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Experimento con moscas:

El primer experimento llevado a cabo en poblaciones de Drosophila melanogaster fue realizado en 1980.

Experimentos recientes, buscaron analizar los patrones de la variación genética a lo largo de una escala evolutiva de más de mil generaciones de moscas; encontrando evidencia de que la selección actúa sobre la variación genética permanente, ya que poblaciones independientes replicadas exhibían una dinámica poblacional-genética similar.

Otro experimento llevado a cabo en Drosophila fue el dirigido por Gabriel Haddad; en este estudio se seleccionaron moscas capaces de completar todas etapas de su ciclo de vida, y de vivir en condiciones de niveles extremadamente bajos de O2 (hipoxia); esto con el fin de identificar (después de 200 generaciones) a aquellos genes que poseían niveles de expresión significativamente diferentes en contraste con moscas naïve.

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Pez andador:

Investigadores de la Universidad de McGill (Cánada) han hecho un experimento con un 'pez andador' africano que respira aire y que "camina" en la tierra: el bichir de Senegal (Polypterus senegulus).

Los científicos seleccionaron un grupo de ejemplares juveniles de estos peces y los forzaron a vivir en condiciones similares a las terrestres durante ocho meses –en un tanque de aproximadamente tres milímetros de agua–. Los resultados indican que estos animales manifestaron cambios anatómicos y conductuales significativos.

Los peces del experimento que se expusieron a condiciones parecidas a las terrestres aprendieron a caminar con mayor eficacia –colocando sus aletas cerca del cuerpo–, llevaban la cabeza más alta y se movían más rápido.

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Lagartijas de Pod Mrcaru:

En la isla de Pod Mrcaru, ubicada en el Mar adriático, fue liberada una población de lagartijas de la especie Podarcis sicula durante 1971. Las lagartijas provenían de la isla Pod kopiste, abundante en insectos (las lagartijas eran insectívoras), sin embargo en la isla de Pod Mrcaru no existe la misma diversidad de insectos, abundan más los arbustos. 36 años después, investigadores de la University of Massachusetts Amherst visitaron la isla para estudiar a las lagartijas introducidas; descubrieron que ante la carencia de insectos, los descendientes de las primeras lagartijas se habían adaptado a comer hojas: desarrollaron una cabeza más grande para dar una mejor mordida (las plantas requieren de mayor fuerza para masticación), su temperamento se tornó más dócil a comparación del de sus hermanos de Pod Kopiste (pues en Pod Mrcaru el alimento es abundante, y no es necesario ser territorial para conservarlo), sus patas se volvieron más cortas al no haber necesidad de correr para cazar. El cambio más sorprendente fue que comenzaban a desarrollar en su tracto digestivo nuevas estructuras (compartimientos para la fermentación del tejido vegetal) comunes en animales herbívoros. Los análisis genéticos confirmaron que estas lagartijas eran descendientes de las introducidas desde Pod Kopiste.

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Experimentos con peces:

Jonh Endler llevó a cabo en 1980 uno de los primeros experimentos de este tipo. Colocó en estanques a varios ejemplares de Poecilia reticulata, machos y hembras; los estanques eran de cuatro tipos: con grava fina en el fondo y con depredadores, con grava gruesa en el fondo y con depredadores, sin depredadores y con grava fina, sin depredadores y con grava gruesa. Los guppys que habitaron los estanques con depredadores mostraron, luego de algunas generaciones, cambios en sus patrones de coloración; aquellos que nadaban en agua con grava fina desarrollaron una coloración poco llamativa y manchas pequeñas, mientras que aquellos que nadaban en agua con grava gruesa desarrollaron manchas grandes, dichas adaptaciones sirvieron para confundir a los depredadores. En los estanques sin depredadores, los guppys machos desarrollaron coloraciones llamativas para atraer a las hembras, independientemente del tipo de grava.

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Evolución dirigida en ratones:

En 1998, el biólogo Theodore Garland Jr. y sus colegas iniciaron un experimento a largo plazo que implicaba la crianza selectiva para hacer que ratones desarrollaran altos niveles de actividad voluntaria en las ruedas.

Los ratones de las cuatro líneas “High Runner” han evolucionado para funcionar hasta casi tres veces el número de revoluciones en marcha en ruedas por día en comparación con las cuatro líneas de control no seleccionadas de ratones.

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Proyecto Tierra:

Tierra es una simulación por computadora desarrollada por el ecólogo Thomas S. Ray a principios de la década de 1990 en la que los programas de computadora compiten por el tiempo (tiempo de la unidad central de procesamiento (CPU)) y el espacio (acceso a la memoria principal). En este contexto, los programas informáticos en Tierra se consideran evolucionables y pueden mutar, autorreplicarse y recombinarse. La máquina virtual de Tierra está escrita en C. Opera en un conjunto de instrucciones personalizado diseñado para facilitar los cambios de código y el reordenamiento, incluidas características como saltar a la plantilla (a diferencia de los saltos relativos o absolutos comunes a la mayoría de los conjuntos de instrucciones).

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Experimentos con bacterias:

Richard Lenski inició en 1988 el experimento de evolución in vivo más famoso, el proyecto LTEE (Long-term Experimental Evolution), que estudia 12 cultivos de la bacteria Escherichia coli.

En concreto, se han secuenciado los genomas completos de dos bacterias de cada una de las 12 poblaciones de bacterias tras 500, 1.000, 1.500, 2.000, 5.000, 10.000, 15.000, 20.000, 30.000, 40.000 y 50.000 generaciones. La mutación en el gen araA se seleccionó porque confiere la capacidad de crecer en L-arabinosa (un monosacárido de cinco carbonos que se usa mucho como fuente de carbono en cultivos bacterianos porque facilita la expresión de la GFP que se usa como marcador).

Dado que las condiciones ambientales estaban muy controladas durante el experimento, se ha observado una reducción del genoma en el tiempo, generación a generación; en concreto, el genoma medio se ha reducido en 63 kb (~1,4 %).

Lo importante de este estudio no son los detalles, sino el debate entre neutralismo y seleccionismo en la evolución molecular.

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Experimentos con zorros:

A finales de la década de los 50, un genetista llamado Dimitri K. Belyaev intentó crear una población de zorro doméstico. A través del trabajo de un programa de cría en el Instituto de Citología y Genética en Novosibirsk, en Rusia, trató de trazar el camino evolutivo de los animales domésticos.

Belyaev murió en 1985, pero el proyecto está todavía en curso. Ahora es supervisado por Lyudmila Trut

En primer lugar, Belyaev y Trut viajaron a varias granjas de pieles en la Unión Soviética, desde Siberia a Moscú y Estonia. Allí, eligieron ejemplares de la especie zorro plateado (vulpes vulpes) para formar su propia granja en Novosibirsk.

Los zorros nunca fueron entrenados para convertirse en seres dóciles y amigables. Vivían en jaulas y tenían un contacto mínimo con los seres humanos. El objetivo de Belyaev era la creación de una población genéticamente distinta.