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Le microbiote humain : Planète corps. A voir : les extraits 1,2,3,4,5,15,16 et 17.

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Le microbiote humain : Planète corps. A voir : les extraits 1,2,3,4,5,15,16 et 17.

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Extraits 1, 2, 3, 4, 5, 15, 16 et 17

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Le corps humain est le théâtre d'une vie sauvage insoupçonnée. Pour la découvrir, l'écologue Franck Courchamp a imaginé un étonnant safari microscopique à la rencontre des milliards de minuscules créatures qui s'affrontent, se nourrissent et se reproduisent sur notre peau ou à l'intérieur de notre corps.
Comme la Terre, le corps humain est le théâtre d'une vie sauvage insoupçonnée. Pour la découvrir, l'écologue Franck Courchamp a imaginé un étonnant safari microscopique à la rencontre des milliards de minuscules créatures qui prospèrent, s'affrontent, se nourrissent et se reproduisent sur notre peau ou à l'intérieur de notre corps. Certaines sont nuisibles, d'autres utiles, voire indispensables à notre survie. Toutes participent à un subtil équilibre biologique, qui s'est construit au fil de l'évolution. Vierge de tout corps étranger dans le ventre de notre mère, nous accueillons à l'âge adulte cent mille milliards de bactéries, dont 95 % des espèces sont encore inconnues.

Le grand spectacle de l'infiniment petit

Planète corps vogue d'abord à la surface de notre peau - notre organe le plus grand avec ses 2 m2 de surface, pour un poids moyen de 5 Kg -, siège de champignons, d'acariens et de parasites, dont le plus connu niche dans nos cheveux : le pou, dont on découvre que les premiers spécimens existaient déjà au temps des dinosaures ! Le film s'insinue aussi au plus profond de notre corps, des veines aux intestins, grâce à d'incroyables images filmées avec des microscopes électroniques de dernière génération. Des gastro-entérologues explorent notre système digestif aux milliards de bactéries, là où réside la clé de notre santé. Plus étonnant encore, nous apprenons que notre corps abrite 300 millions de virus, tueurs de bactéries, dont certains (les rétrovirus) se transmettent de génération en génération, pour notre plus grand bien.

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Le corps humain est le théâtre d'une vie sauvage insoupçonnée. Pour la découvrir, l'écologue Franck Courchamp a imaginé un étonnant safari microscopique à la rencontre des milliards de minuscules créatures qui s'affrontent, se nourrissent et se reproduisent sur notre peau ou à l'intérieur de notre corps.

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un document simple et rapide pour comprendre ce qu'est une bactérie.

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Les bactéries font partie de ce qu'on appelle plus couramment les microbes. Elles existent depuis des milliards d'années, mais elles sont tellement petites, tellement minuscules qu'il faut attendre l'invention du microscope au XVII siècle pour savoir qu'elles existent. Mais à l'époque, on ne sait pas encore que ce sont des organismes vivants...

En fait, c'est Louis Pasteur qui démontre dans la deuxième partie du XIX siècle que les bactéries peuvent provoquer chez l'homme des maladies graves et même mortelles.

A quoi ça ressemble une bactérie ? Eh bien déjà, ce n'est pas bien gros, c'est minuscule, c'est 100 fois plus petit qu'une cellule humaine, vous savez, les cellules qui constituent nos muscles et nos organes.

Définition d'une bactérie

En fait, une bactérie, c'est un organisme unicellulaire protégé par une paroi qui et contient un seul et unique chromosome, un programme qui détermine les tâches de la bactérie, on parle aussi de patrimoine génétique. Alors, ce programme n'est pas très varié, les bactéries ne savent faire qu'une seule chose, se multiplier en utilisant des machines qui exécutent ce programme. C'est beaucoup moins sophistiqué qu'une cellule humaine ! A l'intérieur de cette bactérie se promènent également des petits morceaux d' ADN, c'est une autre façon de parler du patrimoine génétique. Ils sont très importants, ils permettent à la bactérie de s'adapter.

A quoi servent les petites cornes autour ? Ce sont des flagelles qui permettent à la bactérie de se déplacer. Quoi qu'il en soit, grâce à cette structure basique, les bactéries se multiplient très rapidement. En une demi-heure, leur nombre double. 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, 128, 256 etc...

