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L'expression « deep web » est régulièrement utilisée dans les médias pour parler de sites web dont le contenu ou les services seraient choquants ou illégaux3,4,5. Les médias ne parlent alors plus seulement de sites cachés ou invisibles au sens technique du référencement par les moteurs de recherche mais dans un sens plus social pour évoquer leur faible visibilité. La confusion est régulière y compris dans la presse généraliste comme en juillet 2017 lorsque certains journaux 6,7 reprennent une information de l'Agence France Presse et définissent de manière erronée le deep web comme étant « seulement accessible au moyen de réseaux spécifiques». La confusion avec le dark web est parfois complète comme dans un article publié en mars 2017 sur rtl.be où l'on peut lire que « le deep web se trouve [...] sur un autre réseau, parallèle à internet. Les adresses URL des sites se terminent par .onion [...] »8 ce qui ne correspond qu'au dark web et plus précisément à Tor. Ressources profondes

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En 2001, Michael K. Bergman invente le terme deep web comme un terme du vocabulaire des moteurs de recherche2. Ce terme est construit par opposition au web surfacique ou web référencé. Il représente la partie de la toile qui n'est pas référencée par les moteurs de recherche généralistes (certains moteurs, tels que BASE, prennent en compte cette partie du réseau). Le deep web décrit un fait technique indépendamment du contenu. Tous les sites web peuvent contenir des pages dans le deep web. On y trouve notamment les webmails, les banques en ligne, les sites dont une partie est payante et plus généralement tous les sites qui contiennent du contenu visible en fonction de l'utilisateur (voir Raisons de la non-indexation)