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Il continente ha una forma triangolare ed é completamente circondato dal mare ad eccezione di una piccola zona in corrispondenza dell'istimo di Suez.
A nord è bagnato dal Mar Mediterraneo, a est dal mar Rosso e dall'Oceano Indiano a ovest dall'Oceano Atlantico.

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Le maggiori altitudini dell'Africa si trovano in prossimità della Rift Valley: si tratta del Kilimangiaro, del Kirinyaga, Monte Kenya e delle cime più alte della Catena del Ruwenzori.
Kilimangiaro e Kirinyaga sono vulcani spenti e sulle loro cime si trovano ghiacci perenni.
A ovest c'è un altro vulcano inattivo dal 2000: il Camerun e si trova anche la catena dell'Atlante.
Nella parte settentrionale del continente, dall'Oceano Atlantico fino al Mar Rosso, si estende il deserto del Sahara, il più vasto deserto del mondo (9.000.000 km²); la sua superficie è principalmente pianeggiante, ma vi si trovano anche rilievi.

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Le coste sono spesso scoscese e rocciose, con rilievi che arrivano fino al mare. Coste pianeggianti, basse e sabbiose e spesso desertiche, si trovano in Libia,Egitto,Mauritania, Somalia e Namibia.
Lungo le coste del Golfo di Guinea e del Mozambico si sviluppano paludi, acquitrini e banchi sabbiosi.
L'unica isola di grandi dimensioni è il Madagascar, la quarta più grande del mondo; oltre ad essa si trovano arcipelaghi di piccole isole sia nell'oceano Atlantico, sia nell'oceano Indiano.Presso la costa della Tanzania si trova l'isola di Zanzibar, la maggiore dopo Madagascar.

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Il clima del continente africano è generalmente caldo, anche se ci sono variazioni notevoli a seconda delle zone. L'estrema parte settentrionale del continente ha un clima mediterraneo, con estati secche e inverni umidi.
Questo tipo di clima si trova anche nella parte più meridionale dell'Africa, presso Città del Capo. Il resto del Nord Africa presenta un clima desertico o semidesertico, mentre avvicinandosi all'equatore il clima si fa tropicale e quindi molto umido:è  proprio qui che si registra il massimo di precipitazioni annuali.

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Il principale fiume africano è il Nilo che, con il suo affluente Kagera, è tradizionalmente considerato il fiume più lungo del mondo (6.671 km) davanti al Rio delle Amazzoni.
Le sue sorgenti sono nell'Africa equatoriale, da cui provengono i due rami principali: il Nilo Azzurro e il Nilo Bianco.
Il Nilo attraversa l'Africa nord-orientale e quando raggiunge il Mediterraneo sfocia con un'ampia foce a delta.
Il fiume è molto conosciuto per il limo, che rendeva fertile la distesa sahariana e che consentì lo sviluppo della civiltà egizia; per questo motivo l'Egitto veniva anticamente chiamato "dono del Nilo".
Per quanti riguarda i laghi,una lunga catena corre lungo la frattura tettonica della Rift Valley e i più importanti sono il Lago Vittoria e il Lago Tanganica.

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L'Africa presenta una grande varietà di ambienti ed ecosistemi, molti dei quali sono unici al mondo.
La parte settentrionale del continente è occupata in gran parte dal gigantesco deserto del Sahara, mentre a sud di questo, l'ambiente predominante è la grande savana.
Nella zona equatoriale vi sono invece le grandi foreste tropicali, estese anche su buona parte della zona del golfo di Guinea.
Un'estesa foresta pluviale occupa anche la parte orientale del Madagascar, per il resto ricoperto da savane. Paesaggi tipicamente di alta montagna si trovano nell'Acrocoro Etiopico.