Réalisateur : Luc Baudonnière

Producteur : Riff International Production / France 3

Publié le 06/10/16

Modifié le 06/04/20

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Les bactéries font partie de ce qu'on appelle plus couramment les microbes. Elles existent depuis des milliards d'années, mais elles sont tellement petites, tellement minuscules qu'il faut attendre l'invention du microscope au XVII siècle pour savoir qu'elles existent. Mais à l'époque, on ne sait pas encore que ce sont des organismes vivants...

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Le monde microbien, importance, diversité

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Pourquoi vivons-nous dans un monde de microbes ? Quel est leur rôle ? Faisons le point avec Marc-André Selosse, microbiologiste, professeur...

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Documents sur la transmission des micro-organismes

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Documents sur la transmission des micro-organismes

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Multiplication de bactéries ( Pneumocoques ) par division cellulaire

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Les travaux de Louis Pasteur sur l'antisepsie et l'asepsie

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Ca sert à quoi, les antibiotiques ? - 1 jour, 1 question

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Le 1er antibiotique est découvert à la fin du XIXe siècle. C'est Flemming qui découvre le premier antibiotique : la pénicilline. Ils s'attaquent aux bactéries de plusieurs façons possibles. Un antibiotique à large spectre s'en prend à plusieurs types de bactéries, alors qu'un antibiotique ciblé est un médicament qui s'attaque à un seul type de bactérie

Réalisateur : Luc Baudonnière

Producteur : Riff International Production / France 3

Année de production : 2004

Publié le 26/08/14

Modifié le 12/11/19

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Le 1er antibiotique est découvert à la fin du XIXe siècle. C'est Flemming qui découvre le premier antibiotique : la pénicilline. Ils s'attaquent aux bactéries de plusieurs façons possibles.

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Tableau limiter contamination et infection complété

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Petite vidéo pour le rôle des lymphocytes B

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Petite vidéo pour le rôle des lymphocytes B

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rôle des lymphocytes B et action des anticorps

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La phagocytose (Animation et explication simple) #shorts

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L'histoire du petit Joseph.

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Aujourd'hui, le monde entier en attend un... Voici comment Louis Pasteur a développé et systématisé le vaccin, en 1885 grâce au petit Joseph.

4 juillet 1885

Aux aurores, en Alsace, Joseph Meister se rend dans le village voisin. À peine arrivé, un chien l'attaque et le mord quatorze fois. Le chien est abattu, mais les gendarmes annoncent qu'il aurait la rage. C'est la panique au village, car à l'époque, il n'existe aucun remède et la rage conduit inéluctablement à la mort.

La mère de Joseph qui a entendu parler d'un chimiste à Paris vaccinant des chiens enragés, décide de le rencontrer rapidement pour le convaincre de soigner son fils. Elle frappe à la porte de plusieurs hôpitaux de la capitale avant de trouver enfin Louis Pasteur à l'École normale supérieure.

Joseph Meister en 1939 : " Monsieur Pasteur était très ému, il n'avait jamais fait d'expérience de son vaccin autrement que sur les animaux. Mais ma mère insista, faisant valoir que puisque j'étais condamné, je n'avais rien à craindre et que l'on pouvait essayer sur moi le seul traitement qui existait."

Les recherches de Louis Pasteur

Huit ans auparavant, Louis Pasteur débutait déjà son travail sur le vaccin. Il effectuait d'abord des tests sur des poules atteintes du choléra et sur des moutons porteurs de la fièvre charbonneuse. Deux ans plus tard, il énonce le principe de la vaccination : "Inoculer des virus affaiblis ayant le caractère de ne jamais tuer, de donner une maladie bénigne qui préserve de la maladie mortelle."

Puis c'est sur la rage qu'il travaille. En isolant le virus, il fait des tests et l'injecte sur des lapins. Le virus est ensuite récupéré pour être injecté sur un autre lapin et ainsi de suite jusqu'à obtenir un virus atténué. C'est cette méthode qui sera également appliquée au petit Joseph. Le jeune garçon reçoit en tout vingt-et-une piqûres, sous la peau du ventre, d'un virus plus fort à chaque injection.

