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L'élevage bovin a également un impact important sur les émissions de plusieurs gaz à effet de serre. A l'échelle mondiale, la conversion de terres en pâturages est responsable de 9% des émissions mondiales de CO2, d'après le rapport de la FAO. Les éructations du bétail produisent également 37% des émissions mondiales de méthane, un gaz dont le potentiel de réchauffement global est 23 fois supérieur à celui du CO2. Enfin, le stockage et l'épandage de fumier sont également à l'origine de 65% des émissions d'oxyde nitreux, considéré comme le gaz à effet de serre le plus puissant.

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Beaucoup d’animaux signifie beaucoup de nourriture

Le modèle d'élevage industriel « croissance rapide, rendement élevé » est très peu efficace, car il utilise des quantités considérables de céréales et de soja riche en protéines pour répondre aux besoins en aliments des animaux. Les cultures de céréales reçoivent d'importantes quantités de pesticides et d'engrais riches en azote et en phosphore pour stimuler leur croissance, mais une grande partie de ces produits peut se retrouver dans les sols et les nappes phréatiques.

Beaucoup d'animaux signifie beaucoup de déchets

Les animaux d'élevage produisent chaque jour de grandes quantités de déchets riches en azote et en phosphore. Ceci peut être une bonne chose : les déchets d'origine animale peuvent servir de fumier et reconstituer le sol de certains nutriments. Mais si ces déchets ne sont pas correctement gérés et éliminés, et cela arrive, ils se retrouve dans la nature.

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Les Hommes ont longtemps utilisés des farines animales (farine d’os, de viande et même des sangs,…) pour nourrir leurs élevages. Cependant cette pratique engendra des maladies telles que la vache folle qui fut transmise à l’Homme et nommée la maladie de Creutzfeldt-Jakob. Elle fut donc interdite en 1996. Mais à partir de 2011 Conseil national de l'alimentation (CNA) a donné son aval pour une réintroduction de la farine animale.