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Enrico IV, re di Francia, emana un editto che tutela la libertà di culto per gli ugonotti e interrompe momentaneamente le guerre di religione.

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A Roma viene arso vivo il filosofo Giordano Bruno, che si è rifiutato di abiurare i principi fondamentali delle sue teorie. Egli sostiene che l'universo sia infinito, che al suo interno ci siano altre forme di vita e molti altri sistemi solari, che non sia una creazione di Dio, nega l'immortalità dell'anima e sostiene le teorie copernicane sul moto della terra.
La morte sul rogo è la pena che la Santa Inquisizione infligge agli eretici.

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La Repubblica di Venezia vuole essere autonoma anche dal punto di vista religioso, perciò lo Stato della Chiesa si sente spaventato e minaccia scomunica e interdetto, ovvero il divieto di accedere alle sacre funzioni. La repubblica non cede e la Chiesa scomunica la Serenissima. Gli Asburgo di Spagna e d'Austria si schierano con lo Stato Pontificio, mentre l'Inghilterra con la Serenissima. Lo scontro si ferma grazie alla Francia che interviene come mediatrice. Queste alleanze saranno le stesse della Guerra dei trent'anni.

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Le autorità ecclesiastiche, in particolare il cardinale Bellarmino, ammoniscono il fisico Galileo Galilei a non divulgare o difendere le tesi copernicane contro la fede cattolica. Tuttavia Galileo continua ad insegnare e, dopo un processo, nel 1633 viene condannato ad abiurare le sue tesi.

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Papa Gregorio XV istituisce la Congregazione per l'Evangelizzazione dei Popoli, il cui compito è diffondere la fede cattolica in tutto il mondo e incoraggiare e coordinare le forze missionarie.

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Papa Urbano VIII condanna il traffico di indigeni. Questa bolla provoca una reazione tale da parte dei governanti e degli schiavisti da spingere all'espulsione dei Gesuiti dal paese che erano a favore della bolla.

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Durante la Guerra dei trent'anni, scoppiata nel 1618 a seguito della defenestrazione di Praga, la Chiesa si schiera dalla parte degli Asburgo poiché sono cattolici. La guerra finisce con la pace di Vestfalia del 1648 che stabilisce:
• libertà di culto anche per i calvinisti, oltre che per i luterani
• religione di stato rimane quella stabilita dal principe
• terre confiscate ai cattolici prima del 1624 restano dei protestanti

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Durante la ripresa economica, culturale e sociale del XVIII secolo, papa Clemente XI contribuisce istituendo questa congregazione che stabilisce un programma economico e sociale:
• frazionamento dei latifondi
• istituzione agraria
• migliori condizioni igieniche dei lavoratori
• organizzazione del credito agrario
• migliori comunicazioni e commercio.
Il papa scioglie la congregazione nel 1715 a seguito dell’opposizione dei proprietari terrieri.

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Sempre nell'ambito delle riforme del XVIII secolo, papa Pio VI inizia a riorganizzare le finanze creando un primo catasto e semplificando le imposte.

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Anna Göldi è l'ultima donna in Europa giustiziata per stregoneria. La caccia alle streghe è stata una pratica diffusa dal XIV secolo fino a lei, nonostante nel XVIII i casi diventano molto rari.

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Il generale francese Pierre Augereau invade i territori dello stato pontificio e conquista molte città. In seguito Napoleone obbliga papa Pio VI a cedere alla Francia Avignone e altri territori.