Joseph rentre chez lui, le 27 juillet et après dix jours de traitement et dix jours d'attente, le résultat tombe : il n'a pas la rage, le vaccin a fonctionné. À cette époque, Louis Pasteur était chimiste c'est le médecin Grancher qui administre les traitements. Mais pendant l'attente des résultats, il s'était réfugié dans son Jura natal, terrorisé à l'idée d'un échec. Les risques étaient immenses, la dernière injection faite au petit Joseph contenait le virus vivant de la rage.

Une fois le garçon guéri, Pasteur publie un article sur le cas. L'histoire fait le tour du monde et les dons affluent. Un institut centré sur le vaccin est alors créé : l'Institut Pasteur.

L'année suivante, 350 personnes sont vaccinées contre la rage.

Pas le premier vaccin

S'il est le plus connu, le petit Joseph n'est pas le premier cas de vaccination sur un humain. Un siècle avant, en 1776, le médecin anglais Edward Jenner, vaccine lui aussi un enfant en injectant le pus d'une femme contaminée par la variole de la vache, appelée "vaccine". L'enfant ne contracte pas la variole. C'est à ce moment-là que naît, en réalité, le principe de la vaccination.

Mais Edward Jenner ne le développe pas et l'utilise seulement pour soigner la vaccine. Louis Pasteur s'est inspiré de ce principe pour ses recherches et le nom de "vaccin" vient d'ailleurs de la maladie soignée par Edward Jenner.

" On dit souvent que Jenner a inventé la vaccination et Pasteur a inventé les vaccins. Et ce que Pasteur a montré c'est qu'on pouvait, à partir des microbes donnant différentes maladies, avoir des formes atténuées de ce microbe pour fabriquer quelque chose qui allait ensuite protéger ", développe Maxime Schwartz, directeur de l'Institut Pasteur de 1988 à 1999.

Près de deux millions de décès sont évités chaque année grâce aux vaccins. La variole a été éradiquée et on ne meurt plus de certaines maladies comme la tuberculose, la rage ou le tétanos.

En collaboration avec l' Institut Pasteur qui nous a fourni les images.

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À l'origine du vaccin : l'histoire de Pasteur et du petit Joseph

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Aujourd'hui, le monde entier en attend un... Voici comment Louis Pasteur a développé et systématisé le vaccin, en 1885 grâce au petit Joseph. Aux aurores, en Alsace, Joseph Meister se rend dans le village voisin. À peine arrivé, un chien l'attaque et le mord quatorze fois.

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Histoire de la vaccination : retour sur une révolution médicale

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La découverte de la vaccination avec Jenner

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La découverte de la vaccination avec Jenner

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historique vaccination jenner – Qwant Search

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Microsoft Internet Explorer Mozilla Firefox Google Chrome Apple Safari

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LEUCO WAR

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Un serious game sur la réponse immunitaire.

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logiciel pour les réactions immunitaires

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logiciel pour les réactions immunitaires

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Microsoft Internet Explorer Mozilla Firefox Google Chrome Apple Safari

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Cause

VIH désigne le virus de l'immunodéficience humaine. Il est transmis par voie sexuelle, sanguine, et de la mère à l'enfant. Dans ce dernier cas, la transmission du virus de la mère à l'enfant peut avoir lieu :

- soit lors du dernier trimestre de la grossesse, par passage du VIH à travers la barrière placentaire au cours des échanges sanguins entre la mère et le fœtus ;

- soit lors de l'accouchement ;

- soit lors de l'allaitement.

La prise d'un traitement antirétroviral pendant la grossesse permet d'amener le taux de transmission à moins de 1 %.

Le VIH cible les lymphocytes T, cellules essentielles au bon fonctionnement du système immunitaire. En l'absence de traitement, le VIH affaiblit le système immunitaire, et les personnes infectées développent de graves maladies sur le long terme. Ces maladies sont qualifiées de " maladies opportunistes " car elles sont causées par des micro-organismes inoffensifs pour les personnes dont le système immunitaire fonctionne normalement.

