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Capacité à comprendre et exploiter les représentations des données telles que présentes dans les figures des articles de recherche (boxplot, clustering, heatmap)

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Capacité à proposer un schéma expérimental permettant de répondre à une question scientifique, incluant la capacité à identifier et proposer des contrôles expérimentaux

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Capacité à générer une analyse structurée des résultats

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démarche autour de l'intégrité scientifique

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démarche autour de l'intégrité scientifique

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Capacités à comprendre les informations relatives aux analyses statistiques associées aux données présentées dans les figures d'article de recherche

# data[].attributes.headline
comprendre une démarche scientifique et la présenter

# data[].attributes.subject
comprendre une démarche scientifique et la présenter

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Capacité à analyser (extraire l'information présentée) et à interpréter (proposer des hypothèses permettant d'expliquer les informations présentées).

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différencier description de résultat et interprétation

# data[].attributes.subject
différencier description de résultat et interprétation

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être capable de comprendre et restituer les infos d'un article scientifique dans le domaine des sciences de la vie 

# data[].attributes.subject
être capable de comprendre et restituer les infos d'un article scientifique dans le domaine des sciences de la vie 

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Communiquer des "informations" scientifiques (orale et écrite)

S'approprier les méthodologies des bases utilisées en sciences de la vie

Compétences linguistiques (anglais) et informatiques

# data[].attributes.body
capacité à lire un papier, l'analyser d'une façon critique et le présenter. Commencer à acquérir des compétences d'analyse de données scientifiques (stat, graphes, programmation??). Structurer leur approche scientifique.

# data[].attributes.headline
Sur la base du référentiel de compétences partagé

# data[].attributes.subject
Sur la base du référentiel de compétences partagé

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C3.1 : Extraire et questionner des informations pertinentes d’un document scientifique...

Fournir une formation de base sur la manière typique dont les articles scientifiques sont structurés.

C1.4 : ... analyser des données scientifiques.

C3.2 : Structurer et présenter des données et concepts scientifiques à des spécialistes ou à des néophytes

Il y a selon moi un travail de base à faire sur l'analyse de doc à l'écrit comme à l'oral : identifier l'obj d'une exp, décrire de façon rigoureuse en prenant en compte les ctrl, conclure sans extrapoler. Proposer un modèle simple.

C3.3 : Argumenter les choix méthodologiques et les interprétations d’une étude

À niveau M1 dans le socle, au moins être capable d'argumenter les choix méthodologiques.

C2.2 : Synthétiser et structurer un état de l’art sur une problématique définie, en autonomie, dans un contexte lié à la recherche scientifique et/ou recherche & développement.

Capacité à chercher, regrouper des informations sur un sujet et les structurer.

# data[].attributes.headline
présenter une question scientifique à l'oral et l'écrit

# data[].attributes.subject
présenter une question scientifique à l'oral et l'écrit

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analyser des résultats /données bruts

synthétiser et intégrer les message d'un article scientifique

développer un esprit critique

avoir une démarche scientifique

maitriser les techniques de biologie génétique...

Communiquer ses résultats à l'oral et l'écrit

mobiliser ses connaissances transdisciplinaires pour répondre à une question scientifique

savoir travailler en équipe

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Capacité à intégrer des données de nature différentes (pluridisciplinarité)

# data[].attributes.headline
Je laisse ça aux responsables de mention :-)

# data[].attributes.subject
Je laisse ça aux responsables de mention :-)

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Pour les normaliens :

1) Concevoir et donner une présentation orale didactique

2) Etre capable d'analyser un article (renforcement)

3) Etre capable de concevoir un poster (renforcement)

4) Savoir utiliser différents outils informatiques appliqués à la biologie (renforcement)

5) Savoir concevoir un protocole expérimental (quelle méthode, quels contrôles, validation statistique...)

