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A principios del siglo XIX se acumularon muchas pruebas sobre la química inorgánica, pero se sabia muy poco sobre la química orgánica.

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Es una corriente de pensamiento, en la cual los compuestos orgánicos  solo podían existir y ser sintetizados por organismos vivos, los cuales imprimían su fuerza o esencia vital a dichos procesos.

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Fue un químico sueco, considerado uno de los padres de la química moderna, y  el principal defensor del vitalismo. Ideo el moderno sistema de notación científica y es reconocido por haber sido el primer analista del siglo XIX.

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Fue quien contribuyó en mayor medida a derrumbar el vitalismo.
En 1828 descubrió que al calentar una solución acuosa de cianato de amonio, una sal inorgánica, se producía urea, compuesto orgánico presente en la orina de algunos animales. Esto mostraba que era posible sintetizar compuestos orgánicos sin la intervención de seres vivos.

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Unos años mas tarde se demostró que extractos
de células muertas podían generar reacciones orgánicas, con lo cual se habían descubierto las enzimas.

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Propuso que los compuestos orgánicos se estructuraban sobre un esqueleto básico de átomos de carbono, en el cual se insertaban átomos de otros elementos. El aporte más importante de Kekule fue el elucidar la estructura del benceno, compuesto de gran importancia, industrial y bioquímica.

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En las primeras décadas del siglo XX, surge la bioquímica como rama de la química encargada del estudio de los compuestos y los procesos de tipo orgánico.

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En 1944 se descubre que los genes son fragmentos de ácidos nucleicos y que éstos constituyen el código de la estructura química de los seres vivos.

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En 1953 descubren la estructura tridimensional del ADN.

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Hoy se admite que el rasgo común entre los compuestos clasificados como orgánicos es que todos ellos contienen el elemento carbono. En consecuencia, la definición moderna de química orgánica es la de química de los compuestos del carbono.