Le syndrome de l'immunodéficience acquise (sida) est le dernier stade de l'infection par le VIH. Il correspond au développement d'une ou de plusieurs maladies opportunistes chez les personnes infectées. Les premières années, ces dernières ne présentent généralement pas de symptômes cliniques. Pourtant, leurs lymphocytes T CD4+ ont déjà commencé leur déclin progressif. Sans traitement, la maladie apparaît plusieurs années après l'infection (délai médian de 7 ans ; délai variable selon les individus).

Symptômes

Le tableau clinique de l'infection par le VIH évolue selon les différents stades de la maladie. Dans un premier temps, la personne infectée peut rester asymptomatique ou bien développer les symptômes d'une phase appelée primo-infection. Survenant après une période d'incubation d'une à plusieurs semaines, la primo-infection est caractérisée par des signes cliniques analogues à ceux rencontrés en cas de grippe (forte fièvre, douleurs musculaires, maux de tête, diarrhée).

Après la primo-infection, débute une phase asymptomatique qui peut durer plusieurs années. Durant cette période, le virus est présent et les personnes infectées restent contagieuses. Le VIH affaiblissant progressivement le système immunitaire, la maladie entraîne ensuite l'apparition d'autres symptômes : perte de poids, fièvre, infections de la peau, diarrhée et toux.

Sans traitement, la maladie évolue vers le syndrome de l'immunodéficience acquise, dit sida, stade ultime de l'infection par le VIH. Cet état est marqué par l'apparition de maladies dites " opportunistes ", car elles surviennent en raison de l'affaiblissement du système immunitaire provoqué par le VIH. Les malades développent alors de multiples infections d'origine bactérienne, fongique et parasitaire, ainsi que certains cancers.

Traitement

Actuellement, aucun traitement ne permet d'éliminer complètement le VIH de l'organisme. Les traitements adaptés permettent aux personnes séropositives de bloquer la multiplication du VIH dans leur organisme et ainsi de garder un système immunitaire opérationnel. Ces traitements sont appelés trithérapies car ils combinent l'action de plusieurs molécules antirétrovirales. Des recherches et des essais cliniques sont actuellement menés pour déterminer le potentiel de simplification de ces thérapies chez les personnes y répondant efficacement afin que celles-ci passent, par exemple, de trois à deux médicaments ou puissent interrompre temporairement leur traitement ou via le test de médicaments à action prolongée, injectés une fois par mois tout au plus.

La première génération d'antirétroviraux était souvent responsable d'effets secondaires, parmi lesquels : nausées, vomissements, fatigue, perte d'appétit, fièvres, diarrhées, réactions cutanées. Il est à espérer que les médicaments de nouvelle génération, s'ils sont administrés précocement après l'infection, permettent une vie normale. Des effets secondaires à long terme, de type prise de poids ou inflammation, ne sont toutefois pas à exclure.

Il est recommandé d'initier le traitement le plus tôt possible suite à l'infection. Ceci permet de garder le système immunitaire le plus intact possible, de réduire l'inflammation chronique induite par l'infection et aussi de limiter le risque de transmission du VIH. Malheureusement, la plupart des infections par le VIH ne sont détectées qu'après plusieurs années, et 60 % seulement des personnes infectées à l'échelle mondiale ont accès au traitement.

Un contrôle puissant du virus observé dans de rares cas

Une infime partie des individus vivant avec le VIH (moins de 1 %) résistent spontanément à l'infection. Chez ces personnes infectées, le virus n'est présent dans l'organisme qu'à des niveaux très faibles, souvent inférieurs au seuil de détection dans le sang. Ce contrôle spontané est souvent associé à un fond génétique particulier, correspondant à des gènes HLA spécifiques qui autorisent des réponses en cellules T CD8+ anti-VIH très fortes.

Certains individus contrôlent aussi le virus après un traitement. Ils ont généralement commencé leur traitement très précocement, c'est-à-dire quelques semaines seulement après leur infection par le VIH. Cinq à 10 % des populations caucasiennes traitées précocement pourraient présenter ce type de contrôle post-traitement. Ces personnes sont en état de rémission du VIH.

De très rares personnes sont même résistantes à l'infection. Cette résistance est communément conférée par une mutation survenue dans un gène codant pour le co-récepteur du VIH : le " CCR-5 " des lymphocytes.