# data[].attributes.headline
génétique et biochimie/biocell (plus intégré) 

# data[].attributes.subject
génétique et biochimie/biocell (plus intégré) 

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les parties biochimie et biologie cellulaire sont difficiles à différencier pour les étudiants

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Connaissances solides sur les mécanismes moléculaires fondamentaux couvrant les aspects en lien avec le dogme central, le cycle cellulaire, principes de base de la régulation (incluant la signalisation) avec une vision évolutive incluant bactéries, archées, eucaryotes

# data[].attributes.body
dans chaque discipline, aborder au moins une fois une thématique microbiologie

discipline : génétique, biochimie, génomique, immunologie, un peu de biologie cellulaire

# data[].attributes.headline
base de statistiques pour mieux interpréter les figures

# data[].attributes.subject
base de statistiques pour mieux interpréter les figures

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Un peu de biostatistiques (tests de base, analyses de corrélation)

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Un de peu de bioinformatique avec utilisation de R

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Initiation aux approches globales dont NGS, transcriptome, protéome

# data[].attributes.body
Physiologie bactérienne

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Il faut que les différentes disciplines soient abordées au niveau des concepts fondamentaux de base (pas catalogue d'exemples). Au besoin, être capable d'aller chercher les infos par soi-même dans la biblio.

Méthodes centrales associées aux différentes disciplines.

# data[].attributes.body
Avoir une assise solide dans sa mention, mais aussi quelques connaissances dans les domaines des autres mentions.

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bio informatique

# data[].attributes.body
avoir des bases concernant toutes les disciplines du socles être trop pointu : bio cell GG et BB

plus de temps consacré aux techniques

Transdisciplinarite

statistique

# data[].attributes.body
Des notions et des méthodes de génétique, bioch, bio cell et mol, programmation, bioinformatique, stat. A ces ingrédients fondamentaux, rajouter un brin de Neurosciences pour bien accrocher les étudient.e.s. Pour cela, on pourrait prendre des données des Neuro dans les disciplines fondamentales citées dessus et/ou organiser des conférences en Neuro....

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1 examen écrit unique intégrant tous les aspects (3 examens écrits sur chaque partie c'est très lourd et laisse penser que les disciplines ne sont pas intégrables/interconnectées).

# data[].attributes.headline
fusionner biochimie et biocell pour l'examen final pour ne garder que deux examens au lieu de trois

# data[].attributes.subject
fusionner biochimie et biocell pour l'examen final pour ne garder que deux examens au lieu de trois

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Un projet transdisciplinaire (vraiment transdisciplinaire -> Plus que les 2 thèmes actuels -> Y mettre l'ensemble des disciplines du socle + peut-être ajouter plus d'ouverture sur les autres disciplines avec analyses bioinfo/computationnelles, biophysique, etc.)

# data[].attributes.body
Examens écrits pour la majeure partie de la note

Contrôle continu (QCM en amphi, type wooclap)

Reprendre le poster + oral sur un article scientifique

# data[].attributes.body
Conserver le rendu d'un travail d'initiation à l'analyse de données sur ordinateur (TD actuel de génétique sur ordinateur) ?

# data[].attributes.headline
garder l'oral du projet transdisciplinaire (important pour eux de présenter)

# data[].attributes.subject
garder l'oral du projet transdisciplinaire (important pour eux de présenter)

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Distinguer l'évaluation des connaissances spécifiques (qui peut se faire indépendamment pour chaque sous-discipline et l'évaluation des savoir faire analytiques (sur un sujet plus intégratif).

Évaluer l'oral et l'écrit

Vérifier l'alignement pédagogique entre activités pédagogiques proposées et évaluations.

# data[].attributes.body
analyse d'un article avec interprétation des résultats

au moins une présentation orale

évaluer les connaissances disciplinaires (sous forme de synthèse)

# data[].attributes.headline
Confronter les étudiants à un article scientifique et faire une restitution un peu comme pour un journal club. 

# data[].attributes.subject
Confronter les étudiants à un article scientifique et faire une restitution un peu comme pour un journal club. 

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Majoritairement en control continu

A l'oral et à l'écrit, seul et en équipe

Répondre à une question très transversale et demander aux étudiants d'y répondre (ex: qu'est-ce qu'un gène?).

