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Nous allons chercher à comprendre comment l'ibuprofène peut diminuée une réaction inflammatoire. Pour cela, nous avons utiliser le logiciel RASTOP pour effectuer la comparaison des molécules d'ibuprofène et d'acide arachidonique.

Tout d'abord, nous savons qu'une réaction inflammatoire est causée par le complexe substrat et enzyme. L'enzyme doit rentrer en contact avec le substrat qui lui est spécifique pour formée un complexe enzyme-substrat. Cette liaison avec la molécule de substrat est suivi de la libération des produits de la libération (site actif)

On constate que la molécule d'ibuprofene se fixe sur l'acide aminé 120 de la COX et de ce fait interagit cccccccccccccccccccccccccccc

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Sur la modélisation de l'ibuprofène (substrat), on observe que les acides aminés qui constituent l'enzyme COX se lient sur le substrat.
Sur la modélisation de l'acide arachidonique (substrat) les acides se lient également sur le substrat.
On remarque alors en comparant les deux modélisations que les acides aminés de l'enzyme COX ont une disposition semblable et le même mode d'action (emboîtement sur le substrat). Donc on en déduit que l'ibuprofène fonctionne comme l'acide arachidonique sauf qu'au lieu de provoquer la production de prostaglandine il la bloque.

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Grâce au logiciel rastop, nous avons pu observer l'action d'en l'ibuprofene. On sait que lors de la réaction inflammatoire, l'acide arachidonique se greffe aux récepteurs, ce qui permet à la réaction de se poursuivre. On a observé que l'ibuprofene se greffe lui aussi aux mêmes récepteurs. L'acide arachidonique ne peut donc pas se greffer puis ce que la place est déjà prise. Sans cela la réaction inflammatoire ne peut pas continuer. La réaction inflammatoire est donc bien diminué par l'ibuprofene.

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Action de l'ibuprofene Margaux et Élise 

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Action de l'ibuprofene Margaux et Élise 

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Grâce à nos 2 modélisations de IBP 701 et ACD 700 faite sur RASTOP, on observe que l'ibuprofène prend la place de l'acide arachidonique au niveau de l'acide aminé 120,530 et 385.

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Nous pouvons constater que l'acide arachidonique et l'ibuprofène fixés sur l'enzyme COX ont quelques différences mais ils se ressemblent. L'ibuprofène correspond aux sites actifs de l'enzyme COX et peut se fixer dessus. L'ibuprofène peut alors diminuer une réaction inflammatoire car vu qu'il est fixé sur l'enzyme COX, il empêche l'acide arachidonique de se fixé et donc de produire de la prostaglandine qui est un médiateur chimique, un des éléments responsable de la réaction inflammatoire.

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D'après les deux modélisations réalisées on voit que les substrats d'acide arachidonqiue et d'ibuprofène se placent sur les trois sites actifs du complexe enzymatique COX. Or on sait que lorsque l'acide arachidonique se place sur la molécule COX cet embriquement produit de la prostaglandine mediateur chimique de l'inflammation qui met en place la réaction inflammatoire donc l'ibuprofène en prenant sa place sur l'enzyme empêche l'emboitement de l'acide arachidonique et donc la production de prostaglandine ainsi il empêche l'inflammation.

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Sur RASTOP, on voit que, dans le complexe enzyme / substrat de l'enzyme COX, le substrat Ibuprofène prenait la place du substrat acide arachidonique.

On sait que la reconnaissance du substrat acide arachidonique par la chaîne A de l'enzyme COX implique la réaction inflammatoire.
On sait également que certaines molécules ont la capacité de prendre la place d'autres molécules dans les complexes enzyme / substrat, pouvant, parmi d'autres effets, rendre l'enzyme inactive.

Ainsi l'ibuprofène, en prenant la place du substrat acide arachidonique dans le complèxe enzyme / substrat de l'enzyme COX, empêche la reconnaissance dudit substrat par la chaîne A de l'enzyme COX

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Complexes COX IBUPROFENE et COX acide arachidonique 

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Complexes COX IBUPROFENE et COX acide arachidonique 

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Modélisation mode coloriage chaînes, les 2 complexes révèlent la présence de l'enzyme COX bleue associée soit à l'ibuprofene soit à l'acide arachidonique