Il a été observé et décrit des cas de " couples paradoxaux " (c'est-à-dire des couples " sérodiscordants ") dans lesquels, sans qu'on puisse se l'expliquer, le partenaire séronégatif n'est pas infecté par le partenaire séropositif. De même, certaines prostituées qui n'adoptent pas de conduites préventives et certains enfants nés de mères infectées présentent un risque d'exposition au VIH tout en restant séronégatifs. Les raisons de cette absence d'infection ne sont pas totalement élucidées.
Prévention
Il n'existe encore aucun vaccin efficace contre le VIH. Cependant, différentes méthodes de prévention peuvent servir d'outils de réduction du risque de transmission, à l'instar de la prévention par les traitements appelée TasP (Treatment as Prevention). En effet, un traitement antirétroviral efficace rend le virus indécelable dans le sang, ce qui limite considérablement le risque de transmission.

En outre, la prophylaxie pré-exposition (ou PrEP) est un médicament de prévention de l'infection par le VIH particulièrement efficace lorsque sa prescription est scrupuleusement respectée. La PrEP réduit d'environ 99 % le risque de contracter le VIH lors de rapports sexuels et d'au moins 74 % celui de le contracter lors d'injections de drogue.

Épidémiologie

Une émergence dans les années 1980

Le sida a été décrit pour la première fois en 1981. Cependant, grâce à des études rétrospectives sur des sérums zaïrois, un virus VIH de 1959 a pu être identifié. D'autres études ont montré que le VIH circule chez l'Homme depuis plus longtemps que cela, depuis la fin du 19 e siècle probablement.

Les VIH ont un réservoir animal. Au moins quarante espèces de singes africains (dont les chimpanzés, gorilles, singes verts, mangabeys, mandrills et cercocèbes) sont naturellement infectées par des rétrovirus proches du VIH : ce sont les virus de l'immunodéficience simienne (SIV). L'infection ne provoque pas de sida chez certaines de ces espèces. Les virus circulant parmi une partie de ces espèces de primates africains non humains ont été transmis à l'Homme et ont donné naissance aux VIH des types 1 et 2. Au moins 12 événements de transmissions à l'Homme ont dû avoir lieu.

Il est possible que le VIH ait pu exister dans une population isolée avant de se disséminer en raison de l'urbanisation croissante du monde et de l'augmentation des flux de populations au début du 20 e siècle. Certains variants du VIH se propagent plus facilement, comme ceux du VIH-1 groupe M, responsables de la plupart des cas d'infection par le VIH dans le monde.

Les réservoirs animaux du VIH-1 sont les chimpanzés et les gorilles d'Afrique centrale de l'Ouest. Il est possible que des chasseurs aient été exposés au SIV présent chez ces singes. L'autre virus humain, le VIH-2, est très proche du SIV du mangabey qui vit en Afrique de l'Ouest. Des contaminations de l'Homme à partir de morsures de ce singe auraient pu se produire.

Une diffusion rapide

Le VIH s'est diffusé depuis 1981, année de la découverte de l'épidémie, de l'Afrique au continent nord-américain puis à l'Europe. Les premiers cas ont été signalés aux États-Unis chez des hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes. Puis l'épidémie a été révélée chez les transfusés, les hémophiles et les toxicomanes, démontrant que la voie sanguine était un important facteur de transmission du virus. En Asie, la maladie n'est apparue que vers 1986-1987, d'abord en Thaïlande, puis dans les autres pays du Sud-Est asiatique. La prostitution ainsi que la toxicomanie par voie intraveineuse ont joué un rôle important dans la diffusion de l'infection dans ces pays. La toxicomanie par voie intraveineuse a également favorisé la propagation de l'épidémie dans certaines régions d'Europe et d'Amérique du Nord. La transmission du VIH se poursuit, par ailleurs, chez des hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes et de la mère à l'enfant. Il est cependant à noter que le mode de transmission le plus important dans le monde entier est la voie hétérosexuelle. Selon les estimations, près de 38 millions de personnes sont actuellement infectées.

