosfatos.

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En 1959 fue galardonado con el Premio Nobel de Fisiología o Medicina por sus descubrimientos sobre el mecanismo de la síntesis biológica del ácido ribonucleico (ARN) y del ácido desoxirribonucleico (ADN).

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Lista de sus premios obtenidos a lo largo de su carrera:

Títulos honoríficos de las universidades de Washington University, Glasgow, Oxford, Salamanca, Brasil, Wesleyan University y Oviedo.

Profesor honorario de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, en Lima.

Doctor Honoris Causa de la Universidad de Córdoba el 9 de marzo de 1990.

Doctor Honoris Causa de la Universidad Iberoamericana de la República Dominicana el 12 de junio de 1988.

Doctor Honoris Causa de la Universidad del País Vasco el 19 de abril de 1988.

Doctor Honoris Causa de la Universidad de Granada el 29 de marzo de 1967

Medalla Neuberg en bioquímica del año 1951.

Premio Nobel de Fisiología y Medicina en 1959, compartido con su discípulo Arthur Kornberg.

Medalla de la Société de Chimie Biologique del año 1959.

Medalla de la Universidad de Nueva York del año 1959.

Premio Lección Conmemorativa Jiménez Díaz en 1969.

National Medal of Science de los EE. UU. del año 1979.

Miembro de varias sociedades de investigación en EE. UU., Alemania, Japón, Argentina, Uruguay y Chile

Presidente de la Unión internacional de Bioquímica.

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Aunque se jubila oficialmente en 1975, nunca abandona la investigación.
Desde su primera convocatoria en 1981, ejerce como presidente del jurado del Premio Príncipe de Asturias de Ciencias. A partir de 1986 se dedica principalmente a dar conferencias, a atender a los medios de comunicación y a tratar con los estudiantes del Centro de Biología Molecular de Madrid.

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Publicó su último trabajo científico en 1986, con ochenta y un años de edad.
En 1993 presenta en Madrid su biografía titulada La emoción de descubrir y ese mismo año muere a la edad de 88 años.

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Murió el 1 de noviembre de 1993 y fue enterrado en el cementerio de Luarca, su pueblo natal, junto a su esposa Carmen. En su testamento creó la Fundación Carmen y Severo Ochoa, de cuyo patronato forman parte algunos de sus discípulos españoles