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Plusieurs possibilités: 1) un examen final unique sur un papier scientifique en posant des questions sur le papier et sur les enseignements. 2) en CC l'écriture d'un projet sur un sujet donné, le poster qui existe déjà est très bien aussi...3) Examens finaux pour chaque discipline, mais il faudrait peut-être changer cette modalité un peu rigide et ne pas cloisonner les concepts...d'ailleurs pour moi c'est ça le socle: montrer que les différentes disciplines sont liées et pas 'séparées'...

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proposition de TP biochimie/biocell autour de l'analyse d'image à la place du CC?

# data[].attributes.subject
proposition de TP biochimie/biocell autour de l'analyse d'image à la place du CC?

# data[].attributes.body
plus de pratique évaluées sur toutes les discipline

repenser les CC

conserver le poster

outil porte folio a renseigner par les étudiants

anale

envisager des évaluations transdisciplinaires sur les compétences commune

répartir les compétences sur les 3 discipline

énoncer les compétences aux étudiants

plus d'oral

plus de travail en groupe

plus de feedback

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besoin de plus de TD car meilleur présence et plus d'interactivité 

# data[].attributes.subject
besoin de plus de TD car meilleur présence et plus d'interactivité 

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Plus de TD

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cours, TD, TP, Approche par problème (?)

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Eventuellement ajouter des supports pédagogiques en ligne (courtes notes de synthèse) auxquelles faire référence - Par exemple un document explicitant la démarche de l'analyse (donner les codes)

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changer les TD une année sur deux (2 jeux de polycopiés)

# data[].attributes.subject
changer les TD une année sur deux (2 jeux de polycopiés)

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Favoriser le travail de groupe, l'interactivité, l'évaluation par les pairs, le travail sur projet, le débat éventuellement...

Y compris pour les cours magistraux. Certains cours peuvent être préparés en amont pour favoriser le questionnement, placer les étudiants en position active vis à vis de l'acquisition des connaissances.

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Cours magistraux

Des cours-TD de méthodologie comme "comment lire et analyser un article", "comment préparer et donner une présentation orale", "comment élaborer un poster", etc...

Moins de TD d'exercices

Quelques TP sur les outils informatiques

# data[].attributes.headline
utilisation whooclap ou ce genre d'outils

# data[].attributes.subject
utilisation whooclap ou ce genre d'outils

# data[].attributes.body
Plus de TD sur ordinateur (mais peut-être sans compte-rendu car lourd à corriger...).

# data[].attributes.body
Pour certains enseignements il faudra sans doutes des CM mais pas que...j'aimerais que les étudiant.e.s soient un peu plus protagonistes de leur formation. Pour cela, nous pourrons promouvoir des travaux en mini-groupes où ils/elles développent leurs idées. J'aime aussi qu'elles/ils fassent des TP sur ordinateur pour l'analyse d'images et/ou de donnés

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trouver un moyen pour augmenter l'assiduité (gros soucis) note participation? présence?

# data[].attributes.subject
trouver un moyen pour augmenter l'assiduité (gros soucis) note participation? présence?

# data[].attributes.body
correction d'ancien examen (sous forme de TD ou en travail perso à rendre)

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Enseignement intégré, classes inversées, travail en autonomie tutoré, en mode projet

# data[].attributes.subject
Enseignement intégré, classes inversées, travail en autonomie tutoré, en mode projet

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Moins de cours magistraux

Idéalement, ce serait bien que les enseignants ne soient pas associés à une discipline, qu'il y ait moins de "cloisonnement", que l'enseignement soit beaucoup plus intégré d'un point de vue des disciplines

Eviction des "parties" dans le socle

# data[].attributes.body
feedback

porte folio

pédagogie innovantes (classe inversé)

faire faire des QCM aux étudiants

mode projet

poster

plus de TD

moins de CM

regrouper la signalisation de biochimie avec la biocell

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Donner un article complet (sans abstract) et demander à l'étudiant.e de rédiger l'abstract?