À l'Institut Pasteur

Dans le cadre de l'étude et de la lutte contre les maladies infectieuses, dont la Covid-19, les recherches sur le VIH / sida demeurent un objectif majeur de l'Institut Pasteur à Paris et du Réseau international des Instituts Pasteur dans les pays les plus affectés par l'épidémie.

Les axes des recherches couvrent la majorité des champs d'investigation prioritaires aujourd'hui :

les mécanismes de multiplication du VIH dans les cellules et les organes,

les mécanismes à l'origine de l'inflammation chronique et de l'immunodéficience,

les réponses immunitaires pouvant contrôler le virus,

les mécanismes de persistance du virus en dépit d'un traitement efficace,

le rôle du microbiome et les modifications métaboliques,

les effets des traitements sur le virus et les réponses immunes,

les facteurs responsables d'une rémission,

le développement de candidats vaccins et de stratégies thérapeutiques de guérison du VIH.

Ces travaux sont réalisés dans le cadre d'un partenariat très étroit avec l'Agence nationale de recherche sur le sida et les maladies infectieuses émergentes (ANRS-MIE) et l'Institut de recherche vaccinale (VRI).
Les équipes de l'Institut Pasteur mobilisées sur le sujet
Unité HIV, inflammation et persistance dirigée par Michaela Muller-Trutwin, dont l'équipe d'Asier Sáez-Cirión

Unité Virus et immunité dirigée par Olivier Schwartz

Groupe Pathogénie virale dirigé par Lisa Chakrabarti

Unité Immunité anti-virale, biothérapie et vaccins dirigée par Marie-Lise Gougeon

Groupe Chimie et biocatalyse dirigé par Sylvie Pochet

Unité Virologie moléculaire et vaccinologie dirigée par Pierre Charneau

Unité Génomique virale et vaccination dirigée par Frédéric Tangy

Groupe Immunité muqueuse et contrôle des infections sexuellement transmissibles (MISTIC) dirigé par Élisabeth Menu

Groupe à 5 ans Réponse humorale aux pathogènes dirigé par Hugo Mouquet

Unité Virologie structurale dirigée par Félix Rey

Unité Rétrovirologie Moléculaire dirigée par Simon Wain-Hobson

Unité Épidémiologie et physiopathologie des virus oncogènes dirigée par Antoine Gessain

Unité Immunité innée (Inserm U1223) dirigée par James di Santo

Unité Biologie cellulaire des lymphocytes dirigée par Andrès Alcover

Unité Imagerie et modélisation dirigée par Christophe Zimmer

Ultrapole dirigé par Jacomine Krjnse-Locker

Unité Bioinformatique évolutive dirigée par Olivier Gascuel

Unité Épidémiologie des maladies émergentes dirigée par Arnaud Fontanet

Centre médical de l'Institut Pasteur dirigé par Paul-Henri Consigny

VIDÉO - VIH vers de nouveaux traitements

Françoise Barré-Sinoussi, professeur à l'Institut Pasteur, prix Nobel de médecine 2008

Près de 35 ans après la découverte du VIH-1, le sida reste un fléau inacceptable qui affecte tout particulièrement les pays et les populations les plus démunis : 37 millions de personnes vivent avec le VIH/sida dans le monde et, en France, on déplore encore environ 6000 nouvelles contaminations par an. Les antirétroviraux permettent maintenant un bon contrôle de la maladie mais pas une guérison. Françoise Barré Sinoussi, prix Nobel de médecine pour la découverte du VIH, nous explique les challenges actuels de la recherche sur ce virus, notamment les nouvelles pistes qui pourraient mener à une guérison.

Chiffre fourni par l'InVS en 2015. http://invs.santepubliquefrance.fr/Dossiers-thematiques/Maladies-infectieuses/VIH-sida-IST/Infection-a-VIH-et-sida/Actualites/Infection-par-le-VIH-et-les-IST-bacteriennes.-Point-epidemiologique-du-29-novembre-2016
Juillet 2021

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Quarante ans après la découverte du VIH-1 par des chercheurs pasteuriens (découverte récompensée en 2008 par le Prix Nobel de médecine), le sida reste un fléau inacceptable. En effet, l'épidémie de VIH sévit toujours et le sida est aujourd'hui une des causes principales de décès dans le monde pour les adolescents et les femmes en âge de procréation.